FuNGI

A0A178DG40

Protein Details

Accession

A0A178DG40

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-50	AYRAQLSRRLRIVRKKLGRATPKNAKFAP	Hydrophilic
370-394	LTFPPNPPQKPRRPRKDGKEWVERE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-47	RLRIVRKKLGRATPKNAK
378-396	QKPRRPRKDGKEWVEREEP
398-400	GRK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MDITKFVADFRESAFLLGDYSAYRAQLSRRLRIVRKKLGRATPKNAKFAPKTPVTAAEIGDNIEALHLVLLTSERAWAHAMAMKASHSEDNAGKNITGSTRQHIVSRLHKAAQNARLLVELVADTASSKGTEVDVLEARAYAFALAGAEEFEKQAEGIKPSNATPQRWTPCLANFSAARVIYSTLLKSTKKDLFKDILAGTTDPSIRYAAYQSRIPRTVGVPAVAKKFFPKDDQQLVQALQKLDPDALSDEEAASSHTQITWRERTANVVDAAISQALASVDMASTTLDESTKSISSSKDRANAYDDILIASQDAVDATRRAIEELEKEGVDEGDARMQDLRVTNLAVNYDLISWRVGRNRVLIGIDDGLTFPPNPPQKPRRPRKDGKEWVEREEPTGRKLARLRERIALYDAILQSIDSIKDLRGAVRDTNFMTELDGQRAYFQALKCLNLSHSYAFLSAPKQALALCNRALSFATQASAAPRSSLPSSASPKLGVSETQAKTLKDNLENLNSHYRGVVALSQLSASQETTSKAGSTKAAPVVERLNEYPSSGSVDLKNLVSWPPKLKPVPVKPLFLDVAWNYVEYPGRAPAVQAPEPEKAPVEEKQAERPQAKKGWFSFGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.17
3	0.17
4	0.15
5	0.14
6	0.09
7	0.12
8	0.13
9	0.12
10	0.13
11	0.14
12	0.18
13	0.26
14	0.32
15	0.36
16	0.43
17	0.52
18	0.6
19	0.69
20	0.76
21	0.78
22	0.82
23	0.84
24	0.85
25	0.86
26	0.88
27	0.86
28	0.86
29	0.86
30	0.83
31	0.81
32	0.76
33	0.75
34	0.7
35	0.67
36	0.65
37	0.6
38	0.57
39	0.51
40	0.52
41	0.48
42	0.44
43	0.38
44	0.32
45	0.27
46	0.24
47	0.22
48	0.16
49	0.11
50	0.09
51	0.08
52	0.06
53	0.05
54	0.04
55	0.04
56	0.04
57	0.05
58	0.06
59	0.06
60	0.09
61	0.08
62	0.1
63	0.11
64	0.11
65	0.13
66	0.15
67	0.16
68	0.14
69	0.15
70	0.15
71	0.14
72	0.16
73	0.16
74	0.13
75	0.16
76	0.19
77	0.22
78	0.24
79	0.24
80	0.22
81	0.21
82	0.22
83	0.2
84	0.23
85	0.22
86	0.23
87	0.27
88	0.28
89	0.29
90	0.34
91	0.38
92	0.4
93	0.46
94	0.46
95	0.45
96	0.47
97	0.5
98	0.53
99	0.53
100	0.5
101	0.42
102	0.38
103	0.35
104	0.33
105	0.28
106	0.2
107	0.13
108	0.08
109	0.07
110	0.07
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.05
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.08
119	0.08
120	0.11
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.1
127	0.1
128	0.06
129	0.05
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.05
135	0.05
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.1
142	0.12
143	0.14
144	0.16
145	0.18
146	0.19
147	0.2
148	0.3
149	0.3
150	0.3
151	0.31
152	0.39
153	0.41
154	0.42
155	0.43
156	0.37
157	0.38
158	0.39
159	0.35
160	0.29
161	0.25
162	0.26
163	0.27
164	0.24
165	0.19
166	0.16
167	0.17
168	0.14
169	0.15
170	0.13
171	0.12
172	0.17
173	0.17
174	0.19
175	0.24
176	0.3
177	0.34
178	0.36
179	0.38
180	0.38
181	0.38
182	0.41
183	0.34
184	0.3
185	0.26
186	0.23
187	0.18
188	0.17
189	0.16
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.1
195	0.13
196	0.15
197	0.17
198	0.21
199	0.24
200	0.29
201	0.31
202	0.31
203	0.3
204	0.27
205	0.28
206	0.25
207	0.23
208	0.21
209	0.22
210	0.26
211	0.24
212	0.23
213	0.21
214	0.23
215	0.23
216	0.24
217	0.27
218	0.31
219	0.37
220	0.38
221	0.37
222	0.36
223	0.35
224	0.33
225	0.31
226	0.24
227	0.18
228	0.17
229	0.16
230	0.14
231	0.12
232	0.11
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.08
246	0.1
247	0.16
248	0.19
249	0.2
250	0.22
251	0.22
252	0.25
253	0.25
254	0.26
255	0.21
256	0.17
257	0.16
258	0.14
259	0.14
260	0.1
261	0.08
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.04
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.09
282	0.1
283	0.14
284	0.19
285	0.21
286	0.26
287	0.26
288	0.26
289	0.29
290	0.28
291	0.26
292	0.23
293	0.2
294	0.14
295	0.14
296	0.12
297	0.08
298	0.07
299	0.05
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.1
312	0.12
313	0.13
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.08
320	0.05
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.08
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.09
343	0.13
344	0.15
345	0.16
346	0.18
347	0.18
348	0.19
349	0.18
350	0.17
351	0.14
352	0.13
353	0.12
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.12
361	0.17
362	0.19
363	0.27
364	0.35
365	0.46
366	0.57
367	0.67
368	0.71
369	0.77
370	0.84
371	0.86
372	0.88
373	0.88
374	0.85
375	0.85
376	0.77
377	0.73
378	0.69
379	0.59
380	0.51
381	0.48
382	0.41
383	0.32
384	0.36
385	0.3
386	0.3
387	0.33
388	0.39
389	0.41
390	0.47
391	0.48
392	0.49
393	0.5
394	0.46
395	0.45
396	0.36
397	0.27
398	0.26
399	0.23
400	0.17
401	0.15
402	0.13
403	0.11
404	0.12
405	0.11
406	0.06
407	0.07
408	0.07
409	0.1
410	0.11
411	0.12
412	0.13
413	0.15
414	0.18
415	0.19
416	0.21
417	0.18
418	0.2
419	0.2
420	0.17
421	0.17
422	0.18
423	0.18
424	0.18
425	0.18
426	0.16
427	0.16
428	0.16
429	0.16
430	0.15
431	0.14
432	0.19
433	0.2
434	0.21
435	0.21
436	0.22
437	0.22
438	0.21
439	0.23
440	0.16
441	0.16
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.15
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.17
453	0.19
454	0.21
455	0.2
456	0.21
457	0.21
458	0.21
459	0.21
460	0.17
461	0.16
462	0.13
463	0.12
464	0.11
465	0.11
466	0.13
467	0.15
468	0.14
469	0.13
470	0.12
471	0.15
472	0.16
473	0.18
474	0.18
475	0.23
476	0.29
477	0.3
478	0.31
479	0.29
480	0.28
481	0.28
482	0.26
483	0.2
484	0.19
485	0.26
486	0.25
487	0.32
488	0.35
489	0.33
490	0.34
491	0.39
492	0.4
493	0.34
494	0.38
495	0.36
496	0.39
497	0.4
498	0.42
499	0.46
500	0.4
501	0.37
502	0.31
503	0.27
504	0.2
505	0.2
506	0.18
507	0.11
508	0.12
509	0.12
510	0.12
511	0.12
512	0.13
513	0.12
514	0.1
515	0.1
516	0.11
517	0.12
518	0.13
519	0.14
520	0.14
521	0.14
522	0.15
523	0.17
524	0.17
525	0.21
526	0.25
527	0.26
528	0.26
529	0.28
530	0.31
531	0.31
532	0.32
533	0.28
534	0.27
535	0.25
536	0.26
537	0.24
538	0.2
539	0.23
540	0.2
541	0.21
542	0.19
543	0.21
544	0.23
545	0.22
546	0.22
547	0.17
548	0.22
549	0.24
550	0.27
551	0.3
552	0.32
553	0.4
554	0.42
555	0.49
556	0.55
557	0.6
558	0.67
559	0.65
560	0.66
561	0.6
562	0.63
563	0.56
564	0.46
565	0.42
566	0.31
567	0.3
568	0.25
569	0.24
570	0.18
571	0.19
572	0.21
573	0.16
574	0.18
575	0.17
576	0.19
577	0.18
578	0.19
579	0.23
580	0.28
581	0.3
582	0.32
583	0.34
584	0.35
585	0.37
586	0.37
587	0.32
588	0.27
589	0.28
590	0.28
591	0.32
592	0.35
593	0.37
594	0.45
595	0.52
596	0.57
597	0.59
598	0.58
599	0.59
600	0.59
601	0.62
602	0.6
603	0.55

A0A178DG40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer