Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E0C2

Protein Details
Accession A0A178E0C2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-353RSESMRNRQRDYKPRRRGSDEDBasic
405-426FEMMSRSKSRRRSPARSTKSGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-430SKSRRRSPARSTKSGGSNRA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF00564  PB1  
PF00515  TPR_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSLKQEIETWVAALGSYDNNDFEEALKTFDGISDTSKILFNCGVIHATLGEHEKAVDCYQRAVRLDQYLAVAYFQQGVSNFLMGDFEEALANFNDTLLYLRGNNNIDYEQLGLKFKLYSCEVLFNRGLCYIYLQQRDAGLQDLSFAAKEKVVPDHDVIDEAIREEAEGYTVFSIPVGIVYRPNEAKVKNLKTKDYLGKARLVAASDRANAFTGFAGAEIKRGGQQAKDDRPEEKLSFAATNLVKPELQSRARQQSEPPMNRNMFPPTPPPESDRRSGGSGDAPMTRAQSVRGGGPKPQPLNLGRAAFDQQGGNEPRRQGTQRSASERPPPTRSESMRNRQRDYKPRRRGSDEDIIDDYYDNEDNYQPSRGSRGAYTRSKQGRRPAYIEEEEEDDYDGSDLDDAEFEMMSRSKSRRRSPARSTKSGGSNRAVGGKIRVKVHSGDTRYVFITQDQTIREFWQAIREKFGVRNNFKVEIKDDGDMITMADQDDLDMAIQTAKSVARKDGSDMAKMEVC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.16
11 0.14
12 0.16
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.12
19 0.15
20 0.15
21 0.16
22 0.17
23 0.2
24 0.19
25 0.2
26 0.2
27 0.17
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.14
32 0.14
33 0.12
34 0.11
35 0.13
36 0.15
37 0.14
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.16
42 0.18
43 0.21
44 0.18
45 0.23
46 0.26
47 0.32
48 0.32
49 0.33
50 0.35
51 0.34
52 0.34
53 0.3
54 0.29
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.16
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.09
71 0.11
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.18
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.2
106 0.19
107 0.28
108 0.28
109 0.31
110 0.32
111 0.28
112 0.27
113 0.25
114 0.24
115 0.15
116 0.19
117 0.2
118 0.26
119 0.29
120 0.28
121 0.28
122 0.28
123 0.28
124 0.25
125 0.21
126 0.14
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.14
138 0.16
139 0.18
140 0.18
141 0.2
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.14
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.09
166 0.11
167 0.15
168 0.15
169 0.17
170 0.2
171 0.19
172 0.26
173 0.33
174 0.4
175 0.44
176 0.47
177 0.48
178 0.47
179 0.54
180 0.53
181 0.51
182 0.49
183 0.44
184 0.44
185 0.42
186 0.4
187 0.35
188 0.29
189 0.22
190 0.19
191 0.19
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.17
212 0.24
213 0.31
214 0.35
215 0.34
216 0.34
217 0.37
218 0.4
219 0.34
220 0.27
221 0.21
222 0.18
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.12
231 0.12
232 0.15
233 0.16
234 0.18
235 0.21
236 0.26
237 0.34
238 0.36
239 0.36
240 0.35
241 0.39
242 0.46
243 0.47
244 0.44
245 0.42
246 0.41
247 0.41
248 0.42
249 0.37
250 0.28
251 0.25
252 0.27
253 0.25
254 0.28
255 0.28
256 0.3
257 0.33
258 0.35
259 0.36
260 0.33
261 0.3
262 0.28
263 0.27
264 0.25
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.17
279 0.17
280 0.21
281 0.26
282 0.31
283 0.29
284 0.3
285 0.31
286 0.28
287 0.32
288 0.31
289 0.28
290 0.23
291 0.23
292 0.24
293 0.2
294 0.19
295 0.15
296 0.11
297 0.17
298 0.19
299 0.19
300 0.2
301 0.21
302 0.21
303 0.25
304 0.27
305 0.24
306 0.29
307 0.36
308 0.4
309 0.46
310 0.48
311 0.48
312 0.55
313 0.58
314 0.55
315 0.49
316 0.46
317 0.45
318 0.49
319 0.49
320 0.5
321 0.53
322 0.59
323 0.65
324 0.68
325 0.66
326 0.68
327 0.73
328 0.74
329 0.75
330 0.76
331 0.77
332 0.8
333 0.82
334 0.81
335 0.77
336 0.73
337 0.73
338 0.63
339 0.56
340 0.49
341 0.42
342 0.35
343 0.3
344 0.23
345 0.15
346 0.13
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.17
356 0.17
357 0.18
358 0.2
359 0.25
360 0.31
361 0.38
362 0.4
363 0.46
364 0.54
365 0.58
366 0.61
367 0.63
368 0.65
369 0.63
370 0.64
371 0.61
372 0.59
373 0.56
374 0.52
375 0.44
376 0.37
377 0.33
378 0.29
379 0.24
380 0.16
381 0.13
382 0.11
383 0.09
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.14
397 0.18
398 0.26
399 0.35
400 0.44
401 0.52
402 0.62
403 0.7
404 0.77
405 0.83
406 0.85
407 0.83
408 0.8
409 0.76
410 0.76
411 0.73
412 0.68
413 0.59
414 0.54
415 0.48
416 0.47
417 0.41
418 0.33
419 0.34
420 0.34
421 0.36
422 0.36
423 0.36
424 0.34
425 0.36
426 0.42
427 0.43
428 0.41
429 0.42
430 0.41
431 0.42
432 0.4
433 0.39
434 0.32
435 0.26
436 0.26
437 0.22
438 0.24
439 0.23
440 0.24
441 0.24
442 0.25
443 0.25
444 0.23
445 0.21
446 0.27
447 0.33
448 0.32
449 0.37
450 0.37
451 0.38
452 0.42
453 0.5
454 0.51
455 0.48
456 0.55
457 0.53
458 0.58
459 0.57
460 0.55
461 0.5
462 0.46
463 0.44
464 0.36
465 0.32
466 0.26
467 0.25
468 0.21
469 0.18
470 0.12
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.09
485 0.12
486 0.15
487 0.18
488 0.23
489 0.25
490 0.26
491 0.31
492 0.38
493 0.38
494 0.4
495 0.39