Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DUD5

Protein Details
Accession A0A178DUD5    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-169APAAADGKTKKRKREKKERDPNAPKKPLTBasic
280-304AKAPSPPAKTPRKRQKTQPAVNGISHydrophilic
327-352SAQPTETPAKKEKKKRSAPAAIAPAPHydrophilic
362-410ETGATKKKGKNSRSTRNTEPEDKENAAAAEKPKEKKRDRSKRKSEATSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-166GKTKKRKREKKERDPNAPKK
290-292PRK
335-347AKKEKKKRSAPAA
366-405TKKKGKNSRSTRNTEPEDKENAAAAEKPKEKKRDRSKRKS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPPKSKTQDTGELMVSIDQYTKTRDSLRVASRPSQARSSPPSYCSPVSTTTHEHTANASCHHQVIVALTNLQGGLTHVQNGLNDLLRAYMQHTSSILAGEDGDLDKLAIPSGIVAHASAAMEAASTAVTGVTQAIANPAPAPAAADGKTKKRKREKKERDPNAPKKPLTAAFLYHQHARPIVRADLEAALATGQTIEKNAVQIEVNKRWNELPEEEKEQWKASYRNSMEEYKLELAEYSAKNGAKAADLHEDEEASDEAEIEVEAGSDASSDDEEDAVPAKAPSPPAKTPRKRQKTQPAVNGISAPVAIAPATSGATPVPLPTSRASAQPTETPAKKEKKKRSAPAAIAPAPAPATEASPEETGATKKKGKNSRSTRNTEPEDKENAAAAEKPKEKKRDRSKRKSEATST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.28
3 0.19
4 0.16
5 0.13
6 0.13
7 0.17
8 0.19
9 0.21
10 0.25
11 0.29
12 0.34
13 0.41
14 0.48
15 0.51
16 0.54
17 0.58
18 0.61
19 0.63
20 0.61
21 0.59
22 0.53
23 0.53
24 0.56
25 0.56
26 0.52
27 0.49
28 0.51
29 0.5
30 0.49
31 0.44
32 0.4
33 0.39
34 0.38
35 0.4
36 0.39
37 0.37
38 0.42
39 0.39
40 0.36
41 0.34
42 0.35
43 0.33
44 0.31
45 0.3
46 0.25
47 0.25
48 0.24
49 0.22
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.1
60 0.07
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.12
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.06
130 0.08
131 0.09
132 0.14
133 0.17
134 0.26
135 0.36
136 0.4
137 0.49
138 0.58
139 0.67
140 0.73
141 0.82
142 0.84
143 0.86
144 0.92
145 0.92
146 0.92
147 0.94
148 0.93
149 0.92
150 0.88
151 0.77
152 0.68
153 0.62
154 0.53
155 0.45
156 0.36
157 0.28
158 0.23
159 0.28
160 0.27
161 0.28
162 0.26
163 0.24
164 0.24
165 0.23
166 0.22
167 0.21
168 0.2
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.11
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.12
190 0.17
191 0.22
192 0.26
193 0.26
194 0.27
195 0.27
196 0.28
197 0.27
198 0.24
199 0.21
200 0.2
201 0.26
202 0.27
203 0.28
204 0.27
205 0.25
206 0.24
207 0.25
208 0.24
209 0.2
210 0.28
211 0.27
212 0.3
213 0.33
214 0.34
215 0.31
216 0.29
217 0.3
218 0.22
219 0.21
220 0.17
221 0.13
222 0.11
223 0.16
224 0.15
225 0.13
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.14
240 0.15
241 0.12
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.12
270 0.16
271 0.21
272 0.27
273 0.36
274 0.47
275 0.55
276 0.64
277 0.73
278 0.78
279 0.78
280 0.83
281 0.85
282 0.86
283 0.86
284 0.84
285 0.82
286 0.74
287 0.69
288 0.59
289 0.48
290 0.37
291 0.27
292 0.18
293 0.09
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.1
307 0.1
308 0.13
309 0.14
310 0.19
311 0.19
312 0.23
313 0.26
314 0.25
315 0.28
316 0.29
317 0.33
318 0.35
319 0.37
320 0.38
321 0.44
322 0.52
323 0.58
324 0.65
325 0.71
326 0.74
327 0.82
328 0.86
329 0.88
330 0.88
331 0.85
332 0.83
333 0.81
334 0.73
335 0.64
336 0.54
337 0.45
338 0.35
339 0.28
340 0.21
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.14
349 0.16
350 0.18
351 0.22
352 0.26
353 0.32
354 0.36
355 0.45
356 0.54
357 0.6
358 0.67
359 0.73
360 0.78
361 0.8
362 0.83
363 0.83
364 0.83
365 0.82
366 0.81
367 0.76
368 0.71
369 0.67
370 0.62
371 0.54
372 0.46
373 0.39
374 0.32
375 0.3
376 0.28
377 0.3
378 0.35
379 0.42
380 0.48
381 0.58
382 0.65
383 0.72
384 0.8
385 0.82
386 0.87
387 0.9
388 0.93
389 0.93
390 0.95