Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E537

Protein Details
Accession A0A178E537    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
430-455QKSKVSCVKPPRTPKRANSRGRTPHAHydrophilic
513-536SSLKREDSKLKRKRAESPARRGETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
520-533SKLKRKRAESPARR
Subcellular Location(s) mito 22, cyto 3.5, cyto_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
CDD cd06141  WRN_exo  
Amino Acid Sequences MAAPASVRTAGTSTTGSKPGQWPLAFCLQPPKAQQPSLQGYGFNSNHPPSRQWWSHELYRGPCGEKVEILYSKSKERSEEIAKQFLGQPILGFDMEWPMPWLDKRQTLQSKIGLIQIACEDKVALFHIGMHQGKTTADIIAPTLKQIIEDPTVGKVGVHILGADFSRLQQFFGLKPQGAVESSNLHRLVKYGSSKPEFVTTKMVKLATQVEEELGLPLFKGEVRTSNWSKPLSDEQIKYAAADAYAGFMLYHRMNAKRLTMNPVPPLPIHAERYPKGKTGKNDPILLDAGSGVLISSEDFFNVKITPSRPQQVQAKVVKAANPPTPKVPAQPLDHVSQRLYDVLVIRRSLLARQNNILTFRIISDAILQRIARAKPLDTEALLLVKGVGKFQVEKYGDAWLEVIALFFATNGMDASNSIPTNESSATKIQKSKVSCVKPPRTPKRANSRGRTPHASSTDSSPAFATPPPHVPQLHTGLSFNMGETSLNDEVQTEVIPLLDDSDDSLASLDFGSSLKREDSKLKRKRAESPARRGETASGADNKASDHTNNGAEQHPNAPLTPRSKISRNKLLAFSRQVAAKLPARPADGPPLVSEHTLELVVATKPTSQGELEKIPGIDTFLLACKQTNIDLLEKIKRFAPVTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.27
3 0.26
4 0.3
5 0.33
6 0.37
7 0.43
8 0.4
9 0.38
10 0.38
11 0.47
12 0.42
13 0.39
14 0.43
15 0.37
16 0.41
17 0.45
18 0.48
19 0.46
20 0.48
21 0.51
22 0.5
23 0.54
24 0.55
25 0.5
26 0.42
27 0.39
28 0.45
29 0.42
30 0.36
31 0.35
32 0.33
33 0.38
34 0.39
35 0.39
36 0.34
37 0.43
38 0.45
39 0.45
40 0.49
41 0.5
42 0.54
43 0.59
44 0.6
45 0.54
46 0.55
47 0.53
48 0.49
49 0.45
50 0.42
51 0.36
52 0.31
53 0.3
54 0.31
55 0.3
56 0.3
57 0.34
58 0.33
59 0.38
60 0.42
61 0.41
62 0.38
63 0.39
64 0.44
65 0.46
66 0.53
67 0.52
68 0.53
69 0.51
70 0.5
71 0.49
72 0.45
73 0.38
74 0.28
75 0.23
76 0.17
77 0.19
78 0.17
79 0.13
80 0.1
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.13
87 0.15
88 0.21
89 0.22
90 0.29
91 0.31
92 0.4
93 0.47
94 0.5
95 0.55
96 0.52
97 0.51
98 0.46
99 0.46
100 0.39
101 0.3
102 0.27
103 0.25
104 0.23
105 0.19
106 0.17
107 0.14
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.1
112 0.08
113 0.09
114 0.12
115 0.19
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.2
122 0.18
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.14
134 0.16
135 0.14
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.14
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.15
158 0.15
159 0.23
160 0.26
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.21
176 0.22
177 0.26
178 0.25
179 0.32
180 0.35
181 0.37
182 0.36
183 0.42
184 0.37
185 0.34
186 0.38
187 0.31
188 0.31
189 0.33
190 0.32
191 0.25
192 0.26
193 0.28
194 0.21
195 0.2
196 0.18
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.09
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.07
208 0.07
209 0.11
210 0.14
211 0.22
212 0.26
213 0.3
214 0.35
215 0.34
216 0.34
217 0.34
218 0.36
219 0.36
220 0.38
221 0.35
222 0.32
223 0.34
224 0.34
225 0.3
226 0.25
227 0.18
228 0.12
229 0.11
230 0.09
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.11
240 0.13
241 0.15
242 0.17
243 0.21
244 0.23
245 0.25
246 0.3
247 0.31
248 0.33
249 0.34
250 0.34
251 0.31
252 0.27
253 0.27
254 0.24
255 0.23
256 0.23
257 0.23
258 0.28
259 0.28
260 0.33
261 0.32
262 0.33
263 0.35
264 0.35
265 0.36
266 0.4
267 0.48
268 0.47
269 0.48
270 0.44
271 0.41
272 0.38
273 0.34
274 0.24
275 0.14
276 0.1
277 0.07
278 0.06
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.15
294 0.18
295 0.22
296 0.22
297 0.27
298 0.33
299 0.34
300 0.41
301 0.39
302 0.38
303 0.37
304 0.37
305 0.36
306 0.31
307 0.3
308 0.28
309 0.27
310 0.27
311 0.26
312 0.28
313 0.25
314 0.25
315 0.26
316 0.26
317 0.26
318 0.29
319 0.3
320 0.29
321 0.3
322 0.29
323 0.24
324 0.2
325 0.18
326 0.14
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.13
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.16
337 0.21
338 0.22
339 0.22
340 0.24
341 0.26
342 0.27
343 0.28
344 0.26
345 0.2
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.11
350 0.09
351 0.12
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.13
357 0.19
358 0.19
359 0.18
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.2
364 0.19
365 0.14
366 0.15
367 0.13
368 0.12
369 0.11
370 0.09
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.09
378 0.1
379 0.18
380 0.17
381 0.18
382 0.18
383 0.22
384 0.21
385 0.2
386 0.2
387 0.11
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.04
402 0.05
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.17
413 0.2
414 0.23
415 0.27
416 0.28
417 0.33
418 0.35
419 0.4
420 0.45
421 0.47
422 0.5
423 0.57
424 0.62
425 0.66
426 0.74
427 0.76
428 0.76
429 0.79
430 0.81
431 0.82
432 0.83
433 0.84
434 0.81
435 0.81
436 0.81
437 0.8
438 0.78
439 0.7
440 0.68
441 0.62
442 0.57
443 0.47
444 0.43
445 0.44
446 0.37
447 0.33
448 0.26
449 0.22
450 0.21
451 0.21
452 0.19
453 0.14
454 0.19
455 0.22
456 0.25
457 0.25
458 0.26
459 0.3
460 0.33
461 0.33
462 0.28
463 0.26
464 0.23
465 0.25
466 0.22
467 0.17
468 0.12
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.13
479 0.12
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.09
502 0.11
503 0.13
504 0.16
505 0.25
506 0.36
507 0.46
508 0.55
509 0.63
510 0.69
511 0.72
512 0.8
513 0.81
514 0.82
515 0.81
516 0.83
517 0.83
518 0.79
519 0.75
520 0.66
521 0.57
522 0.5
523 0.43
524 0.37
525 0.31
526 0.27
527 0.27
528 0.26
529 0.24
530 0.21
531 0.21
532 0.16
533 0.15
534 0.18
535 0.2
536 0.21
537 0.23
538 0.24
539 0.23
540 0.24
541 0.24
542 0.23
543 0.22
544 0.21
545 0.23
546 0.25
547 0.28
548 0.31
549 0.34
550 0.37
551 0.45
552 0.53
553 0.59
554 0.63
555 0.66
556 0.67
557 0.69
558 0.7
559 0.69
560 0.66
561 0.6
562 0.53
563 0.48
564 0.43
565 0.38
566 0.38
567 0.36
568 0.34
569 0.36
570 0.37
571 0.38
572 0.39
573 0.39
574 0.42
575 0.39
576 0.35
577 0.31
578 0.32
579 0.29
580 0.28
581 0.26
582 0.18
583 0.17
584 0.16
585 0.14
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.14
594 0.16
595 0.15
596 0.18
597 0.23
598 0.26
599 0.27
600 0.29
601 0.28
602 0.27
603 0.25
604 0.24
605 0.19
606 0.15
607 0.14
608 0.14
609 0.16
610 0.16
611 0.16
612 0.16
613 0.17
614 0.18
615 0.21
616 0.21
617 0.23
618 0.27
619 0.32
620 0.39
621 0.39
622 0.39
623 0.37
624 0.39