Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2GXP5

Protein Details
Accession I2GXP5    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-124LALPKKNDKKNKSSTNQQKGGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-234RK
262-267ERRVKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG tbl:TBLA_0B00530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MVNSPIKRENEDQLNSPNKRNNSNGTLSHSEPAFDLGMGGSPANSNNSNINVGQSPGFQADTPGTPFGNIGSIDNASLPNKSSPATNLLKEDTTGTPTSGVSLALPKKNDKKNKSSTNQQKGGNQPQQADASKMQDVLFSAGVNIREEEALLNSSVNASKSQSSQLANMRSPDHPPFLHPDQLAMFMKKISNEQNFPQNFSRSPDILNLVSSVCEAYMKDIITNALVISRHRRKAVKINSGRRSDVAIALKGMAQLQKKEEERRVKKRIALGLEKEDYENKIDSEETLHRASNMTAGLRAGSKKQYGWLTSSTSKPTNVGSKTSGKVASDIATRGDSGLRFREAREEPGIVMRDLLFALENRRMGTHNIISKGYARIRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.61
4 0.6
5 0.56
6 0.59
7 0.6
8 0.59
9 0.56
10 0.59
11 0.56
12 0.56
13 0.56
14 0.52
15 0.5
16 0.42
17 0.35
18 0.29
19 0.27
20 0.2
21 0.14
22 0.13
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.16
34 0.18
35 0.21
36 0.2
37 0.22
38 0.19
39 0.19
40 0.19
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.15
49 0.17
50 0.17
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.15
71 0.21
72 0.25
73 0.25
74 0.27
75 0.28
76 0.28
77 0.27
78 0.28
79 0.21
80 0.21
81 0.2
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.08
89 0.14
90 0.19
91 0.21
92 0.23
93 0.29
94 0.37
95 0.46
96 0.56
97 0.56
98 0.61
99 0.68
100 0.77
101 0.77
102 0.79
103 0.81
104 0.81
105 0.81
106 0.74
107 0.7
108 0.68
109 0.72
110 0.67
111 0.59
112 0.5
113 0.46
114 0.47
115 0.41
116 0.36
117 0.28
118 0.25
119 0.22
120 0.22
121 0.19
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.11
148 0.13
149 0.15
150 0.15
151 0.19
152 0.23
153 0.26
154 0.26
155 0.27
156 0.27
157 0.25
158 0.27
159 0.25
160 0.23
161 0.19
162 0.2
163 0.24
164 0.25
165 0.28
166 0.24
167 0.23
168 0.2
169 0.24
170 0.24
171 0.18
172 0.16
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.15
177 0.17
178 0.19
179 0.21
180 0.22
181 0.3
182 0.3
183 0.34
184 0.34
185 0.3
186 0.27
187 0.28
188 0.3
189 0.22
190 0.22
191 0.2
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.17
216 0.24
217 0.27
218 0.31
219 0.34
220 0.37
221 0.47
222 0.55
223 0.57
224 0.6
225 0.67
226 0.71
227 0.72
228 0.69
229 0.59
230 0.53
231 0.43
232 0.38
233 0.31
234 0.23
235 0.2
236 0.19
237 0.18
238 0.16
239 0.16
240 0.14
241 0.13
242 0.15
243 0.17
244 0.23
245 0.26
246 0.32
247 0.39
248 0.47
249 0.55
250 0.63
251 0.69
252 0.67
253 0.67
254 0.68
255 0.66
256 0.62
257 0.6
258 0.54
259 0.54
260 0.51
261 0.47
262 0.41
263 0.37
264 0.31
265 0.25
266 0.22
267 0.15
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.19
277 0.2
278 0.2
279 0.18
280 0.16
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.14
286 0.15
287 0.16
288 0.19
289 0.21
290 0.21
291 0.26
292 0.3
293 0.3
294 0.32
295 0.32
296 0.34
297 0.36
298 0.39
299 0.38
300 0.36
301 0.35
302 0.32
303 0.33
304 0.35
305 0.34
306 0.34
307 0.33
308 0.37
309 0.38
310 0.41
311 0.4
312 0.32
313 0.31
314 0.29
315 0.27
316 0.23
317 0.22
318 0.2
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.18
323 0.16
324 0.17
325 0.21
326 0.23
327 0.23
328 0.24
329 0.32
330 0.32
331 0.36
332 0.37
333 0.34
334 0.31
335 0.36
336 0.38
337 0.29
338 0.28
339 0.22
340 0.19
341 0.17
342 0.17
343 0.11
344 0.1
345 0.15
346 0.19
347 0.2
348 0.2
349 0.22
350 0.23
351 0.25
352 0.31
353 0.34
354 0.36
355 0.38
356 0.38
357 0.39
358 0.4
359 0.44