Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DZC9

Protein Details
Accession A0A178DZC9    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-192PDVAGNRQREPRRRQPPKRDVLDYHydrophilic
216-235DSGADRRRPRRNGRDTRDTRBasic
297-326ENSYAGRRRYRSRSRSRNNRRRREASGDRWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-185PRRRQPP
221-244RRRPRRNGRDTRDTREERGRGGRL
303-320RRRYRSRSRSRNNRRRRE
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDTDMMDAGYDIEIDVGPRIESDAQPPQQAIEQNTTAERGIPAAYLEDLGDQKAWPESLNLQGVNNFDPTDPTYYAMEHCGANQRVKQLRWVNDSSVNLEFYSAEDAAAALNILTHPEVNPNSLAPQEGRRAKPFSKHPDVVLMVRESNSGDQKPKGAANRSNYYKNNPDVAGNRQREPRRRQPPKRDVLDYGEDDPGRRDGARRRRSEDESMNDDSGADRRRPRRNGRDTRDTREERGRGGRLGRDSDSGRLKGDVDSYRPRSTSPHESRFGRLRGRSASPASDEEGDGRYGFAEENSYAGRRRYRSRSRSRNNRRRREASGDRWTHDRANYDSNGTPGGRWQKDSAFVDSSPMGNHRRSDAMDAGSRGGGSSLLSRMTKDGQPLGGKPKRSLADRITRDDENGDSTYGRLKGDDRDPWTTEFPEPARPRGLADRMTRNDDSGRNLEGINIRGMASNNESAGGINIRGMANST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.08
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.1
7 0.13
8 0.14
9 0.19
10 0.27
11 0.29
12 0.31
13 0.31
14 0.3
15 0.32
16 0.35
17 0.33
18 0.3
19 0.29
20 0.29
21 0.3
22 0.3
23 0.26
24 0.22
25 0.19
26 0.14
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.1
39 0.11
40 0.13
41 0.13
42 0.11
43 0.12
44 0.14
45 0.2
46 0.24
47 0.23
48 0.22
49 0.24
50 0.26
51 0.25
52 0.24
53 0.18
54 0.14
55 0.16
56 0.17
57 0.2
58 0.19
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.21
63 0.21
64 0.2
65 0.15
66 0.16
67 0.23
68 0.25
69 0.28
70 0.3
71 0.36
72 0.41
73 0.42
74 0.49
75 0.48
76 0.53
77 0.55
78 0.56
79 0.52
80 0.51
81 0.52
82 0.46
83 0.39
84 0.33
85 0.26
86 0.23
87 0.19
88 0.13
89 0.16
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.16
112 0.12
113 0.16
114 0.23
115 0.29
116 0.32
117 0.36
118 0.41
119 0.43
120 0.49
121 0.55
122 0.56
123 0.58
124 0.56
125 0.52
126 0.53
127 0.52
128 0.46
129 0.4
130 0.32
131 0.23
132 0.22
133 0.21
134 0.16
135 0.16
136 0.19
137 0.18
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.23
142 0.26
143 0.29
144 0.32
145 0.35
146 0.39
147 0.47
148 0.49
149 0.55
150 0.53
151 0.53
152 0.52
153 0.49
154 0.45
155 0.38
156 0.36
157 0.32
158 0.38
159 0.42
160 0.38
161 0.39
162 0.43
163 0.5
164 0.56
165 0.61
166 0.64
167 0.65
168 0.74
169 0.81
170 0.84
171 0.88
172 0.89
173 0.86
174 0.79
175 0.71
176 0.65
177 0.6
178 0.51
179 0.42
180 0.36
181 0.29
182 0.26
183 0.23
184 0.18
185 0.14
186 0.12
187 0.14
188 0.2
189 0.31
190 0.4
191 0.43
192 0.48
193 0.54
194 0.59
195 0.61
196 0.59
197 0.54
198 0.5
199 0.48
200 0.43
201 0.36
202 0.31
203 0.24
204 0.21
205 0.18
206 0.16
207 0.19
208 0.27
209 0.36
210 0.44
211 0.53
212 0.61
213 0.69
214 0.77
215 0.79
216 0.82
217 0.79
218 0.78
219 0.78
220 0.7
221 0.62
222 0.59
223 0.53
224 0.44
225 0.45
226 0.39
227 0.31
228 0.31
229 0.3
230 0.25
231 0.27
232 0.25
233 0.22
234 0.22
235 0.24
236 0.26
237 0.23
238 0.21
239 0.19
240 0.19
241 0.16
242 0.2
243 0.17
244 0.18
245 0.24
246 0.29
247 0.3
248 0.29
249 0.29
250 0.28
251 0.32
252 0.39
253 0.39
254 0.42
255 0.46
256 0.47
257 0.51
258 0.54
259 0.53
260 0.48
261 0.42
262 0.38
263 0.37
264 0.38
265 0.38
266 0.33
267 0.31
268 0.27
269 0.27
270 0.24
271 0.21
272 0.18
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.11
288 0.13
289 0.19
290 0.21
291 0.28
292 0.37
293 0.47
294 0.57
295 0.66
296 0.75
297 0.8
298 0.88
299 0.92
300 0.93
301 0.94
302 0.94
303 0.93
304 0.88
305 0.84
306 0.83
307 0.81
308 0.79
309 0.79
310 0.72
311 0.65
312 0.62
313 0.57
314 0.51
315 0.43
316 0.37
317 0.3
318 0.31
319 0.3
320 0.3
321 0.29
322 0.26
323 0.26
324 0.22
325 0.19
326 0.19
327 0.27
328 0.25
329 0.26
330 0.28
331 0.27
332 0.35
333 0.37
334 0.36
335 0.3
336 0.28
337 0.29
338 0.27
339 0.26
340 0.19
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.21
345 0.2
346 0.23
347 0.23
348 0.27
349 0.26
350 0.26
351 0.27
352 0.27
353 0.26
354 0.23
355 0.21
356 0.17
357 0.13
358 0.1
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.15
366 0.18
367 0.2
368 0.21
369 0.23
370 0.24
371 0.27
372 0.3
373 0.38
374 0.39
375 0.4
376 0.38
377 0.43
378 0.43
379 0.44
380 0.48
381 0.46
382 0.52
383 0.55
384 0.6
385 0.58
386 0.53
387 0.51
388 0.46
389 0.39
390 0.32
391 0.28
392 0.22
393 0.17
394 0.17
395 0.2
396 0.2
397 0.19
398 0.16
399 0.17
400 0.22
401 0.29
402 0.36
403 0.37
404 0.41
405 0.43
406 0.46
407 0.48
408 0.44
409 0.39
410 0.37
411 0.33
412 0.38
413 0.39
414 0.39
415 0.39
416 0.37
417 0.39
418 0.41
419 0.45
420 0.42
421 0.46
422 0.53
423 0.53
424 0.6
425 0.57
426 0.52
427 0.51
428 0.47
429 0.46
430 0.39
431 0.37
432 0.31
433 0.3
434 0.32
435 0.3
436 0.29
437 0.24
438 0.22
439 0.2
440 0.21
441 0.22
442 0.21
443 0.21
444 0.22
445 0.2
446 0.2
447 0.19
448 0.17
449 0.19
450 0.17
451 0.13
452 0.11
453 0.14
454 0.13