Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EKX5

Protein Details
Accession A0A178EKX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-63QKTGASPSKPPPTPRRNRRLEVPDSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-56RPAKRQKTGASPSKPPPTPRRNRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, cyto 4, mito 3, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033315  Fan1-like  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR014883  VRR_NUC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004528  F:phosphodiesterase I activity  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08774  VRR_NUC  
CDD cd22326  FAN1-like  
Amino Acid Sequences MVLTPQTPSKHNSMITQFIKHPESTNFDGNKDRPAKRQKTGASPSKPPPTPRRNRRLEVPDSDADDSDNEIEKEEKDHRTDLESALPPVKSGAEAIQEYEAFKASQEENADDVGERLEKRAWIRGKSSLYVDAFNLALDTVLEDESHLFDAAEREVFSIWRDLDYEAQYLYVRLFLRKTSAWHRIKNLGYHSDISDLEAAVDVLQTAVDLPQLDSKVDSYPGESEAPAGTTLGNTITFADRSEEEITTLEEASSLLKLDELKALAKDAKVQGKNKKELLKALRQTSQRQTGLGHVGLRRSDTNSSRPSSASGSRPETPDIEPIPAEDLSDDANRDAHFTRKIMRETGSCIRLSLATVKLFERVHLVFYRSTEWTEKSLTTIILAKIARRNFPEYIVSRSANIFASRSLLLEYEASIRTQFRIDNILEFNGRPTEKGLQEIMDIFEEVYPRWQVLVQEEQEKEQSIYHSGEGSYLRRLSPAWVYTRIIHKALEVIRRRKEHKQEHDLLCELLKQRLFHHSRRGAWYQRKALLEEHYMAALTDPEKRNEEQQKKHWKRVALQTCEEGLQDNLVHIIHHYDLQKRITKLEKSINIAKRLQHDFGHVRLTKPLEVTMEGIRIERETPLLARRNSSPHPTFGRRGAKTIWIDPREDGVCSVEAMCLSHYRNQGWKGYHSEGGIVRTLFAYLCFDVLFIYIPNVFQTPYQTCPLDLHTDAFYPSRISEMNARLNEISNGDAPAIIRRIYDEHHENRTCVVGLDWTFDISDLIEIATCFDGEALATVCKVMAQEYGQRGGGVPDLFLWKVGEDGEKGEVKFAEVKSENDRLSDTQRLWIHVLSGAGVKVELCGAVATEVRVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.51
4 0.48
5 0.49
6 0.5
7 0.44
8 0.43
9 0.38
10 0.42
11 0.42
12 0.48
13 0.43
14 0.43
15 0.5
16 0.47
17 0.52
18 0.53
19 0.52
20 0.53
21 0.62
22 0.67
23 0.66
24 0.74
25 0.71
26 0.73
27 0.79
28 0.8
29 0.76
30 0.76
31 0.77
32 0.78
33 0.76
34 0.74
35 0.75
36 0.75
37 0.79
38 0.82
39 0.84
40 0.84
41 0.85
42 0.87
43 0.85
44 0.83
45 0.78
46 0.75
47 0.68
48 0.63
49 0.58
50 0.48
51 0.39
52 0.31
53 0.26
54 0.21
55 0.2
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.2
61 0.25
62 0.28
63 0.29
64 0.32
65 0.32
66 0.35
67 0.37
68 0.34
69 0.36
70 0.33
71 0.32
72 0.33
73 0.32
74 0.27
75 0.25
76 0.24
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.17
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.17
88 0.12
89 0.12
90 0.14
91 0.13
92 0.16
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.14
102 0.12
103 0.13
104 0.15
105 0.18
106 0.2
107 0.29
108 0.33
109 0.35
110 0.39
111 0.45
112 0.47
113 0.47
114 0.47
115 0.45
116 0.41
117 0.38
118 0.34
119 0.27
120 0.23
121 0.19
122 0.16
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.18
151 0.2
152 0.19
153 0.15
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.12
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.19
164 0.21
165 0.26
166 0.3
167 0.4
168 0.45
169 0.49
170 0.53
171 0.57
172 0.59
173 0.59
174 0.56
175 0.51
176 0.46
177 0.43
178 0.38
179 0.33
180 0.3
181 0.25
182 0.21
183 0.15
184 0.12
185 0.1
186 0.09
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.11
227 0.1
228 0.14
229 0.16
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.17
254 0.2
255 0.28
256 0.32
257 0.39
258 0.45
259 0.52
260 0.58
261 0.59
262 0.61
263 0.55
264 0.58
265 0.58
266 0.59
267 0.57
268 0.56
269 0.57
270 0.54
271 0.57
272 0.56
273 0.57
274 0.48
275 0.43
276 0.39
277 0.36
278 0.36
279 0.31
280 0.27
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.22
285 0.19
286 0.18
287 0.22
288 0.22
289 0.28
290 0.31
291 0.33
292 0.33
293 0.32
294 0.31
295 0.3
296 0.31
297 0.29
298 0.29
299 0.31
300 0.32
301 0.34
302 0.33
303 0.31
304 0.28
305 0.28
306 0.24
307 0.2
308 0.18
309 0.16
310 0.17
311 0.15
312 0.14
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.07
319 0.09
320 0.09
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.15
326 0.21
327 0.25
328 0.28
329 0.28
330 0.29
331 0.27
332 0.31
333 0.36
334 0.33
335 0.27
336 0.25
337 0.23
338 0.21
339 0.21
340 0.18
341 0.15
342 0.13
343 0.14
344 0.15
345 0.18
346 0.18
347 0.17
348 0.17
349 0.15
350 0.16
351 0.16
352 0.18
353 0.15
354 0.16
355 0.19
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.17
360 0.17
361 0.18
362 0.17
363 0.15
364 0.15
365 0.13
366 0.12
367 0.14
368 0.12
369 0.14
370 0.15
371 0.15
372 0.19
373 0.21
374 0.23
375 0.23
376 0.27
377 0.23
378 0.25
379 0.28
380 0.25
381 0.29
382 0.3
383 0.27
384 0.24
385 0.24
386 0.23
387 0.18
388 0.17
389 0.12
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.14
415 0.14
416 0.12
417 0.12
418 0.1
419 0.11
420 0.14
421 0.14
422 0.16
423 0.16
424 0.13
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.09
429 0.08
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.1
441 0.15
442 0.15
443 0.21
444 0.21
445 0.22
446 0.21
447 0.21
448 0.19
449 0.14
450 0.14
451 0.11
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.13
465 0.15
466 0.17
467 0.18
468 0.2
469 0.21
470 0.23
471 0.28
472 0.29
473 0.26
474 0.23
475 0.19
476 0.21
477 0.24
478 0.29
479 0.32
480 0.36
481 0.42
482 0.47
483 0.52
484 0.56
485 0.62
486 0.64
487 0.67
488 0.69
489 0.72
490 0.71
491 0.7
492 0.62
493 0.52
494 0.42
495 0.35
496 0.27
497 0.2
498 0.18
499 0.15
500 0.16
501 0.26
502 0.3
503 0.31
504 0.4
505 0.43
506 0.45
507 0.51
508 0.56
509 0.55
510 0.58
511 0.62
512 0.58
513 0.58
514 0.55
515 0.5
516 0.46
517 0.41
518 0.35
519 0.29
520 0.24
521 0.18
522 0.17
523 0.15
524 0.12
525 0.09
526 0.07
527 0.13
528 0.14
529 0.16
530 0.19
531 0.2
532 0.29
533 0.38
534 0.46
535 0.47
536 0.55
537 0.65
538 0.69
539 0.76
540 0.73
541 0.67
542 0.65
543 0.68
544 0.68
545 0.63
546 0.59
547 0.52
548 0.49
549 0.45
550 0.38
551 0.28
552 0.18
553 0.12
554 0.1
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.07
561 0.06
562 0.1
563 0.13
564 0.16
565 0.2
566 0.25
567 0.3
568 0.3
569 0.34
570 0.38
571 0.38
572 0.4
573 0.45
574 0.45
575 0.45
576 0.53
577 0.55
578 0.53
579 0.53
580 0.5
581 0.49
582 0.48
583 0.45
584 0.37
585 0.38
586 0.36
587 0.35
588 0.4
589 0.34
590 0.31
591 0.32
592 0.34
593 0.29
594 0.27
595 0.26
596 0.19
597 0.19
598 0.2
599 0.17
600 0.17
601 0.15
602 0.15
603 0.13
604 0.12
605 0.12
606 0.1
607 0.1
608 0.09
609 0.11
610 0.17
611 0.24
612 0.24
613 0.26
614 0.29
615 0.35
616 0.37
617 0.44
618 0.39
619 0.38
620 0.45
621 0.48
622 0.49
623 0.51
624 0.57
625 0.5
626 0.51
627 0.47
628 0.47
629 0.45
630 0.48
631 0.48
632 0.41
633 0.41
634 0.38
635 0.41
636 0.34
637 0.31
638 0.25
639 0.17
640 0.16
641 0.15
642 0.14
643 0.1
644 0.09
645 0.09
646 0.1
647 0.11
648 0.12
649 0.18
650 0.21
651 0.23
652 0.28
653 0.32
654 0.37
655 0.37
656 0.39
657 0.4
658 0.41
659 0.41
660 0.35
661 0.36
662 0.31
663 0.31
664 0.29
665 0.22
666 0.18
667 0.16
668 0.16
669 0.12
670 0.11
671 0.12
672 0.09
673 0.1
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.06
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.15
688 0.17
689 0.2
690 0.24
691 0.23
692 0.23
693 0.25
694 0.27
695 0.27
696 0.25
697 0.23
698 0.21
699 0.21
700 0.22
701 0.21
702 0.18
703 0.14
704 0.13
705 0.14
706 0.13
707 0.14
708 0.2
709 0.26
710 0.34
711 0.33
712 0.36
713 0.34
714 0.35
715 0.34
716 0.28
717 0.23
718 0.16
719 0.16
720 0.13
721 0.13
722 0.12
723 0.15
724 0.16
725 0.14
726 0.13
727 0.14
728 0.16
729 0.18
730 0.25
731 0.29
732 0.33
733 0.43
734 0.45
735 0.43
736 0.42
737 0.42
738 0.35
739 0.27
740 0.22
741 0.18
742 0.16
743 0.19
744 0.18
745 0.16
746 0.16
747 0.15
748 0.15
749 0.1
750 0.1
751 0.06
752 0.06
753 0.06
754 0.06
755 0.07
756 0.08
757 0.07
758 0.07
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.07
766 0.07
767 0.07
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.09
772 0.11
773 0.19
774 0.22
775 0.26
776 0.25
777 0.25
778 0.25
779 0.23
780 0.25
781 0.18
782 0.14
783 0.13
784 0.16
785 0.16
786 0.17
787 0.16
788 0.12
789 0.13
790 0.14
791 0.14
792 0.12
793 0.14
794 0.18
795 0.21
796 0.21
797 0.23
798 0.22
799 0.22
800 0.27
801 0.25
802 0.3
803 0.28
804 0.32
805 0.35
806 0.42
807 0.4
808 0.36
809 0.39
810 0.33
811 0.37
812 0.4
813 0.35
814 0.36
815 0.38
816 0.4
817 0.4
818 0.37
819 0.32
820 0.27
821 0.26
822 0.19
823 0.19
824 0.16
825 0.13
826 0.13
827 0.11
828 0.09
829 0.09
830 0.08
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.08
835 0.09