Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EMM8

Protein Details
Accession A0A178EMM8    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-31SLARDISPPPRAKRRRGSCIPTSQASHydrophilic
252-276NELLRRPTARRKKSHQTARSRAQSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-18K
260-264ARRKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MDIPSSLARDISPPPRAKRRRGSCIPTSQASLEPADTIEPTLAAIEAGRAKIEDHLTYFRKHLQAAARLTSPGIPRLSISDFSSLYQSNQHEHGNHFVIHQHNHPKAGVHYDLRIQFSDASSISFAIPKGLPGDPNSKSIGRLAIETRVHCLWNHLIESASNKTGSLLIWDTGTYEVLPRKSNSTITPSPHTTDEDEDEEEGDTSRLDSASERQSHENEKLIFAFQTRYIRLRLYGTRLPKGYTIVLRLPSNELLRRPTARRKKSHQTARSRAQSQSSGRYLLDSDSDTTPTAPNNTQETHQQEEEDLNTDSEEDTQTRANNAYPGSTNSVGSIHQRHWFLQLDRQNSGFVLTPQSGKRKWVRGPSDGGFESFLVRGRDFERSVVTGRLAAEVESDEGVEGYVGRGGWVGVER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.6
3 0.68
4 0.75
5 0.79
6 0.82
7 0.84
8 0.86
9 0.86
10 0.85
11 0.86
12 0.82
13 0.74
14 0.68
15 0.59
16 0.52
17 0.45
18 0.37
19 0.27
20 0.22
21 0.19
22 0.17
23 0.15
24 0.13
25 0.1
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.05
32 0.08
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.15
39 0.19
40 0.17
41 0.19
42 0.26
43 0.29
44 0.31
45 0.33
46 0.35
47 0.35
48 0.34
49 0.35
50 0.35
51 0.41
52 0.43
53 0.44
54 0.39
55 0.37
56 0.37
57 0.36
58 0.3
59 0.27
60 0.23
61 0.19
62 0.19
63 0.22
64 0.25
65 0.23
66 0.23
67 0.22
68 0.21
69 0.22
70 0.24
71 0.21
72 0.19
73 0.22
74 0.22
75 0.21
76 0.23
77 0.26
78 0.25
79 0.26
80 0.31
81 0.28
82 0.27
83 0.24
84 0.26
85 0.27
86 0.27
87 0.32
88 0.35
89 0.34
90 0.36
91 0.36
92 0.33
93 0.31
94 0.34
95 0.31
96 0.24
97 0.24
98 0.27
99 0.3
100 0.3
101 0.29
102 0.25
103 0.22
104 0.2
105 0.21
106 0.16
107 0.14
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.16
120 0.23
121 0.22
122 0.24
123 0.27
124 0.24
125 0.24
126 0.24
127 0.24
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.25
135 0.22
136 0.23
137 0.2
138 0.22
139 0.18
140 0.18
141 0.19
142 0.16
143 0.15
144 0.15
145 0.18
146 0.17
147 0.16
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.06
162 0.07
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.2
171 0.25
172 0.27
173 0.29
174 0.33
175 0.31
176 0.32
177 0.31
178 0.3
179 0.24
180 0.21
181 0.2
182 0.18
183 0.16
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.09
189 0.07
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.08
197 0.14
198 0.17
199 0.19
200 0.21
201 0.23
202 0.26
203 0.27
204 0.28
205 0.23
206 0.21
207 0.2
208 0.18
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.18
218 0.19
219 0.22
220 0.21
221 0.24
222 0.27
223 0.3
224 0.33
225 0.33
226 0.33
227 0.3
228 0.29
229 0.26
230 0.22
231 0.22
232 0.2
233 0.23
234 0.22
235 0.22
236 0.22
237 0.22
238 0.24
239 0.23
240 0.21
241 0.22
242 0.25
243 0.28
244 0.31
245 0.39
246 0.46
247 0.53
248 0.6
249 0.65
250 0.72
251 0.78
252 0.84
253 0.83
254 0.83
255 0.83
256 0.84
257 0.84
258 0.76
259 0.68
260 0.61
261 0.59
262 0.51
263 0.49
264 0.42
265 0.35
266 0.32
267 0.31
268 0.27
269 0.21
270 0.19
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.16
280 0.15
281 0.17
282 0.2
283 0.21
284 0.21
285 0.27
286 0.31
287 0.32
288 0.31
289 0.28
290 0.25
291 0.26
292 0.25
293 0.22
294 0.17
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.09
302 0.1
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.23
314 0.23
315 0.22
316 0.19
317 0.2
318 0.19
319 0.22
320 0.23
321 0.2
322 0.25
323 0.26
324 0.27
325 0.3
326 0.35
327 0.33
328 0.38
329 0.41
330 0.41
331 0.41
332 0.41
333 0.37
334 0.31
335 0.3
336 0.23
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.21
341 0.25
342 0.33
343 0.33
344 0.38
345 0.45
346 0.49
347 0.55
348 0.61
349 0.63
350 0.62
351 0.68
352 0.63
353 0.63
354 0.55
355 0.49
356 0.4
357 0.33
358 0.29
359 0.22
360 0.23
361 0.18
362 0.18
363 0.19
364 0.2
365 0.27
366 0.26
367 0.27
368 0.27
369 0.27
370 0.29
371 0.29
372 0.28
373 0.24
374 0.23
375 0.23
376 0.2
377 0.17
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.12
382 0.11
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07