Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EDX4

Protein Details
Accession A0A178EDX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-137PPSAQGCSKRAQKQRPPVRRLPFPLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5.5, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MAGRGRRSVTVNWPALRAAYQRWAWPCFLASAGGSVLDDGDMSRLGHKGSVPGARCISRARLPNAVPPLPAPTRRRIILSSPSSIAWHRQSYLAAFDATSTVAPVRDWPPQPPSAQGCSKRAQKQRPPVRRLPFPLVTASHAAGELIACQAPGIHPSVLRCPVPETAFHSVFLCPPSQRQLHHCCAALPVPAFLTTAGSSPAPPATHVRAASLCSARPSHQKTPISGPLALFPLTTTTTTTAVTLDSHETTPPPLSHSPRESTAASTPISTPVQHAVSPHFGRATKHPSSSSSVSWQRQPHELVARRLPDLDLLFEDTGDCSFPLFPESEQHFLPSPAMAQAASPIDIQTPPRYGSNSPQNQTSALTSALREAEAQAHPELNSSSNHLTPNGFDFSNTRPGMGDRNGSISMLGSSFYGNSGARPISVKDRPRRESNNMGSFAGGMSWGGVSVGSWIRDDIMMTGTSPAPFVNQSPSFHSSSYLPKMEAAFMKDFTCCGLTLASLHDLLQHFEETHANAPAARPSHSAQGGLPMTSAGQPTIAPGQTQGEPAMNTQFGFQPRSGSMSGPRQRLGSISRSNLSTVQDVDSLEDMDMDDINFDTLGPIEETPVQFPVQQTQFNQNQNQLPQLNVNLANTMQNHQGLRTSTPSTPSASQQFNLQNNPTVSSVNTPTLGTIPMQNTHNLTSPESSHPGTPAELDMDFNNFNPMMGMDMGMGMNMNMNMGNGNFGMGAFDNNGTIDQPGKRLFSKQGAGLSQAQLQAALKNYQLGGNDQSELARRLREQQLLNGASIPQFPFPEEVKPFRCPVIGCEKAYKNQNGLKYHKQHGHQNQELLKNDDGTFSIVDPLTSIPYPGTVGMEKEKPYRCEVCGKRYKNLNGLKYHRSHAPHCNPELALQKLGLTGNLQNLQNMQNANVAGAGMGGIDPSMF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.41
4 0.34
5 0.29
6 0.3
7 0.3
8 0.35
9 0.4
10 0.42
11 0.4
12 0.38
13 0.35
14 0.28
15 0.27
16 0.22
17 0.17
18 0.15
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.1
23 0.09
24 0.07
25 0.07
26 0.05
27 0.06
28 0.07
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.13
34 0.14
35 0.17
36 0.21
37 0.28
38 0.28
39 0.33
40 0.37
41 0.37
42 0.38
43 0.38
44 0.4
45 0.39
46 0.44
47 0.43
48 0.46
49 0.47
50 0.53
51 0.57
52 0.52
53 0.47
54 0.4
55 0.43
56 0.41
57 0.47
58 0.44
59 0.43
60 0.48
61 0.49
62 0.52
63 0.48
64 0.49
65 0.51
66 0.52
67 0.48
68 0.44
69 0.42
70 0.41
71 0.38
72 0.38
73 0.34
74 0.32
75 0.29
76 0.29
77 0.3
78 0.29
79 0.31
80 0.26
81 0.21
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.12
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.13
92 0.16
93 0.23
94 0.25
95 0.29
96 0.34
97 0.38
98 0.39
99 0.41
100 0.43
101 0.42
102 0.49
103 0.51
104 0.5
105 0.54
106 0.62
107 0.64
108 0.68
109 0.72
110 0.73
111 0.78
112 0.84
113 0.87
114 0.87
115 0.87
116 0.86
117 0.84
118 0.82
119 0.79
120 0.72
121 0.64
122 0.6
123 0.52
124 0.47
125 0.4
126 0.33
127 0.25
128 0.21
129 0.18
130 0.13
131 0.11
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.11
141 0.1
142 0.12
143 0.14
144 0.21
145 0.25
146 0.25
147 0.24
148 0.25
149 0.28
150 0.28
151 0.29
152 0.29
153 0.32
154 0.32
155 0.32
156 0.3
157 0.26
158 0.27
159 0.26
160 0.22
161 0.16
162 0.18
163 0.24
164 0.26
165 0.29
166 0.35
167 0.42
168 0.46
169 0.49
170 0.47
171 0.41
172 0.4
173 0.39
174 0.35
175 0.27
176 0.2
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.13
181 0.14
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.13
189 0.11
190 0.13
191 0.17
192 0.2
193 0.25
194 0.25
195 0.26
196 0.24
197 0.26
198 0.3
199 0.27
200 0.23
201 0.22
202 0.23
203 0.24
204 0.32
205 0.39
206 0.41
207 0.48
208 0.5
209 0.5
210 0.56
211 0.61
212 0.55
213 0.49
214 0.42
215 0.35
216 0.33
217 0.3
218 0.22
219 0.15
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.15
240 0.18
241 0.22
242 0.26
243 0.32
244 0.36
245 0.37
246 0.37
247 0.41
248 0.36
249 0.34
250 0.31
251 0.28
252 0.24
253 0.21
254 0.19
255 0.2
256 0.2
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.18
261 0.17
262 0.18
263 0.17
264 0.24
265 0.25
266 0.24
267 0.23
268 0.23
269 0.25
270 0.3
271 0.35
272 0.31
273 0.33
274 0.33
275 0.33
276 0.38
277 0.39
278 0.34
279 0.34
280 0.38
281 0.38
282 0.42
283 0.44
284 0.4
285 0.42
286 0.42
287 0.39
288 0.41
289 0.44
290 0.43
291 0.45
292 0.44
293 0.4
294 0.39
295 0.34
296 0.27
297 0.22
298 0.18
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.13
315 0.17
316 0.18
317 0.18
318 0.2
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.13
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.07
327 0.06
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.11
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.17
341 0.17
342 0.24
343 0.32
344 0.37
345 0.36
346 0.38
347 0.37
348 0.35
349 0.35
350 0.29
351 0.2
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.1
369 0.1
370 0.12
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.16
378 0.15
379 0.13
380 0.11
381 0.13
382 0.15
383 0.23
384 0.23
385 0.2
386 0.18
387 0.19
388 0.23
389 0.23
390 0.22
391 0.13
392 0.17
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.11
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.09
411 0.1
412 0.15
413 0.21
414 0.29
415 0.35
416 0.44
417 0.48
418 0.54
419 0.6
420 0.59
421 0.63
422 0.63
423 0.62
424 0.54
425 0.5
426 0.43
427 0.36
428 0.3
429 0.2
430 0.12
431 0.05
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.04
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.11
459 0.13
460 0.14
461 0.19
462 0.23
463 0.23
464 0.23
465 0.23
466 0.2
467 0.23
468 0.26
469 0.22
470 0.19
471 0.18
472 0.19
473 0.19
474 0.19
475 0.17
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.13
480 0.13
481 0.11
482 0.11
483 0.08
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.1
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.11
507 0.11
508 0.12
509 0.13
510 0.13
511 0.18
512 0.18
513 0.19
514 0.16
515 0.21
516 0.2
517 0.17
518 0.16
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.11
533 0.12
534 0.11
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.12
539 0.1
540 0.09
541 0.1
542 0.12
543 0.13
544 0.15
545 0.14
546 0.15
547 0.15
548 0.18
549 0.18
550 0.16
551 0.19
552 0.27
553 0.32
554 0.33
555 0.33
556 0.3
557 0.3
558 0.31
559 0.3
560 0.27
561 0.26
562 0.27
563 0.27
564 0.27
565 0.28
566 0.28
567 0.26
568 0.2
569 0.16
570 0.15
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.12
575 0.11
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.03
588 0.04
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.17
601 0.18
602 0.2
603 0.21
604 0.28
605 0.34
606 0.38
607 0.4
608 0.38
609 0.39
610 0.37
611 0.41
612 0.33
613 0.28
614 0.24
615 0.23
616 0.21
617 0.19
618 0.18
619 0.13
620 0.13
621 0.15
622 0.14
623 0.15
624 0.14
625 0.16
626 0.16
627 0.15
628 0.18
629 0.17
630 0.18
631 0.2
632 0.21
633 0.2
634 0.23
635 0.24
636 0.24
637 0.25
638 0.26
639 0.28
640 0.27
641 0.26
642 0.29
643 0.35
644 0.35
645 0.37
646 0.35
647 0.34
648 0.33
649 0.35
650 0.29
651 0.23
652 0.2
653 0.2
654 0.21
655 0.17
656 0.17
657 0.15
658 0.15
659 0.15
660 0.15
661 0.12
662 0.13
663 0.13
664 0.16
665 0.17
666 0.19
667 0.2
668 0.21
669 0.24
670 0.22
671 0.22
672 0.2
673 0.22
674 0.25
675 0.26
676 0.25
677 0.22
678 0.21
679 0.21
680 0.19
681 0.17
682 0.14
683 0.12
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.13
688 0.13
689 0.12
690 0.14
691 0.12
692 0.11
693 0.1
694 0.1
695 0.09
696 0.08
697 0.08
698 0.06
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.04
704 0.05
705 0.04
706 0.05
707 0.04
708 0.04
709 0.05
710 0.05
711 0.06
712 0.05
713 0.06
714 0.06
715 0.05
716 0.07
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.08
724 0.07
725 0.08
726 0.11
727 0.11
728 0.14
729 0.17
730 0.2
731 0.21
732 0.24
733 0.29
734 0.32
735 0.34
736 0.34
737 0.36
738 0.35
739 0.37
740 0.36
741 0.33
742 0.29
743 0.27
744 0.23
745 0.19
746 0.19
747 0.17
748 0.17
749 0.17
750 0.14
751 0.14
752 0.15
753 0.16
754 0.17
755 0.17
756 0.18
757 0.18
758 0.19
759 0.17
760 0.18
761 0.19
762 0.21
763 0.2
764 0.19
765 0.18
766 0.25
767 0.31
768 0.37
769 0.36
770 0.39
771 0.47
772 0.45
773 0.44
774 0.38
775 0.32
776 0.26
777 0.27
778 0.22
779 0.15
780 0.14
781 0.15
782 0.17
783 0.18
784 0.25
785 0.28
786 0.34
787 0.36
788 0.39
789 0.4
790 0.38
791 0.39
792 0.32
793 0.33
794 0.36
795 0.38
796 0.37
797 0.43
798 0.46
799 0.49
800 0.57
801 0.55
802 0.52
803 0.51
804 0.56
805 0.55
806 0.59
807 0.62
808 0.62
809 0.66
810 0.66
811 0.66
812 0.69
813 0.71
814 0.75
815 0.7
816 0.7
817 0.68
818 0.69
819 0.67
820 0.61
821 0.53
822 0.45
823 0.4
824 0.34
825 0.28
826 0.22
827 0.19
828 0.15
829 0.18
830 0.14
831 0.14
832 0.13
833 0.13
834 0.15
835 0.14
836 0.14
837 0.1
838 0.11
839 0.12
840 0.12
841 0.14
842 0.12
843 0.15
844 0.2
845 0.25
846 0.27
847 0.34
848 0.4
849 0.4
850 0.46
851 0.48
852 0.46
853 0.52
854 0.55
855 0.58
856 0.62
857 0.64
858 0.65
859 0.7
860 0.74
861 0.73
862 0.75
863 0.72
864 0.71
865 0.73
866 0.74
867 0.68
868 0.65
869 0.63
870 0.6
871 0.58
872 0.59
873 0.63
874 0.63
875 0.62
876 0.63
877 0.56
878 0.56
879 0.58
880 0.5
881 0.41
882 0.33
883 0.3
884 0.28
885 0.28
886 0.23
887 0.17
888 0.17
889 0.21
890 0.26
891 0.26
892 0.25
893 0.27
894 0.28
895 0.3
896 0.28
897 0.23
898 0.21
899 0.21
900 0.2
901 0.18
902 0.15
903 0.11
904 0.1
905 0.08
906 0.04
907 0.04
908 0.04