FuNGI

A0A178E6F2

Protein Details

Accession

A0A178E6F2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-434	SQMKSSKRGTYFRKRRRWERVKGVVDE	Hydrophilic
584-609	VEGRVEARGHQSKKKRKVVAETGAPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
420-425	RKRRRW
596-599	KKKR

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 7, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MHSYIRPHSHVALRLPSGLLKIVEITPNQSINLGKFGTFNSNLILGRPYYLTFEILDKDEGRPKAELRVVPASELHAEALGSDNAPAAEAGDDNAEGGAGFDIVGEDGEVIMRNNRLTVDDASRQALTMAEIEELKKAESGSGKEIIAKIMASHNAIDEKTSFSLAKYTLRKSRKYLKRFTVLPLDVGRLTEYVLEKEAYKIMELREDLLGLICSWANVRSGAESRVLVSEDGVSQIGGGRWLVVDDTGGLITAALAERMGILYPDEERDDTDSGEEEPHQQNGKAESATETLLDEADTTMVDAPETTEATTTASDPSKPSDPSSRPRKPRAPHIPQMSAQTNSLTVLHANNQPNLSYLKYFGYDYGAPTVSHPLYRSLKSLSWLSLLHPEDDPQYDEPEVISDEKLSQMKSSKRGTYFRKRRRWERVKGVVDETQRGGFDGLVIATAMDAKSALKELVPLVRGGGKVVVYNPNVEPLVELCDFYSKDRRAAYIAREFGPPPQTQPNGKRAKLDDGFDTNDSTTEGGNDDEEDFPVNPTLLLAPTLQTARGRQWQVLPGRTHPMMTSKGGAEGYIFAATRVLPVEGRVEARGHQSKKKRKVVAETGAPAEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.4
3	0.36
4	0.31
5	0.28
6	0.23
7	0.16
8	0.17
9	0.18
10	0.21
11	0.2
12	0.22
13	0.23
14	0.24
15	0.24
16	0.24
17	0.23
18	0.21
19	0.25
20	0.22
21	0.19
22	0.19
23	0.2
24	0.25
25	0.25
26	0.24
27	0.21
28	0.24
29	0.23
30	0.23
31	0.24
32	0.17
33	0.17
34	0.18
35	0.17
36	0.17
37	0.18
38	0.18
39	0.17
40	0.19
41	0.19
42	0.2
43	0.22
44	0.2
45	0.22
46	0.28
47	0.29
48	0.29
49	0.29
50	0.29
51	0.34
52	0.38
53	0.36
54	0.35
55	0.42
56	0.4
57	0.38
58	0.38
59	0.32
60	0.28
61	0.26
62	0.2
63	0.12
64	0.11
65	0.1
66	0.12
67	0.1
68	0.09
69	0.08
70	0.09
71	0.08
72	0.09
73	0.08
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.07
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.04
87	0.04
88	0.03
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.03
94	0.03
95	0.04
96	0.05
97	0.05
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.12
104	0.15
105	0.18
106	0.22
107	0.25
108	0.27
109	0.28
110	0.27
111	0.26
112	0.23
113	0.19
114	0.14
115	0.11
116	0.1
117	0.09
118	0.1
119	0.1
120	0.12
121	0.12
122	0.11
123	0.11
124	0.1
125	0.12
126	0.15
127	0.17
128	0.19
129	0.22
130	0.21
131	0.23
132	0.23
133	0.21
134	0.18
135	0.15
136	0.12
137	0.13
138	0.14
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.15
143	0.15
144	0.15
145	0.12
146	0.14
147	0.13
148	0.15
149	0.14
150	0.12
151	0.15
152	0.16
153	0.22
154	0.25
155	0.3
156	0.37
157	0.44
158	0.48
159	0.52
160	0.61
161	0.64
162	0.68
163	0.71
164	0.71
165	0.72
166	0.7
167	0.68
168	0.67
169	0.58
170	0.52
171	0.43
172	0.37
173	0.3
174	0.27
175	0.23
176	0.13
177	0.13
178	0.12
179	0.12
180	0.1
181	0.11
182	0.12
183	0.11
184	0.12
185	0.14
186	0.11
187	0.11
188	0.12
189	0.11
190	0.15
191	0.15
192	0.15
193	0.14
194	0.13
195	0.13
196	0.11
197	0.11
198	0.07
199	0.07
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.09
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.13
215	0.11
216	0.09
217	0.09
218	0.07
219	0.08
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.04
229	0.05
230	0.05
231	0.04
232	0.04
233	0.03
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.05
252	0.06
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.12
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.16
270	0.17
271	0.18
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.11
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.05
283	0.04
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.03
291	0.04
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.04
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.12
305	0.14
306	0.15
307	0.17
308	0.22
309	0.26
310	0.35
311	0.45
312	0.51
313	0.55
314	0.62
315	0.69
316	0.65
317	0.71
318	0.73
319	0.71
320	0.7
321	0.7
322	0.66
323	0.59
324	0.61
325	0.52
326	0.42
327	0.34
328	0.27
329	0.2
330	0.16
331	0.15
332	0.1
333	0.08
334	0.07
335	0.1
336	0.16
337	0.18
338	0.19
339	0.19
340	0.19
341	0.19
342	0.2
343	0.18
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.11
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.14
357	0.18
358	0.14
359	0.15
360	0.15
361	0.18
362	0.21
363	0.23
364	0.24
365	0.23
366	0.23
367	0.25
368	0.26
369	0.21
370	0.19
371	0.18
372	0.17
373	0.22
374	0.22
375	0.2
376	0.19
377	0.19
378	0.18
379	0.19
380	0.2
381	0.13
382	0.14
383	0.13
384	0.13
385	0.12
386	0.11
387	0.11
388	0.1
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.11
393	0.13
394	0.12
395	0.13
396	0.18
397	0.23
398	0.3
399	0.35
400	0.38
401	0.42
402	0.49
403	0.56
404	0.62
405	0.68
406	0.72
407	0.77
408	0.8
409	0.85
410	0.89
411	0.9
412	0.88
413	0.88
414	0.88
415	0.84
416	0.79
417	0.72
418	0.66
419	0.58
420	0.5
421	0.41
422	0.32
423	0.25
424	0.22
425	0.18
426	0.12
427	0.1
428	0.08
429	0.07
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.09
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.16
450	0.16
451	0.15
452	0.15
453	0.12
454	0.12
455	0.15
456	0.2
457	0.18
458	0.2
459	0.2
460	0.22
461	0.21
462	0.2
463	0.18
464	0.13
465	0.17
466	0.15
467	0.15
468	0.12
469	0.16
470	0.16
471	0.19
472	0.28
473	0.24
474	0.28
475	0.29
476	0.31
477	0.31
478	0.35
479	0.39
480	0.38
481	0.4
482	0.37
483	0.38
484	0.37
485	0.38
486	0.39
487	0.32
488	0.28
489	0.33
490	0.36
491	0.42
492	0.48
493	0.53
494	0.57
495	0.58
496	0.6
497	0.55
498	0.6
499	0.56
500	0.52
501	0.47
502	0.43
503	0.45
504	0.39
505	0.38
506	0.28
507	0.24
508	0.22
509	0.17
510	0.13
511	0.1
512	0.1
513	0.08
514	0.09
515	0.09
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.13
520	0.12
521	0.13
522	0.14
523	0.12
524	0.1
525	0.1
526	0.11
527	0.09
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.12
532	0.13
533	0.14
534	0.16
535	0.18
536	0.23
537	0.31
538	0.33
539	0.33
540	0.37
541	0.43
542	0.48
543	0.53
544	0.51
545	0.46
546	0.51
547	0.49
548	0.44
549	0.38
550	0.36
551	0.33
552	0.32
553	0.31
554	0.25
555	0.27
556	0.26
557	0.25
558	0.2
559	0.17
560	0.16
561	0.15
562	0.14
563	0.11
564	0.11
565	0.11
566	0.12
567	0.12
568	0.11
569	0.09
570	0.11
571	0.14
572	0.16
573	0.18
574	0.18
575	0.19
576	0.2
577	0.29
578	0.37
579	0.39
580	0.46
581	0.55
582	0.64
583	0.73
584	0.81
585	0.81
586	0.8
587	0.85
588	0.86
589	0.85
590	0.83
591	0.77

A0A178E6F2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer