FuNGI

A0A178E156

Protein Details

Accession

A0A178E156

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-58	NGQQQQLLPARRRRPRPAADPLRKPRRPLQNITRPMVS	Hydrophilic
539-565	EASGNESSRKKQKKNRDKDGSRKSMLK	Hydrophilic
582-608	KSDADRLNKMKKKKERKEKGRILLSGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-48	ARRRRPRPAADPLRKPRRP
294-311	KDKELVKGKEKKDKKSKG
528-533	NKKRPG
544-562	ESSRKKQKKNRDKDGSRKS
588-603	LNKMKKKKERKEKGRI

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, mito_nucl 13, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNGNPPAPVAPNAPAAPAAANGQQQQLLPARRRRPRPAADPLRKPRRPLQNITRPMVSLTQMNETKKPPPGPAGDDSKTKDALRQEYLAQGASTFPLVVTRRDLKELRHHVMRLQSKAPLDITSPDQFTPPIRLHRRDPRAPPSGAGSHFEEEETKEDIEEIKERERIEQQKEVRRKVREENQAKIAPTGTKKPAAFQKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGTYESELSEAHIMLSTSNPQDPHNSAILLAPMERWYRFNVKGKVKATGDDADKEKDKELVKGKEKKDKKSKGIASFLEDREAQAEKRERKAAEAAARPYLSTRVGGGADDEGRIRRIRDDYGDGGYVKQEADADDIDHEDDFADDEEGLNGLFEGEEQDVKAAEEKLKRDQLQASLWERPDEERLQEKEEEERRQAEELRALEKATRKTLAKREKQYEYLDSDPENPYITESESDTDSETERQRAKEEEEKKLAEQNGKAADGANVPSGASTKGSNTPSGNHKPVDLKNKKRPGSPNLSEASGNESSRKKQKKNRDKDGSRKSMLKGAGSGSDSEMTDADKLKSDADRLNKMKKKKERKEKGRILLSGSPSGSPGPSRAGSPSAGSPLSGSRAGSPAAPAKPSIPSAKEIHDSLPPQGMNIQNLIAKFKGRVDKTNSQTFIRLVKAVSSFDKQKSWLTPLEKMPSEEHINTFMNAANAPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.21
3	0.19
4	0.17
5	0.17
6	0.15
7	0.19
8	0.19
9	0.21
10	0.22
11	0.21
12	0.25
13	0.3
14	0.34
15	0.39
16	0.47
17	0.55
18	0.63
19	0.72
20	0.77
21	0.8
22	0.82
23	0.83
24	0.84
25	0.86
26	0.87
27	0.89
28	0.9
29	0.9
30	0.85
31	0.82
32	0.79
33	0.79
34	0.78
35	0.77
36	0.77
37	0.77
38	0.81
39	0.8
40	0.74
41	0.63
42	0.56
43	0.49
44	0.39
45	0.32
46	0.26
47	0.3
48	0.32
49	0.35
50	0.37
51	0.37
52	0.41
53	0.45
54	0.46
55	0.42
56	0.43
57	0.45
58	0.47
59	0.5
60	0.53
61	0.49
62	0.51
63	0.52
64	0.49
65	0.47
66	0.41
67	0.39
68	0.38
69	0.41
70	0.39
71	0.37
72	0.35
73	0.35
74	0.36
75	0.33
76	0.25
77	0.19
78	0.16
79	0.14
80	0.12
81	0.09
82	0.07
83	0.12
84	0.14
85	0.15
86	0.21
87	0.27
88	0.29
89	0.36
90	0.38
91	0.38
92	0.47
93	0.54
94	0.54
95	0.54
96	0.53
97	0.5
98	0.57
99	0.59
100	0.53
101	0.47
102	0.45
103	0.4
104	0.41
105	0.39
106	0.3
107	0.25
108	0.23
109	0.25
110	0.24
111	0.25
112	0.23
113	0.22
114	0.22
115	0.22
116	0.25
117	0.25
118	0.31
119	0.37
120	0.42
121	0.5
122	0.59
123	0.67
124	0.7
125	0.74
126	0.72
127	0.72
128	0.68
129	0.61
130	0.56
131	0.52
132	0.45
133	0.4
134	0.35
135	0.28
136	0.27
137	0.26
138	0.22
139	0.18
140	0.19
141	0.18
142	0.15
143	0.13
144	0.13
145	0.14
146	0.16
147	0.18
148	0.18
149	0.2
150	0.23
151	0.23
152	0.27
153	0.34
154	0.39
155	0.41
156	0.46
157	0.5
158	0.57
159	0.65
160	0.7
161	0.7
162	0.68
163	0.68
164	0.69
165	0.71
166	0.72
167	0.7
168	0.66
169	0.67
170	0.65
171	0.6
172	0.51
173	0.43
174	0.37
175	0.34
176	0.35
177	0.31
178	0.33
179	0.33
180	0.37
181	0.45
182	0.5
183	0.5
184	0.49
185	0.56
186	0.6
187	0.66
188	0.7
189	0.67
190	0.66
191	0.71
192	0.71
193	0.65
194	0.62
195	0.62
196	0.6
197	0.64
198	0.64
199	0.62
200	0.59
201	0.58
202	0.58
203	0.6
204	0.62
205	0.57
206	0.53
207	0.53
208	0.55
209	0.52
210	0.49
211	0.43
212	0.36
213	0.31
214	0.26
215	0.21
216	0.16
217	0.17
218	0.19
219	0.22
220	0.22
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.2
225	0.19
226	0.15
227	0.1
228	0.1
229	0.13
230	0.12
231	0.13
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.09
242	0.09
243	0.11
244	0.12
245	0.12
246	0.16
247	0.17
248	0.19
249	0.18
250	0.17
251	0.16
252	0.15
253	0.15
254	0.12
255	0.1
256	0.08
257	0.09
258	0.1
259	0.11
260	0.11
261	0.14
262	0.19
263	0.25
264	0.33
265	0.39
266	0.45
267	0.52
268	0.52
269	0.55
270	0.5
271	0.46
272	0.41
273	0.37
274	0.32
275	0.28
276	0.28
277	0.25
278	0.26
279	0.26
280	0.23
281	0.23
282	0.22
283	0.24
284	0.3
285	0.35
286	0.42
287	0.5
288	0.54
289	0.59
290	0.65
291	0.69
292	0.72
293	0.72
294	0.7
295	0.72
296	0.75
297	0.72
298	0.73
299	0.64
300	0.58
301	0.55
302	0.48
303	0.4
304	0.32
305	0.25
306	0.2
307	0.2
308	0.16
309	0.16
310	0.23
311	0.24
312	0.28
313	0.33
314	0.31
315	0.32
316	0.36
317	0.34
318	0.34
319	0.35
320	0.33
321	0.31
322	0.31
323	0.28
324	0.25
325	0.22
326	0.16
327	0.11
328	0.1
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.07
338	0.08
339	0.09
340	0.09
341	0.1
342	0.12
343	0.13
344	0.15
345	0.18
346	0.18
347	0.19
348	0.2
349	0.18
350	0.16
351	0.14
352	0.12
353	0.09
354	0.07
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.02
378	0.02
379	0.02
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.07
388	0.07
389	0.11
390	0.14
391	0.16
392	0.22
393	0.27
394	0.28
395	0.3
396	0.31
397	0.3
398	0.3
399	0.33
400	0.31
401	0.3
402	0.29
403	0.27
404	0.25
405	0.23
406	0.24
407	0.2
408	0.19
409	0.22
410	0.23
411	0.26
412	0.26
413	0.26
414	0.3
415	0.34
416	0.35
417	0.31
418	0.31
419	0.29
420	0.3
421	0.31
422	0.25
423	0.24
424	0.22
425	0.21
426	0.19
427	0.18
428	0.19
429	0.22
430	0.24
431	0.22
432	0.24
433	0.25
434	0.31
435	0.41
436	0.48
437	0.52
438	0.58
439	0.62
440	0.63
441	0.66
442	0.63
443	0.58
444	0.53
445	0.46
446	0.39
447	0.33
448	0.31
449	0.27
450	0.24
451	0.2
452	0.15
453	0.14
454	0.13
455	0.13
456	0.11
457	0.1
458	0.11
459	0.1
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.14
465	0.15
466	0.19
467	0.22
468	0.22
469	0.23
470	0.25
471	0.29
472	0.34
473	0.39
474	0.42
475	0.44
476	0.45
477	0.44
478	0.47
479	0.45
480	0.41
481	0.36
482	0.32
483	0.29
484	0.28
485	0.27
486	0.22
487	0.19
488	0.16
489	0.16
490	0.12
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.08
498	0.09
499	0.16
500	0.17
501	0.2
502	0.2
503	0.24
504	0.32
505	0.38
506	0.4
507	0.34
508	0.35
509	0.39
510	0.44
511	0.52
512	0.53
513	0.56
514	0.62
515	0.72
516	0.72
517	0.73
518	0.75
519	0.73
520	0.73
521	0.67
522	0.63
523	0.56
524	0.54
525	0.47
526	0.39
527	0.37
528	0.29
529	0.26
530	0.24
531	0.25
532	0.29
533	0.38
534	0.48
535	0.5
536	0.57
537	0.68
538	0.74
539	0.82
540	0.88
541	0.89
542	0.9
543	0.92
544	0.93
545	0.91
546	0.84
547	0.78
548	0.69
549	0.64
550	0.56
551	0.46
552	0.37
553	0.3
554	0.29
555	0.25
556	0.24
557	0.19
558	0.18
559	0.17
560	0.15
561	0.14
562	0.11
563	0.12
564	0.13
565	0.13
566	0.14
567	0.14
568	0.16
569	0.17
570	0.2
571	0.24
572	0.28
573	0.37
574	0.4
575	0.51
576	0.55
577	0.62
578	0.68
579	0.73
580	0.78
581	0.79
582	0.85
583	0.86
584	0.91
585	0.94
586	0.94
587	0.93
588	0.91
589	0.82
590	0.78
591	0.72
592	0.65
593	0.58
594	0.48
595	0.38
596	0.31
597	0.29
598	0.23
599	0.18
600	0.16
601	0.16
602	0.16
603	0.17
604	0.19
605	0.2
606	0.2
607	0.22
608	0.22
609	0.21
610	0.2
611	0.19
612	0.18
613	0.17
614	0.19
615	0.18
616	0.17
617	0.15
618	0.17
619	0.17
620	0.17
621	0.18
622	0.21
623	0.22
624	0.23
625	0.22
626	0.22
627	0.25
628	0.28
629	0.31
630	0.27
631	0.29
632	0.31
633	0.35
634	0.37
635	0.36
636	0.34
637	0.34
638	0.34
639	0.31
640	0.35
641	0.29
642	0.26
643	0.3
644	0.31
645	0.26
646	0.26
647	0.25
648	0.21
649	0.22
650	0.24
651	0.2
652	0.19
653	0.19
654	0.25
655	0.32
656	0.33
657	0.41
658	0.47
659	0.56
660	0.61
661	0.69
662	0.65
663	0.59
664	0.58
665	0.53
666	0.49
667	0.42
668	0.37
669	0.28
670	0.29
671	0.29
672	0.29
673	0.31
674	0.32
675	0.36
676	0.38
677	0.41
678	0.38
679	0.42
680	0.44
681	0.45
682	0.46
683	0.45
684	0.48
685	0.52
686	0.58
687	0.55
688	0.52
689	0.5
690	0.48
691	0.5
692	0.45
693	0.4
694	0.37
695	0.36
696	0.33
697	0.32
698	0.27
699	0.22

A0A178E156

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer