Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EFA6

Protein Details
Accession A0A178EFA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-50ASFSRSAHLRRHQKTHRTEKPYVCQFCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 5, mito 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
Amino Acid Sequences MSTQKQHSYNLLMPAPLSCPQCQASFSRSAHLRRHQKTHRTEKPYVCQFCDVASSRKDVIVRHTRNFHPEAAPSASKRTRATARTDDTHPASASSSPSSERSPECVEVGQATRQPQAHTLGHSCSPERAPAPSQLEAGVPASHIHQEQLAIDLSQSAITVADQIQGPCQQVRLPSEPNQCEPPVQNQALAQDPNQHGGPESRQDQSGRLPVMSHEMDPASLDFAFDFDLLDFPTTAFVGVALDTNTDLPALSPKDLLNQFVSDISPNSQIPRSGAHLENQKLPPSIEHAAQITCPSVGDSSGDPDYAGAVVNLQTYHPDNAKSTFHFPSKRIVYRFVDAFFRHMAPHMPILHQPTFSIASTPCKYVFEYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.29
4 0.28
5 0.22
6 0.24
7 0.26
8 0.27
9 0.29
10 0.29
11 0.29
12 0.34
13 0.34
14 0.38
15 0.43
16 0.48
17 0.54
18 0.61
19 0.66
20 0.64
21 0.74
22 0.76
23 0.79
24 0.83
25 0.86
26 0.86
27 0.84
28 0.86
29 0.84
30 0.84
31 0.85
32 0.79
33 0.71
34 0.64
35 0.56
36 0.48
37 0.46
38 0.39
39 0.34
40 0.31
41 0.31
42 0.29
43 0.32
44 0.32
45 0.27
46 0.33
47 0.39
48 0.43
49 0.46
50 0.51
51 0.52
52 0.57
53 0.58
54 0.52
55 0.44
56 0.4
57 0.38
58 0.37
59 0.37
60 0.32
61 0.38
62 0.37
63 0.38
64 0.38
65 0.39
66 0.41
67 0.42
68 0.48
69 0.49
70 0.52
71 0.52
72 0.54
73 0.54
74 0.49
75 0.48
76 0.4
77 0.32
78 0.27
79 0.24
80 0.22
81 0.18
82 0.16
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.2
87 0.2
88 0.23
89 0.25
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.22
94 0.21
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.19
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.22
103 0.26
104 0.25
105 0.25
106 0.26
107 0.25
108 0.26
109 0.26
110 0.24
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.19
115 0.19
116 0.18
117 0.24
118 0.27
119 0.26
120 0.26
121 0.23
122 0.22
123 0.2
124 0.19
125 0.12
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.1
157 0.12
158 0.16
159 0.19
160 0.21
161 0.27
162 0.35
163 0.36
164 0.37
165 0.37
166 0.34
167 0.31
168 0.29
169 0.26
170 0.25
171 0.23
172 0.22
173 0.19
174 0.2
175 0.21
176 0.21
177 0.16
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.16
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.23
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.19
199 0.19
200 0.16
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.19
242 0.2
243 0.22
244 0.19
245 0.18
246 0.18
247 0.17
248 0.18
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.2
260 0.22
261 0.23
262 0.26
263 0.32
264 0.34
265 0.4
266 0.4
267 0.39
268 0.35
269 0.35
270 0.3
271 0.28
272 0.28
273 0.22
274 0.22
275 0.2
276 0.19
277 0.19
278 0.19
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.1
302 0.12
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.2
307 0.24
308 0.28
309 0.29
310 0.32
311 0.34
312 0.4
313 0.43
314 0.42
315 0.48
316 0.53
317 0.57
318 0.55
319 0.56
320 0.54
321 0.55
322 0.57
323 0.49
324 0.47
325 0.4
326 0.4
327 0.36
328 0.32
329 0.27
330 0.25
331 0.26
332 0.23
333 0.28
334 0.27
335 0.26
336 0.3
337 0.36
338 0.37
339 0.34
340 0.31
341 0.29
342 0.3
343 0.28
344 0.27
345 0.22
346 0.28
347 0.3
348 0.33
349 0.3
350 0.28