Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E140

Protein Details
Accession A0A178E140    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24GGSQRKKQSATDKQKAKKPLDHydrophilic
367-400AELEKKWAQRNKEKEERRRVQRENIERKRKEKADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-329RREKERLKNGDDPAAANARAKGSKPRVEKRAVK
371-401KKWAQRNKEKEERRRVQRENIERKRKEKADK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARGGSQRKKQSATDKQKAKKPLDGQPKSMVIRIGAQEVGGSVSQLVQDVRHVMEPDTAVRLKERRANKLKDYTTMCGPLGVSHLLLFSRSESGNTNLRLARTPRGPTLHFRVENYSLCKDILKSMRRPRAGADDFQVAPLLVMNNFITSDSERERLGDAAPPKHLEKLVTDMFQGLFPPIQPHTTPLHTIKRVLLLNRDPPSEENGTCTISLRHYAITTKITGVPKALRRLYAAEKLIGSREKKKSALPNLGKLQDVADYMLDPSAAGYTSASDTEADTDAEVEVAAPVRQKVLSRREKERLKNGDDPAAANARAKGSKPRVEKRAVKLVELGPRMKLRLTKVEEDVCGGKVMWHEFVTKSKAEVAELEKKWAQRNKEKEERRRVQRENIERKRKEKADKGEAEGEGEDEDEDEDMADFDEYDLDDDVWQDEADAGEGAGDEDEDEDMEDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.79
3 0.8
4 0.83
5 0.85
6 0.79
7 0.77
8 0.74
9 0.73
10 0.75
11 0.72
12 0.7
13 0.68
14 0.69
15 0.62
16 0.57
17 0.49
18 0.38
19 0.38
20 0.34
21 0.3
22 0.23
23 0.2
24 0.18
25 0.16
26 0.17
27 0.11
28 0.09
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.12
37 0.13
38 0.16
39 0.17
40 0.16
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.24
45 0.23
46 0.21
47 0.25
48 0.27
49 0.29
50 0.35
51 0.41
52 0.46
53 0.55
54 0.62
55 0.66
56 0.73
57 0.7
58 0.71
59 0.69
60 0.62
61 0.57
62 0.53
63 0.44
64 0.35
65 0.32
66 0.25
67 0.22
68 0.19
69 0.14
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.18
81 0.24
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.28
86 0.32
87 0.32
88 0.35
89 0.34
90 0.37
91 0.38
92 0.41
93 0.43
94 0.44
95 0.49
96 0.52
97 0.48
98 0.46
99 0.46
100 0.45
101 0.47
102 0.45
103 0.39
104 0.31
105 0.29
106 0.29
107 0.24
108 0.26
109 0.3
110 0.32
111 0.4
112 0.48
113 0.57
114 0.58
115 0.58
116 0.54
117 0.56
118 0.53
119 0.46
120 0.4
121 0.36
122 0.34
123 0.33
124 0.3
125 0.19
126 0.15
127 0.13
128 0.11
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.19
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.24
152 0.24
153 0.2
154 0.17
155 0.2
156 0.21
157 0.19
158 0.19
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.21
174 0.24
175 0.31
176 0.3
177 0.32
178 0.29
179 0.31
180 0.32
181 0.3
182 0.3
183 0.27
184 0.33
185 0.33
186 0.33
187 0.29
188 0.27
189 0.3
190 0.28
191 0.24
192 0.19
193 0.18
194 0.19
195 0.18
196 0.18
197 0.14
198 0.11
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.16
209 0.16
210 0.16
211 0.17
212 0.19
213 0.22
214 0.27
215 0.27
216 0.23
217 0.24
218 0.27
219 0.29
220 0.3
221 0.27
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.23
227 0.22
228 0.24
229 0.28
230 0.31
231 0.32
232 0.36
233 0.42
234 0.46
235 0.54
236 0.49
237 0.51
238 0.53
239 0.53
240 0.48
241 0.4
242 0.32
243 0.23
244 0.2
245 0.13
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.17
281 0.27
282 0.37
283 0.42
284 0.49
285 0.58
286 0.66
287 0.71
288 0.74
289 0.72
290 0.69
291 0.71
292 0.65
293 0.62
294 0.54
295 0.47
296 0.4
297 0.34
298 0.28
299 0.21
300 0.2
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.24
305 0.29
306 0.36
307 0.44
308 0.51
309 0.56
310 0.64
311 0.7
312 0.68
313 0.71
314 0.64
315 0.56
316 0.53
317 0.51
318 0.49
319 0.45
320 0.39
321 0.32
322 0.33
323 0.33
324 0.3
325 0.29
326 0.26
327 0.32
328 0.37
329 0.38
330 0.41
331 0.43
332 0.41
333 0.4
334 0.37
335 0.28
336 0.24
337 0.19
338 0.16
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.15
343 0.16
344 0.17
345 0.22
346 0.24
347 0.23
348 0.22
349 0.23
350 0.23
351 0.22
352 0.24
353 0.26
354 0.32
355 0.32
356 0.36
357 0.35
358 0.38
359 0.45
360 0.47
361 0.49
362 0.49
363 0.59
364 0.63
365 0.71
366 0.79
367 0.81
368 0.86
369 0.88
370 0.89
371 0.89
372 0.86
373 0.85
374 0.85
375 0.86
376 0.86
377 0.87
378 0.87
379 0.83
380 0.82
381 0.82
382 0.8
383 0.79
384 0.77
385 0.77
386 0.76
387 0.76
388 0.77
389 0.74
390 0.65
391 0.57
392 0.48
393 0.38
394 0.27
395 0.21
396 0.15
397 0.08
398 0.08
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.07
409 0.06
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.05
433 0.06