Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ED88

Protein Details
Accession A0A178ED88    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-353LVNDKPEKERRNERRRDKERRSDRRGDRDDYHDSDCRRDKRKDKERDNEYDSEBasic
360-443REDGHDSERRRDKRRERSRSPDDRKEKRHDRYRSRSRDSRRDRDRRDRSRDSDDRRKRRREKEYDHDDDRDDRKRRHKDEKYRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-326KPEKERRNERRRDKERRSDRRG
340-344KRKDK
353-422ERRRTSRREDGHDSERRRDKRRERSRSPDDRKEKRHDRYRSRSRDSRRDRDRRDRSRDSDDRRKRRREKE
429-443RDDRKRRHKDEKYRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
Amino Acid Sequences MAAPKPGGFKLSLAGLKNKPGLKNVRLENDTKRQRLGFDDEEREDPTKHQEISGWDTAEGGAVDIGGKKEKEGPRVIPSQPNRDWKAEARRIQLSKAPHTQVQNANVEEKVEEQKLQFGLTILQKDESNDNETVESTVPEAMEVEEDNVTEEQRLEKKALHALLHGRSANDELVIPVQTEEEALQYDLQNAPDAPTLAAYEATPIEGFGAALLRGMGWKDGETIKKGGVAPEAVAIKRRPALLGIGAKADAAAGIELGAWSGKDRSKKGMDTYNPLTMRNKKTGEVISEEELKLKLSKHDLVNDKPEKERRNERRRDKERRSDRRGDRDDYHDSDCRRDKRKDKERDNEYDSERRRTSRREDGHDSERRRDKRRERSRSPDDRKEKRHDRYRSRSRDSRRDRDRRDRSRDSDDRRKRRREKEYDHDDDRDDRKRRHKDEKYRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.39
4 0.45
5 0.48
6 0.44
7 0.47
8 0.53
9 0.51
10 0.57
11 0.58
12 0.61
13 0.59
14 0.61
15 0.61
16 0.63
17 0.67
18 0.62
19 0.6
20 0.52
21 0.51
22 0.52
23 0.52
24 0.49
25 0.47
26 0.51
27 0.49
28 0.5
29 0.51
30 0.48
31 0.4
32 0.34
33 0.34
34 0.33
35 0.3
36 0.29
37 0.29
38 0.32
39 0.38
40 0.41
41 0.35
42 0.29
43 0.28
44 0.27
45 0.25
46 0.19
47 0.12
48 0.06
49 0.05
50 0.06
51 0.07
52 0.09
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.21
57 0.26
58 0.32
59 0.37
60 0.41
61 0.43
62 0.5
63 0.53
64 0.54
65 0.55
66 0.58
67 0.59
68 0.63
69 0.61
70 0.58
71 0.58
72 0.57
73 0.62
74 0.62
75 0.61
76 0.57
77 0.61
78 0.6
79 0.58
80 0.55
81 0.5
82 0.48
83 0.5
84 0.47
85 0.43
86 0.45
87 0.49
88 0.5
89 0.5
90 0.48
91 0.42
92 0.4
93 0.36
94 0.33
95 0.26
96 0.23
97 0.21
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.17
105 0.13
106 0.16
107 0.18
108 0.2
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.21
114 0.19
115 0.2
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.15
122 0.12
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.1
140 0.13
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.19
145 0.23
146 0.26
147 0.23
148 0.22
149 0.26
150 0.27
151 0.29
152 0.27
153 0.22
154 0.2
155 0.21
156 0.18
157 0.14
158 0.11
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.12
219 0.13
220 0.1
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.17
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.06
238 0.04
239 0.03
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.03
248 0.06
249 0.08
250 0.13
251 0.15
252 0.21
253 0.25
254 0.28
255 0.32
256 0.38
257 0.39
258 0.42
259 0.44
260 0.45
261 0.42
262 0.41
263 0.42
264 0.42
265 0.43
266 0.43
267 0.41
268 0.35
269 0.39
270 0.4
271 0.37
272 0.33
273 0.31
274 0.26
275 0.28
276 0.27
277 0.24
278 0.21
279 0.19
280 0.16
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.22
285 0.24
286 0.31
287 0.36
288 0.39
289 0.48
290 0.5
291 0.48
292 0.49
293 0.53
294 0.51
295 0.52
296 0.6
297 0.6
298 0.66
299 0.74
300 0.79
301 0.83
302 0.89
303 0.92
304 0.92
305 0.92
306 0.92
307 0.93
308 0.91
309 0.9
310 0.89
311 0.89
312 0.85
313 0.8
314 0.73
315 0.69
316 0.67
317 0.6
318 0.56
319 0.5
320 0.45
321 0.46
322 0.5
323 0.51
324 0.52
325 0.57
326 0.61
327 0.68
328 0.77
329 0.8
330 0.83
331 0.85
332 0.86
333 0.86
334 0.83
335 0.79
336 0.74
337 0.73
338 0.66
339 0.64
340 0.58
341 0.54
342 0.53
343 0.54
344 0.56
345 0.57
346 0.61
347 0.61
348 0.67
349 0.69
350 0.73
351 0.75
352 0.72
353 0.71
354 0.72
355 0.71
356 0.71
357 0.75
358 0.75
359 0.78
360 0.84
361 0.86
362 0.86
363 0.89
364 0.92
365 0.93
366 0.92
367 0.91
368 0.91
369 0.9
370 0.89
371 0.89
372 0.89
373 0.88
374 0.88
375 0.88
376 0.89
377 0.9
378 0.92
379 0.92
380 0.91
381 0.9
382 0.89
383 0.9
384 0.89
385 0.89
386 0.89
387 0.89
388 0.9
389 0.92
390 0.93
391 0.92
392 0.92
393 0.91
394 0.87
395 0.87
396 0.87
397 0.85
398 0.85
399 0.86
400 0.87
401 0.87
402 0.91
403 0.91
404 0.92
405 0.93
406 0.93
407 0.92
408 0.92
409 0.92
410 0.9
411 0.86
412 0.79
413 0.71
414 0.68
415 0.65
416 0.64
417 0.62
418 0.61
419 0.65
420 0.72
421 0.78
422 0.82
423 0.85