Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ECT9

Protein Details
Accession A0A178ECT9    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MASDKKTSKKSKQPAAKDTKKTNNIKAPLEHydrophilic
255-281EKEVEKVKKEKKVKKVKKGKKAASVSSBasic
360-379ADAPKAKKNHIENRFQRIKPHydrophilic
405-432LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-276KVKKEKKVKKVKKGKKA
412-423GFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MASDKKTSKKSKQPAAKDTKKTNNIKAPLEQIQSFLEQSGEKNAASKLADFEKWEKNGATTKSQDAPEPMDVDDDSDSSGGSSSDSSSDSESEESENESSSDSSSDSDSSSDSSSDSDTEVKTKAKAVTTKKAAANTTSKSSSSASSSSDSSSSSDSSSSSDSSSSDSDSDSDSSSDAEPTKAAAPAPAKPKKTKAASVSSSSASSSSDSDSDSDSSSEDEPANIPLPASDSSDASSDSSSSDSDSDSSSDSESEKEVEKVKKEKKVKKVKKGKKAASVSSSSASSSSESSSESSSSDSSSDSSSDSSSDSDSDSDSDKKTTNTKVERKGSSSDSSATLPAGSPAPTTGNKRKFAGSPTADAPKAKKNHIENRFQRIKPDTVVDPKLASNAYVSYDYADRAHADLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDTAGGKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.9
3 0.9
4 0.89
5 0.89
6 0.89
7 0.89
8 0.87
9 0.85
10 0.84
11 0.8
12 0.76
13 0.71
14 0.67
15 0.64
16 0.61
17 0.51
18 0.44
19 0.39
20 0.36
21 0.32
22 0.25
23 0.19
24 0.15
25 0.16
26 0.19
27 0.19
28 0.17
29 0.19
30 0.19
31 0.21
32 0.21
33 0.21
34 0.2
35 0.22
36 0.24
37 0.26
38 0.31
39 0.35
40 0.36
41 0.38
42 0.34
43 0.33
44 0.39
45 0.39
46 0.4
47 0.35
48 0.39
49 0.41
50 0.42
51 0.41
52 0.36
53 0.37
54 0.33
55 0.31
56 0.27
57 0.23
58 0.21
59 0.2
60 0.18
61 0.14
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.07
66 0.08
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.16
110 0.2
111 0.22
112 0.24
113 0.31
114 0.36
115 0.43
116 0.48
117 0.53
118 0.52
119 0.53
120 0.49
121 0.46
122 0.45
123 0.39
124 0.38
125 0.33
126 0.31
127 0.28
128 0.28
129 0.25
130 0.22
131 0.21
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.17
174 0.26
175 0.31
176 0.33
177 0.36
178 0.41
179 0.46
180 0.48
181 0.5
182 0.46
183 0.48
184 0.48
185 0.49
186 0.46
187 0.39
188 0.35
189 0.29
190 0.23
191 0.16
192 0.13
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.16
245 0.19
246 0.23
247 0.32
248 0.38
249 0.45
250 0.54
251 0.61
252 0.65
253 0.74
254 0.79
255 0.81
256 0.86
257 0.87
258 0.88
259 0.9
260 0.87
261 0.86
262 0.82
263 0.76
264 0.7
265 0.64
266 0.55
267 0.46
268 0.38
269 0.29
270 0.22
271 0.18
272 0.14
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.19
307 0.23
308 0.28
309 0.35
310 0.42
311 0.49
312 0.57
313 0.63
314 0.65
315 0.63
316 0.62
317 0.57
318 0.51
319 0.44
320 0.37
321 0.31
322 0.29
323 0.25
324 0.21
325 0.17
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.09
332 0.13
333 0.16
334 0.24
335 0.33
336 0.39
337 0.43
338 0.45
339 0.47
340 0.47
341 0.48
342 0.5
343 0.44
344 0.4
345 0.41
346 0.44
347 0.42
348 0.41
349 0.4
350 0.38
351 0.39
352 0.4
353 0.43
354 0.47
355 0.56
356 0.63
357 0.7
358 0.69
359 0.75
360 0.8
361 0.73
362 0.71
363 0.66
364 0.61
365 0.54
366 0.51
367 0.47
368 0.45
369 0.48
370 0.42
371 0.38
372 0.34
373 0.34
374 0.3
375 0.23
376 0.17
377 0.15
378 0.16
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.16
393 0.19
394 0.18
395 0.18
396 0.19
397 0.19
398 0.25
399 0.28
400 0.35
401 0.42
402 0.53
403 0.63
404 0.73
405 0.82
406 0.85
407 0.9
408 0.91
409 0.9
410 0.9
411 0.88
412 0.86
413 0.85
414 0.79
415 0.68
416 0.58
417 0.51
418 0.41
419 0.33
420 0.25
421 0.16
422 0.14