Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E6N5

Protein Details
Accession A0A178E6N5    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-276ETFTKWKKERIDKKQAEEEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-13K
26-27RK
50-64EKRKAAEKLQREKEK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.333, cyto 7, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKGKGEQPKVKKVAVDKTFGMKNRKGGAAQKQIAQIKATQASGGSPEEKRKAAEKLQREKEKAAAEQARKETAELFKPVQIQKVPFGVDPKTVLCQFFKKGNCEKGKKCKFSHDLAIERKTEKRSLYTDSRDQEKEEEEERKKKDNMDDWDEDKLRQVVLSKQGNPKTTTDKVCKFFIQAIEDQKYGWFWICPNGGDTCKYKHSLPPGFVIKTKEQRAAERALMANSPMATLTLEDFLESERHKLTGTLTPVTEETFTKWKKERIDKKQAEEEAKKMKDATGRAMFEKGDWQVDSEADSDDEDDDGTWNLEAMRRETEAARARKEEERMAAQLGNVTIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.66
3 0.61
4 0.57
5 0.49
6 0.5
7 0.54
8 0.56
9 0.56
10 0.5
11 0.52
12 0.52
13 0.53
14 0.51
15 0.52
16 0.56
17 0.59
18 0.57
19 0.55
20 0.57
21 0.57
22 0.55
23 0.48
24 0.4
25 0.36
26 0.36
27 0.31
28 0.24
29 0.2
30 0.19
31 0.21
32 0.21
33 0.19
34 0.19
35 0.25
36 0.29
37 0.3
38 0.32
39 0.33
40 0.37
41 0.43
42 0.48
43 0.52
44 0.59
45 0.68
46 0.74
47 0.74
48 0.7
49 0.67
50 0.63
51 0.55
52 0.53
53 0.51
54 0.47
55 0.5
56 0.5
57 0.47
58 0.43
59 0.41
60 0.36
61 0.32
62 0.32
63 0.29
64 0.28
65 0.27
66 0.33
67 0.34
68 0.35
69 0.34
70 0.31
71 0.3
72 0.32
73 0.31
74 0.26
75 0.28
76 0.24
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.21
81 0.21
82 0.21
83 0.2
84 0.23
85 0.24
86 0.29
87 0.31
88 0.35
89 0.41
90 0.49
91 0.56
92 0.6
93 0.66
94 0.7
95 0.77
96 0.77
97 0.73
98 0.73
99 0.69
100 0.65
101 0.66
102 0.62
103 0.6
104 0.58
105 0.6
106 0.52
107 0.49
108 0.48
109 0.42
110 0.39
111 0.32
112 0.3
113 0.29
114 0.33
115 0.38
116 0.4
117 0.43
118 0.43
119 0.47
120 0.43
121 0.42
122 0.37
123 0.31
124 0.28
125 0.26
126 0.31
127 0.31
128 0.37
129 0.39
130 0.44
131 0.43
132 0.44
133 0.46
134 0.46
135 0.47
136 0.46
137 0.47
138 0.42
139 0.46
140 0.43
141 0.37
142 0.31
143 0.25
144 0.17
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.19
149 0.23
150 0.26
151 0.33
152 0.37
153 0.39
154 0.4
155 0.38
156 0.37
157 0.38
158 0.39
159 0.38
160 0.41
161 0.41
162 0.41
163 0.39
164 0.34
165 0.32
166 0.29
167 0.26
168 0.23
169 0.25
170 0.25
171 0.25
172 0.23
173 0.21
174 0.18
175 0.15
176 0.13
177 0.08
178 0.06
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.18
186 0.19
187 0.18
188 0.2
189 0.22
190 0.21
191 0.23
192 0.31
193 0.33
194 0.32
195 0.35
196 0.38
197 0.37
198 0.39
199 0.4
200 0.37
201 0.4
202 0.41
203 0.41
204 0.38
205 0.4
206 0.41
207 0.41
208 0.35
209 0.31
210 0.29
211 0.24
212 0.22
213 0.19
214 0.16
215 0.12
216 0.11
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.18
236 0.21
237 0.21
238 0.21
239 0.22
240 0.22
241 0.22
242 0.21
243 0.15
244 0.15
245 0.22
246 0.23
247 0.28
248 0.33
249 0.37
250 0.45
251 0.56
252 0.63
253 0.64
254 0.75
255 0.76
256 0.78
257 0.82
258 0.79
259 0.77
260 0.7
261 0.66
262 0.64
263 0.58
264 0.52
265 0.44
266 0.41
267 0.37
268 0.35
269 0.37
270 0.35
271 0.37
272 0.37
273 0.39
274 0.36
275 0.31
276 0.34
277 0.27
278 0.22
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.19
283 0.2
284 0.15
285 0.15
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.18
303 0.18
304 0.21
305 0.21
306 0.3
307 0.35
308 0.4
309 0.43
310 0.43
311 0.46
312 0.5
313 0.53
314 0.51
315 0.48
316 0.46
317 0.43
318 0.43
319 0.4
320 0.34
321 0.33