Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E286

Protein Details
Accession A0A178E286    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPRLRAKSRPRFQHRQSTNVHydrophilic
113-132HSCYRPRRTGERKRKSVRGCBasic
213-237LVTPQRLQHKRHRVALKRRRAEASKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-126ERKR
163-181KRLGPKRATKIRRFFGLSK
185-235VRKFVIRREVQPKKEGAKPYTKAPKIQRLVTPQRLQHKRHRVALKRRRAEA
260-266EARKRRA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014401  Ribosomal_S6_euk  
IPR001377  Ribosomal_S6e  
IPR018282  Ribosomal_S6e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01092  Ribosomal_S6e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00578  RIBOSOMAL_S6E  
Amino Acid Sequences MPRLRAKSRPRFQHRQSTNVAASTRHHDAAVKMKLNISYPNNGTQKLIEVEDERKLRVFMDRRMGQEVPGDSVGDEFKGYVFRITGGNDKQGFPMKQGVMHPTRVRLLLGDGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVGMDLSVLALSIVKKGDDDVPGLTDTVHPKRLGPKRATKIRRFFGLSKEDDVRKFVIRREVQPKKEGAKPYTKAPKIQRLVTPQRLQHKRHRVALKRRRAEASKDAANEYAQILSKRIGEAKAAHDEARKRRASSMRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.8
3 0.76
4 0.73
5 0.66
6 0.6
7 0.53
8 0.44
9 0.41
10 0.4
11 0.38
12 0.3
13 0.28
14 0.25
15 0.27
16 0.35
17 0.4
18 0.37
19 0.33
20 0.35
21 0.37
22 0.37
23 0.41
24 0.35
25 0.34
26 0.33
27 0.41
28 0.41
29 0.4
30 0.39
31 0.32
32 0.32
33 0.28
34 0.26
35 0.19
36 0.19
37 0.21
38 0.27
39 0.28
40 0.25
41 0.24
42 0.23
43 0.22
44 0.27
45 0.3
46 0.29
47 0.38
48 0.41
49 0.43
50 0.48
51 0.47
52 0.4
53 0.38
54 0.33
55 0.26
56 0.22
57 0.2
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.1
62 0.09
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.1
71 0.11
72 0.17
73 0.17
74 0.23
75 0.24
76 0.25
77 0.26
78 0.31
79 0.29
80 0.25
81 0.29
82 0.23
83 0.25
84 0.26
85 0.3
86 0.26
87 0.31
88 0.3
89 0.27
90 0.28
91 0.25
92 0.24
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.21
105 0.24
106 0.33
107 0.43
108 0.53
109 0.63
110 0.71
111 0.77
112 0.79
113 0.83
114 0.78
115 0.76
116 0.71
117 0.64
118 0.55
119 0.45
120 0.4
121 0.31
122 0.26
123 0.17
124 0.11
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.02
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.13
146 0.15
147 0.18
148 0.17
149 0.18
150 0.27
151 0.35
152 0.41
153 0.43
154 0.5
155 0.57
156 0.67
157 0.74
158 0.74
159 0.75
160 0.71
161 0.7
162 0.65
163 0.59
164 0.55
165 0.54
166 0.47
167 0.43
168 0.44
169 0.41
170 0.37
171 0.36
172 0.32
173 0.29
174 0.28
175 0.28
176 0.33
177 0.33
178 0.4
179 0.49
180 0.56
181 0.56
182 0.59
183 0.6
184 0.55
185 0.58
186 0.57
187 0.52
188 0.52
189 0.5
190 0.55
191 0.6
192 0.58
193 0.59
194 0.6
195 0.66
196 0.61
197 0.64
198 0.61
199 0.6
200 0.67
201 0.69
202 0.67
203 0.63
204 0.68
205 0.71
206 0.71
207 0.71
208 0.73
209 0.71
210 0.74
211 0.79
212 0.78
213 0.81
214 0.86
215 0.87
216 0.84
217 0.82
218 0.81
219 0.75
220 0.72
221 0.7
222 0.67
223 0.63
224 0.57
225 0.53
226 0.46
227 0.41
228 0.35
229 0.27
230 0.22
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.2
237 0.22
238 0.2
239 0.22
240 0.24
241 0.28
242 0.34
243 0.35
244 0.35
245 0.38
246 0.45
247 0.5
248 0.56
249 0.56
250 0.5
251 0.56