Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DHX2

Protein Details
Accession A0A178DHX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-53RGDANARRKRQNRLNVRAYRKRKAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-51RRKRQNRLNVRAYRKRK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021833  DUF3425  
Pfam View protein in Pfam  
PF11905  DUF3425  
Amino Acid Sequences MSGRLEVARRQRAPRLAEAQSADDDWTGRGDANARRKRQNRLNVRAYRKRKAEATAGGSAHVGSTTLQPYWVQRPQNIAFLASTTPRDPRAPLLPMDDLAAHSINTVILPLSSDHLITLVQFNVLRGSLTNRHLLDQIDCLNSNLHERFASRDMHTFPNLSARELSLLPPSLHPTLLQRTTSYPHWIDIAPHPAMRDNLIKHLGTFDAHQLWLEIIGGLFEGFSGDERESQGLVMWDTPWTWEGWELSEGFVKKWSWMLEGCEDMMRATNRWRERRGEEALMLEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.64
3 0.57
4 0.56
5 0.53
6 0.48
7 0.42
8 0.37
9 0.3
10 0.23
11 0.2
12 0.15
13 0.14
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.15
18 0.22
19 0.32
20 0.4
21 0.45
22 0.54
23 0.6
24 0.7
25 0.74
26 0.77
27 0.78
28 0.79
29 0.84
30 0.83
31 0.88
32 0.88
33 0.86
34 0.85
35 0.8
36 0.75
37 0.69
38 0.64
39 0.62
40 0.59
41 0.56
42 0.53
43 0.47
44 0.42
45 0.37
46 0.32
47 0.24
48 0.17
49 0.11
50 0.06
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.14
57 0.21
58 0.27
59 0.27
60 0.27
61 0.35
62 0.36
63 0.41
64 0.38
65 0.32
66 0.26
67 0.24
68 0.23
69 0.17
70 0.17
71 0.13
72 0.15
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.2
77 0.23
78 0.24
79 0.24
80 0.26
81 0.24
82 0.23
83 0.23
84 0.19
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.1
115 0.13
116 0.15
117 0.2
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.22
122 0.19
123 0.17
124 0.17
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.14
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.15
139 0.18
140 0.2
141 0.23
142 0.23
143 0.21
144 0.18
145 0.24
146 0.23
147 0.2
148 0.18
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.17
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.15
162 0.19
163 0.22
164 0.22
165 0.19
166 0.21
167 0.24
168 0.26
169 0.27
170 0.22
171 0.2
172 0.21
173 0.2
174 0.21
175 0.21
176 0.25
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.21
183 0.22
184 0.18
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.22
189 0.23
190 0.21
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.06
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.19
236 0.19
237 0.17
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.21
242 0.22
243 0.2
244 0.22
245 0.26
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.25
250 0.24
251 0.21
252 0.24
253 0.21
254 0.19
255 0.24
256 0.32
257 0.4
258 0.48
259 0.53
260 0.55
261 0.59
262 0.65
263 0.65
264 0.62
265 0.55