FuNGI

A0A178EMH3

Protein Details

Accession

A0A178EMH3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
600-624	LGHGRAKAGKTTKKQKRGDEEGPAD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
604-616	RAKAGKTTKKQKR

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 10, cyto_nucl 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019622 Rrn9_dom
Pfam	View protein in Pfam PF10680 RRN9

Amino Acid Sequences

MSLFGGSLPRSTQPARSPTSTASPPPSVEEPTDLQNAQIHDNADALDESDETDDLSTDSDSEIEESDAAAQTRPNRFGGKPQTWKAYTAPDRQIAASLEQMQDSDLAAHLFNAHFLKRQAQQPAEQIAGLPNWHSRESWLKKGTELEYTDVSGLVQTQLIPSKDWTAWPIPPAQLPGSDMLTRTDGPDGDTDEWEIGGVSAHDAGDDMREEILATFLRLAKDRWESRETEEPTVRGRDHVTVSRSRSRSTSALSTKPRRSASQTDVDMEGDDLRASDEDEDKLGGTVGKKRGRKIQAETVAKPTVMTDDSKAQRVLQPTIQSLLSNLDDLALAVSRTRLNHFARTASSERSSLSEFTSDTDSVRPSSQPLSRPTSRNARSRNTSARPTSRHKATAARSTSSRRQKQGTEFDDDESDAYESRSKSQARKRQRSGSITSMGSVSTTRDESSRAGLMDWSEVLGLAAVKGWDEKVIARTAQRCAALFGESMSFVPLDENQTTKNVLEPVHYTPSSIPAPSVLSATTTSASKRPFFQLGTLRCPHPECYGHRKDFALPYRVVEHCMRVHGYDPRTNNSENEDRLHGGVHIDGFMQPVTLKPGWLGHGRAKAGKTTKKQKRGDEEGPADAIMTTEGEALSDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.45
3	0.47
4	0.49
5	0.47
6	0.53
7	0.5
8	0.48
9	0.47
10	0.44
11	0.41
12	0.43
13	0.42
14	0.38
15	0.35
16	0.34
17	0.29
18	0.31
19	0.34
20	0.29
21	0.26
22	0.27
23	0.27
24	0.25
25	0.26
26	0.22
27	0.18
28	0.19
29	0.18
30	0.16
31	0.14
32	0.12
33	0.1
34	0.09
35	0.09
36	0.09
37	0.09
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.07
42	0.08
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.08
49	0.09
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.13
58	0.19
59	0.25
60	0.28
61	0.29
62	0.32
63	0.33
64	0.42
65	0.5
66	0.53
67	0.56
68	0.59
69	0.65
70	0.62
71	0.64
72	0.56
73	0.57
74	0.54
75	0.54
76	0.54
77	0.49
78	0.49
79	0.47
80	0.47
81	0.38
82	0.32
83	0.28
84	0.25
85	0.21
86	0.2
87	0.19
88	0.17
89	0.15
90	0.14
91	0.1
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.08
97	0.08
98	0.11
99	0.12
100	0.13
101	0.15
102	0.17
103	0.22
104	0.26
105	0.33
106	0.38
107	0.39
108	0.42
109	0.44
110	0.47
111	0.42
112	0.36
113	0.31
114	0.24
115	0.22
116	0.18
117	0.14
118	0.14
119	0.16
120	0.17
121	0.17
122	0.18
123	0.28
124	0.34
125	0.42
126	0.44
127	0.42
128	0.43
129	0.48
130	0.47
131	0.43
132	0.38
133	0.32
134	0.27
135	0.28
136	0.25
137	0.2
138	0.18
139	0.11
140	0.1
141	0.07
142	0.06
143	0.05
144	0.07
145	0.11
146	0.12
147	0.13
148	0.14
149	0.17
150	0.18
151	0.19
152	0.21
153	0.2
154	0.21
155	0.22
156	0.24
157	0.21
158	0.22
159	0.24
160	0.21
161	0.18
162	0.18
163	0.18
164	0.17
165	0.17
166	0.16
167	0.15
168	0.16
169	0.15
170	0.15
171	0.15
172	0.12
173	0.13
174	0.14
175	0.16
176	0.15
177	0.15
178	0.15
179	0.13
180	0.13
181	0.11
182	0.1
183	0.06
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.12
207	0.15
208	0.23
209	0.26
210	0.3
211	0.31
212	0.32
213	0.36
214	0.45
215	0.43
216	0.41
217	0.4
218	0.35
219	0.35
220	0.37
221	0.32
222	0.24
223	0.23
224	0.2
225	0.21
226	0.25
227	0.26
228	0.28
229	0.33
230	0.4
231	0.39
232	0.38
233	0.36
234	0.35
235	0.34
236	0.31
237	0.34
238	0.31
239	0.37
240	0.45
241	0.51
242	0.52
243	0.56
244	0.55
245	0.49
246	0.51
247	0.5
248	0.47
249	0.47
250	0.44
251	0.39
252	0.37
253	0.35
254	0.28
255	0.22
256	0.17
257	0.09
258	0.07
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.13
274	0.2
275	0.26
276	0.29
277	0.31
278	0.4
279	0.45
280	0.49
281	0.5
282	0.52
283	0.55
284	0.57
285	0.56
286	0.53
287	0.47
288	0.41
289	0.35
290	0.26
291	0.18
292	0.14
293	0.13
294	0.09
295	0.16
296	0.17
297	0.19
298	0.19
299	0.18
300	0.2
301	0.22
302	0.23
303	0.19
304	0.19
305	0.18
306	0.19
307	0.19
308	0.16
309	0.13
310	0.13
311	0.11
312	0.09
313	0.08
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.04
319	0.04
320	0.03
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.09
325	0.15
326	0.17
327	0.22
328	0.23
329	0.23
330	0.23
331	0.28
332	0.28
333	0.25
334	0.24
335	0.2
336	0.2
337	0.2
338	0.2
339	0.16
340	0.14
341	0.12
342	0.11
343	0.12
344	0.14
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.11
353	0.15
354	0.18
355	0.22
356	0.26
357	0.32
358	0.36
359	0.39
360	0.42
361	0.48
362	0.5
363	0.53
364	0.54
365	0.54
366	0.55
367	0.59
368	0.63
369	0.58
370	0.59
371	0.58
372	0.59
373	0.58
374	0.59
375	0.6
376	0.56
377	0.53
378	0.49
379	0.5
380	0.48
381	0.51
382	0.47
383	0.42
384	0.4
385	0.43
386	0.5
387	0.53
388	0.54
389	0.5
390	0.51
391	0.54
392	0.59
393	0.63
394	0.57
395	0.54
396	0.49
397	0.45
398	0.42
399	0.36
400	0.28
401	0.19
402	0.16
403	0.09
404	0.09
405	0.11
406	0.11
407	0.13
408	0.19
409	0.21
410	0.29
411	0.39
412	0.48
413	0.55
414	0.66
415	0.71
416	0.75
417	0.8
418	0.78
419	0.74
420	0.7
421	0.64
422	0.54
423	0.46
424	0.37
425	0.28
426	0.23
427	0.17
428	0.12
429	0.09
430	0.1
431	0.1
432	0.1
433	0.12
434	0.13
435	0.15
436	0.16
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.12
443	0.09
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.08
458	0.1
459	0.13
460	0.14
461	0.18
462	0.21
463	0.24
464	0.27
465	0.27
466	0.25
467	0.24
468	0.24
469	0.21
470	0.18
471	0.16
472	0.12
473	0.11
474	0.11
475	0.1
476	0.08
477	0.07
478	0.08
479	0.08
480	0.12
481	0.12
482	0.13
483	0.14
484	0.16
485	0.17
486	0.16
487	0.18
488	0.16
489	0.16
490	0.17
491	0.19
492	0.23
493	0.28
494	0.28
495	0.26
496	0.24
497	0.29
498	0.28
499	0.25
500	0.2
501	0.15
502	0.17
503	0.16
504	0.17
505	0.11
506	0.11
507	0.12
508	0.13
509	0.13
510	0.12
511	0.13
512	0.17
513	0.21
514	0.21
515	0.24
516	0.28
517	0.31
518	0.31
519	0.36
520	0.41
521	0.42
522	0.48
523	0.48
524	0.45
525	0.44
526	0.45
527	0.41
528	0.38
529	0.39
530	0.39
531	0.46
532	0.54
533	0.55
534	0.56
535	0.55
536	0.54
537	0.56
538	0.57
539	0.53
540	0.44
541	0.42
542	0.45
543	0.44
544	0.43
545	0.36
546	0.33
547	0.29
548	0.32
549	0.3
550	0.26
551	0.3
552	0.33
553	0.37
554	0.38
555	0.4
556	0.42
557	0.45
558	0.45
559	0.43
560	0.42
561	0.44
562	0.4
563	0.4
564	0.37
565	0.35
566	0.33
567	0.32
568	0.25
569	0.19
570	0.18
571	0.15
572	0.12
573	0.11
574	0.11
575	0.11
576	0.1
577	0.1
578	0.08
579	0.09
580	0.15
581	0.15
582	0.15
583	0.15
584	0.18
585	0.22
586	0.26
587	0.3
588	0.3
589	0.37
590	0.4
591	0.44
592	0.42
593	0.46
594	0.51
595	0.56
596	0.59
597	0.63
598	0.71
599	0.76
600	0.83
601	0.85
602	0.86
603	0.86
604	0.83
605	0.83
606	0.77
607	0.7
608	0.63
609	0.53
610	0.43
611	0.33
612	0.25
613	0.15
614	0.11
615	0.08
616	0.07
617	0.07

A0A178EMH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer