Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DQE2

Protein Details
Accession A0A178DQE2    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34IPTSADPRSKRPTKKRALTPRTALSNHydrophilic
115-146MEKRDREKTEKNRGKREKARLRKERAKAAKREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-24KRPTKKR
111-150RKAEMEKRDREKTEKNRGKREKARLRKERAKAAKREGSER
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSADPRSKRPTKKRALTPRTALSNQVDALFANPDRPIALPSSTANPSLPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYARLAAMDEEVRREEDEREYAARKAEMEKRDREKTEKNRGKREKARLRKERAKAAKREGSERAETPGVEAVVKRKLVPKEREVGGDDGVENEGGEVKNAEEIGLVIEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.45
4 0.53
5 0.62
6 0.69
7 0.75
8 0.79
9 0.86
10 0.89
11 0.9
12 0.9
13 0.88
14 0.85
15 0.81
16 0.78
17 0.69
18 0.63
19 0.55
20 0.49
21 0.4
22 0.33
23 0.26
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.18
42 0.16
43 0.18
44 0.18
45 0.16
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.04
59 0.03
60 0.03
61 0.04
62 0.04
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.07
67 0.08
68 0.12
69 0.2
70 0.27
71 0.3
72 0.33
73 0.38
74 0.42
75 0.47
76 0.48
77 0.44
78 0.37
79 0.34
80 0.32
81 0.27
82 0.23
83 0.18
84 0.14
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.17
100 0.22
101 0.26
102 0.3
103 0.36
104 0.42
105 0.48
106 0.5
107 0.51
108 0.54
109 0.58
110 0.65
111 0.66
112 0.67
113 0.72
114 0.78
115 0.83
116 0.82
117 0.83
118 0.82
119 0.84
120 0.88
121 0.86
122 0.88
123 0.87
124 0.84
125 0.84
126 0.84
127 0.82
128 0.79
129 0.78
130 0.75
131 0.67
132 0.66
133 0.61
134 0.56
135 0.51
136 0.44
137 0.39
138 0.34
139 0.31
140 0.27
141 0.24
142 0.19
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.18
147 0.19
148 0.19
149 0.24
150 0.31
151 0.4
152 0.47
153 0.49
154 0.52
155 0.54
156 0.56
157 0.53
158 0.47
159 0.39
160 0.33
161 0.27
162 0.2
163 0.18
164 0.14
165 0.11
166 0.08
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.09