Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DND7

Protein Details
Accession A0A178DND7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-88DGNNHGQHKQQRPPPKQQHQQPSSKPPRAKHydrophilic
109-129SPANTNKAKDHKKRRVNLGLAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.999, cyto 6.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039136  NUFIP1-like  
IPR019496  NUFIP1_cons_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10453  NUFIP1  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSFMPTPAGIQSMAAYATQMTSTGDAAPQSSPSYPPSQGHSAPGYSPIQHAGQKRKLHDGNNHGQHKQQRPPPKQQHQQPSSKPPRAKAAVAPPVPSFGFALPPPRVVSPANTNKAKDHKKRRVNLGLAQEPPPDESSSEDENVDEEAAYAEKLKDGGFAFEHGGEYITIRTAADVAEWRRDRRKNFPTQQKIAQKAEEAATRRLGELNFLRKVHGQLPLSRLEAREDNQPNGRDRSKVSKKEYGPEAGKQTELAALRKKLHDSMIRKNTAPTAVDLGLGYGTDTDSGEESSILSESSVVTSSEESEEESESDDDAPPEMSSSKAGPPPVRVPPPAPPPATRSQPRSGKNGICDSWVETGRCRFSNKCKYEHPPKEGMESGRKGLFEVMVEQELLKGDELTLEAIKYLGQNGFLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.08
4 0.09
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.19
20 0.24
21 0.26
22 0.27
23 0.32
24 0.36
25 0.36
26 0.39
27 0.38
28 0.34
29 0.32
30 0.35
31 0.3
32 0.25
33 0.25
34 0.23
35 0.23
36 0.27
37 0.34
38 0.39
39 0.45
40 0.5
41 0.53
42 0.6
43 0.62
44 0.64
45 0.66
46 0.65
47 0.67
48 0.71
49 0.73
50 0.63
51 0.63
52 0.65
53 0.64
54 0.64
55 0.61
56 0.62
57 0.65
58 0.75
59 0.81
60 0.83
61 0.84
62 0.85
63 0.88
64 0.86
65 0.88
66 0.84
67 0.85
68 0.85
69 0.83
70 0.78
71 0.7
72 0.71
73 0.65
74 0.6
75 0.56
76 0.55
77 0.56
78 0.53
79 0.52
80 0.43
81 0.41
82 0.38
83 0.32
84 0.23
85 0.14
86 0.15
87 0.14
88 0.2
89 0.18
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.22
94 0.2
95 0.23
96 0.27
97 0.35
98 0.41
99 0.43
100 0.44
101 0.46
102 0.55
103 0.62
104 0.62
105 0.64
106 0.67
107 0.73
108 0.79
109 0.85
110 0.84
111 0.8
112 0.76
113 0.74
114 0.69
115 0.62
116 0.56
117 0.47
118 0.37
119 0.33
120 0.29
121 0.2
122 0.14
123 0.15
124 0.17
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.13
132 0.08
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.12
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.09
163 0.1
164 0.18
165 0.2
166 0.23
167 0.3
168 0.36
169 0.39
170 0.46
171 0.53
172 0.56
173 0.64
174 0.72
175 0.73
176 0.73
177 0.77
178 0.74
179 0.71
180 0.63
181 0.54
182 0.44
183 0.36
184 0.33
185 0.28
186 0.24
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.18
191 0.19
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.24
199 0.23
200 0.25
201 0.24
202 0.26
203 0.22
204 0.22
205 0.25
206 0.26
207 0.27
208 0.26
209 0.23
210 0.2
211 0.2
212 0.18
213 0.25
214 0.24
215 0.25
216 0.29
217 0.31
218 0.32
219 0.35
220 0.35
221 0.28
222 0.28
223 0.36
224 0.41
225 0.47
226 0.5
227 0.53
228 0.54
229 0.59
230 0.6
231 0.56
232 0.49
233 0.45
234 0.43
235 0.35
236 0.34
237 0.27
238 0.24
239 0.2
240 0.19
241 0.19
242 0.19
243 0.21
244 0.24
245 0.26
246 0.27
247 0.25
248 0.29
249 0.34
250 0.35
251 0.42
252 0.48
253 0.49
254 0.48
255 0.48
256 0.45
257 0.39
258 0.34
259 0.25
260 0.2
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.11
266 0.1
267 0.08
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.09
309 0.11
310 0.15
311 0.18
312 0.22
313 0.23
314 0.28
315 0.33
316 0.4
317 0.43
318 0.41
319 0.41
320 0.45
321 0.51
322 0.53
323 0.5
324 0.44
325 0.46
326 0.5
327 0.56
328 0.54
329 0.53
330 0.55
331 0.61
332 0.62
333 0.63
334 0.64
335 0.6
336 0.6
337 0.61
338 0.52
339 0.46
340 0.43
341 0.39
342 0.37
343 0.37
344 0.31
345 0.28
346 0.33
347 0.36
348 0.37
349 0.39
350 0.39
351 0.46
352 0.56
353 0.58
354 0.58
355 0.62
356 0.69
357 0.76
358 0.79
359 0.76
360 0.73
361 0.7
362 0.7
363 0.66
364 0.63
365 0.61
366 0.55
367 0.51
368 0.45
369 0.43
370 0.37
371 0.34
372 0.29
373 0.2
374 0.2
375 0.19
376 0.17
377 0.18
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.15
382 0.13
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.1
394 0.13
395 0.12