Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DYI5

Protein Details
Accession A0A178DYI5    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-48EDAKGKKRKSASSAEPKAKKPRKADBasic
106-130VAEPTKTKTTKPKKSKKAEAEAVVEHydrophilic
320-344RTQWEKRVEKENKRRSGKNKQLKEDBasic
417-439AEPVAEKKGRKPRKAKADVPDATHydrophilic
446-488APVEAKPKSKKAQKESKADTVVEDVKEKKRKAKPESEVAAKPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-73KGKKRKSASSAEPKAKKPRKADETAAPATASKVVSKGRKQAADAAKV
75-92DAPAPKAQAKPTKAKKSK
111-122KTKTTKPKKSKK
325-339KRVEKENKRRSGKNK
422-432EKKGRKPRKAK
451-462KPKSKKAQKESK
470-495VKEKKRKAKPESEVAAKPKKAKKAKA
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12.333, nucl 10, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MRFTFVPTSPIAPLSTQPHAMAAEDAKGKKRKSASSAEPKAKKPRKADETAAPATASKVVSKGRKQAADAAKVDDAPAPKAQAKPTKAKKSKDVAANGAAPVAEPVAEPTKTKTTKPKKSKKAEAEAVVEEPAVEAEEAIESEDDAESVAEEDDQTAALLAGFDSDGDSEDPEDDLEFDEDIQVPTLSKKQKKALEKAAQSIKTDDPGVIYVGRVPRGFFEAQMKKYFSQFGKVNRLRLSRNKKTGASKHYAFVEFASSEVADIVARTMNNYLMFGHILKCHLVPAEQVHPDLFKGAGERFKVDPRNKKAGLEMERGVDRTQWEKRVEKENKRRSGKNKQLKEDFGYEYGAPQLKAVEEAATKAPAIEAPKTKKAAKAAKAVTEASPSNTNPVSEQKAKKNTKAKAVEASLETAEPAEPVAEKKGRKPRKAKADVPDATMDTEEAAPVEAKPKSKKAQKESKADTVVEDVKEKKRKAKPESEVAAKPKKAKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.27
4 0.26
5 0.27
6 0.26
7 0.25
8 0.23
9 0.19
10 0.2
11 0.24
12 0.27
13 0.33
14 0.4
15 0.4
16 0.44
17 0.5
18 0.53
19 0.54
20 0.61
21 0.64
22 0.68
23 0.77
24 0.8
25 0.8
26 0.8
27 0.84
28 0.83
29 0.8
30 0.78
31 0.79
32 0.78
33 0.78
34 0.77
35 0.75
36 0.75
37 0.69
38 0.61
39 0.51
40 0.42
41 0.36
42 0.32
43 0.23
44 0.16
45 0.17
46 0.22
47 0.3
48 0.36
49 0.43
50 0.48
51 0.51
52 0.52
53 0.58
54 0.59
55 0.59
56 0.55
57 0.5
58 0.43
59 0.4
60 0.38
61 0.32
62 0.25
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.22
67 0.25
68 0.32
69 0.37
70 0.42
71 0.49
72 0.58
73 0.66
74 0.71
75 0.74
76 0.76
77 0.75
78 0.78
79 0.75
80 0.71
81 0.64
82 0.6
83 0.56
84 0.47
85 0.39
86 0.31
87 0.22
88 0.17
89 0.12
90 0.07
91 0.05
92 0.07
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.16
97 0.26
98 0.28
99 0.32
100 0.41
101 0.48
102 0.58
103 0.69
104 0.76
105 0.77
106 0.85
107 0.92
108 0.91
109 0.9
110 0.86
111 0.81
112 0.74
113 0.65
114 0.56
115 0.45
116 0.35
117 0.25
118 0.17
119 0.11
120 0.07
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.14
174 0.21
175 0.25
176 0.3
177 0.37
178 0.44
179 0.52
180 0.59
181 0.63
182 0.65
183 0.63
184 0.64
185 0.64
186 0.59
187 0.52
188 0.47
189 0.37
190 0.3
191 0.27
192 0.2
193 0.13
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.21
208 0.25
209 0.28
210 0.32
211 0.33
212 0.3
213 0.31
214 0.35
215 0.26
216 0.26
217 0.28
218 0.31
219 0.4
220 0.41
221 0.44
222 0.44
223 0.47
224 0.45
225 0.51
226 0.54
227 0.52
228 0.57
229 0.57
230 0.56
231 0.61
232 0.64
233 0.61
234 0.57
235 0.5
236 0.44
237 0.43
238 0.39
239 0.32
240 0.24
241 0.2
242 0.13
243 0.12
244 0.1
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.04
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.11
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.11
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.13
285 0.13
286 0.16
287 0.17
288 0.23
289 0.31
290 0.37
291 0.45
292 0.48
293 0.57
294 0.55
295 0.54
296 0.52
297 0.53
298 0.51
299 0.45
300 0.39
301 0.33
302 0.33
303 0.33
304 0.29
305 0.22
306 0.18
307 0.19
308 0.22
309 0.26
310 0.3
311 0.32
312 0.37
313 0.46
314 0.54
315 0.59
316 0.66
317 0.7
318 0.76
319 0.79
320 0.82
321 0.8
322 0.82
323 0.82
324 0.82
325 0.8
326 0.79
327 0.79
328 0.75
329 0.7
330 0.64
331 0.55
332 0.46
333 0.39
334 0.3
335 0.24
336 0.24
337 0.21
338 0.16
339 0.13
340 0.13
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.13
354 0.16
355 0.22
356 0.28
357 0.34
358 0.38
359 0.4
360 0.42
361 0.49
362 0.53
363 0.51
364 0.55
365 0.53
366 0.54
367 0.55
368 0.53
369 0.45
370 0.4
371 0.34
372 0.28
373 0.28
374 0.22
375 0.24
376 0.23
377 0.22
378 0.2
379 0.25
380 0.29
381 0.33
382 0.4
383 0.45
384 0.55
385 0.6
386 0.67
387 0.71
388 0.69
389 0.71
390 0.71
391 0.66
392 0.64
393 0.61
394 0.56
395 0.48
396 0.45
397 0.35
398 0.28
399 0.24
400 0.16
401 0.14
402 0.09
403 0.08
404 0.06
405 0.06
406 0.08
407 0.15
408 0.2
409 0.22
410 0.31
411 0.42
412 0.51
413 0.6
414 0.69
415 0.72
416 0.78
417 0.86
418 0.85
419 0.84
420 0.85
421 0.78
422 0.72
423 0.66
424 0.55
425 0.46
426 0.38
427 0.29
428 0.2
429 0.17
430 0.12
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.14
436 0.15
437 0.21
438 0.27
439 0.36
440 0.44
441 0.52
442 0.62
443 0.67
444 0.75
445 0.78
446 0.83
447 0.83
448 0.83
449 0.79
450 0.7
451 0.61
452 0.56
453 0.52
454 0.43
455 0.4
456 0.36
457 0.41
458 0.49
459 0.51
460 0.55
461 0.58
462 0.67
463 0.72
464 0.77
465 0.77
466 0.79
467 0.83
468 0.81
469 0.8
470 0.79
471 0.78
472 0.72
473 0.73
474 0.69
475 0.71