Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DXK8

Protein Details
Accession A0A178DXK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-147RAERVARRKAQRLKEHRRFEKESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-142EKRQAARRKQEDEEDGQRRAERVARRKAQRLKEHRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MDGPIASAVLLPEEAPEELRDELPDAPPAPPSPPPSLKRRQSSTSEELTKKPRLEAGNDAPADQQQATNGRMPLRRERGRERRLFGAVIGALAQTSTAGQRRRDEIEKRQAARRKQEDEEDGQRRAERVARRKAQRLKEHRRFEKESCTLADSAWMRFRHENLLNMAHFLRTDAEPRLYYKPWDTSPDQEARIQAQIAEAHETIERERAEYEDREEQETRPQHNASDEASRDAEGSNTGKSYNADGPQVPSATNGGTNGSADSPKDLDLKVDHADSHRSEAIEDASAMEYARRDNMASHETIADEASKDSYDDHGEDVVEEAAEDTVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.11
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.16
10 0.17
11 0.2
12 0.19
13 0.18
14 0.2
15 0.2
16 0.22
17 0.25
18 0.28
19 0.33
20 0.4
21 0.44
22 0.51
23 0.6
24 0.66
25 0.69
26 0.71
27 0.69
28 0.68
29 0.72
30 0.69
31 0.67
32 0.67
33 0.61
34 0.61
35 0.61
36 0.61
37 0.53
38 0.49
39 0.46
40 0.4
41 0.41
42 0.44
43 0.45
44 0.46
45 0.45
46 0.44
47 0.38
48 0.36
49 0.34
50 0.25
51 0.18
52 0.13
53 0.16
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.26
58 0.29
59 0.34
60 0.4
61 0.46
62 0.51
63 0.54
64 0.63
65 0.68
66 0.74
67 0.78
68 0.72
69 0.68
70 0.64
71 0.57
72 0.46
73 0.4
74 0.29
75 0.22
76 0.18
77 0.12
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.03
82 0.04
83 0.06
84 0.11
85 0.16
86 0.19
87 0.22
88 0.26
89 0.32
90 0.39
91 0.43
92 0.48
93 0.54
94 0.59
95 0.59
96 0.64
97 0.66
98 0.65
99 0.69
100 0.67
101 0.62
102 0.57
103 0.59
104 0.55
105 0.54
106 0.57
107 0.51
108 0.44
109 0.4
110 0.37
111 0.32
112 0.29
113 0.29
114 0.28
115 0.32
116 0.41
117 0.48
118 0.53
119 0.62
120 0.69
121 0.73
122 0.75
123 0.77
124 0.78
125 0.8
126 0.85
127 0.83
128 0.82
129 0.79
130 0.72
131 0.7
132 0.63
133 0.55
134 0.46
135 0.41
136 0.33
137 0.27
138 0.28
139 0.19
140 0.17
141 0.2
142 0.19
143 0.2
144 0.2
145 0.21
146 0.24
147 0.25
148 0.26
149 0.22
150 0.26
151 0.23
152 0.24
153 0.23
154 0.16
155 0.14
156 0.12
157 0.11
158 0.07
159 0.1
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.16
164 0.19
165 0.18
166 0.19
167 0.2
168 0.22
169 0.22
170 0.26
171 0.25
172 0.25
173 0.29
174 0.32
175 0.31
176 0.28
177 0.28
178 0.24
179 0.23
180 0.2
181 0.15
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.13
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.14
192 0.14
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.16
198 0.2
199 0.22
200 0.23
201 0.27
202 0.28
203 0.27
204 0.32
205 0.36
206 0.34
207 0.32
208 0.31
209 0.28
210 0.29
211 0.31
212 0.24
213 0.25
214 0.23
215 0.21
216 0.21
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.15
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.15
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.2
233 0.22
234 0.24
235 0.24
236 0.2
237 0.16
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.12
250 0.11
251 0.13
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.19
260 0.19
261 0.24
262 0.23
263 0.26
264 0.25
265 0.23
266 0.22
267 0.23
268 0.22
269 0.18
270 0.17
271 0.13
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.13
282 0.19
283 0.21
284 0.22
285 0.22
286 0.21
287 0.21
288 0.2
289 0.19
290 0.15
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.13
298 0.16
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.14
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.07