FuNGI

A0A178EMJ9

Protein Details

Accession

A0A178EMJ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-34	HAALRYKTKRDPQSYRDDFN	Hydrophilic
256-295	HQAGINKKSKKKERDLKKAAATVKKKEKKKNAPHPLNFSA	Hydrophilic
563-588	DEKEKDKDKAKQPPTKKAKLTRTPSA	Basic
685-724	RETNHQSTTAKRKEKKEAEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGK	Hydrophilic
739-758	TLQGHVERKKRGGKRGNKGN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
260-287	INKKSKKKERDLKKAAATVKKKEKKKNA
570-580	DKAKQPPTKKA
694-758	AKRKEKKEAEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKNKRSLGDVKRTLQGHVERKKRGGKRGNKGN

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MKRKVGALEKIEADHAALRYKTKRDPQSYRDDFNNQYQQYETLRDLFLQNPGATDSGLVALKDLIEFISHVADCYPDLTAQFPGDLTQILLQHHDVLEYDLRDKIVGSLVLLKNKDVIDSITLLNTLFPILIATPSKSLRQLLFSKILSDLRSSNAKSTNHKLNRTIQTVLYNLLDSDKESPKGIWAVKITRELWKRQIWTDARAVEVMRLAALSENEKVITGGVRFFLGGDKEREDAADESSDDDNDVDMARLRHQAGINKKSKKKERDLKKAAATVKKKEKKKNAPHPLNFSAFHLLHDPQGFAETLFSKHLQNSKSKLQLESKLLILQLVSRLVGLHKLTVLSLYSYFLKHLTPRQASVTSYLACLAQATHNYVPPDVLEPLVQKIANEFVSEASASEVAAAGLNAIREICARQPLAMTDTLLQDLVMYRKSKDKGTMMAAKGLLSLYREVGAELLHKRDRGKDAAMGIRAGTIQERRYGEEAIGEIEGIELLEKWKEEERRKKMEAAGLDPDADVDVELDSEEDWKKWDVESDEDSDDSGGWINVESDGEDIQISDSEDEKEKDKDKAKQPPTKKAKLTRTPSAPTTTTKDATQPTDPAAAAKSITKLLTTTILTPADLKQLQTLRQTTTITTSLASHKRAQLLAARHTDEPITASTIELAASLGKKSTKEEKIAMAKADRETNHQSTTAKRKEKKEAEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKNKRSLGDVKRTLQGHVERKKRGGKRGNKGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.23
3	0.23
4	0.22
5	0.27
6	0.32
7	0.38
8	0.46
9	0.51
10	0.6
11	0.65
12	0.73
13	0.74
14	0.79
15	0.8
16	0.77
17	0.74
18	0.7
19	0.64
20	0.64
21	0.66
22	0.56
23	0.5
24	0.46
25	0.43
26	0.4
27	0.39
28	0.32
29	0.26
30	0.26
31	0.26
32	0.26
33	0.25
34	0.26
35	0.27
36	0.24
37	0.22
38	0.22
39	0.22
40	0.19
41	0.17
42	0.13
43	0.12
44	0.12
45	0.11
46	0.1
47	0.1
48	0.1
49	0.1
50	0.09
51	0.07
52	0.06
53	0.07
54	0.07
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.12
62	0.12
63	0.09
64	0.09
65	0.11
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.1
74	0.11
75	0.13
76	0.13
77	0.15
78	0.15
79	0.16
80	0.16
81	0.15
82	0.13
83	0.14
84	0.17
85	0.16
86	0.17
87	0.17
88	0.17
89	0.16
90	0.16
91	0.14
92	0.14
93	0.13
94	0.12
95	0.2
96	0.22
97	0.28
98	0.28
99	0.27
100	0.28
101	0.27
102	0.27
103	0.19
104	0.18
105	0.14
106	0.16
107	0.17
108	0.13
109	0.14
110	0.13
111	0.12
112	0.1
113	0.08
114	0.06
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.08
119	0.1
120	0.11
121	0.14
122	0.16
123	0.19
124	0.2
125	0.23
126	0.22
127	0.27
128	0.29
129	0.31
130	0.36
131	0.34
132	0.33
133	0.33
134	0.34
135	0.29
136	0.28
137	0.23
138	0.2
139	0.26
140	0.26
141	0.28
142	0.32
143	0.35
144	0.39
145	0.44
146	0.52
147	0.53
148	0.57
149	0.58
150	0.6
151	0.64
152	0.62
153	0.58
154	0.49
155	0.45
156	0.41
157	0.37
158	0.29
159	0.21
160	0.17
161	0.16
162	0.14
163	0.11
164	0.15
165	0.17
166	0.17
167	0.18
168	0.18
169	0.19
170	0.24
171	0.24
172	0.23
173	0.24
174	0.27
175	0.3
176	0.35
177	0.34
178	0.37
179	0.41
180	0.42
181	0.44
182	0.46
183	0.46
184	0.43
185	0.51
186	0.45
187	0.45
188	0.46
189	0.4
190	0.35
191	0.33
192	0.31
193	0.22
194	0.2
195	0.15
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.09
202	0.08
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.08
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.1
216	0.11
217	0.13
218	0.14
219	0.16
220	0.16
221	0.16
222	0.16
223	0.17
224	0.15
225	0.14
226	0.13
227	0.11
228	0.13
229	0.14
230	0.13
231	0.11
232	0.1
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.05
237	0.07
238	0.08
239	0.1
240	0.13
241	0.13
242	0.17
243	0.19
244	0.25
245	0.32
246	0.41
247	0.47
248	0.54
249	0.59
250	0.65
251	0.72
252	0.75
253	0.77
254	0.77
255	0.79
256	0.82
257	0.84
258	0.82
259	0.78
260	0.75
261	0.71
262	0.7
263	0.65
264	0.62
265	0.65
266	0.65
267	0.68
268	0.71
269	0.76
270	0.78
271	0.84
272	0.86
273	0.86
274	0.89
275	0.86
276	0.85
277	0.79
278	0.72
279	0.61
280	0.52
281	0.46
282	0.35
283	0.3
284	0.25
285	0.2
286	0.19
287	0.19
288	0.17
289	0.11
290	0.12
291	0.11
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.14
300	0.19
301	0.2
302	0.24
303	0.28
304	0.33
305	0.39
306	0.39
307	0.4
308	0.4
309	0.43
310	0.42
311	0.38
312	0.33
313	0.27
314	0.25
315	0.22
316	0.17
317	0.12
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.09
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.07
330	0.08
331	0.08
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.11
341	0.15
342	0.22
343	0.22
344	0.23
345	0.26
346	0.27
347	0.26
348	0.27
349	0.24
350	0.17
351	0.16
352	0.15
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.1
360	0.11
361	0.13
362	0.13
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.13
367	0.09
368	0.09
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.1
373	0.1
374	0.08
375	0.08
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.07
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.1
405	0.11
406	0.13
407	0.12
408	0.12
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.09
414	0.06
415	0.07
416	0.08
417	0.09
418	0.1
419	0.1
420	0.17
421	0.19
422	0.21
423	0.24
424	0.26
425	0.26
426	0.32
427	0.38
428	0.33
429	0.34
430	0.32
431	0.28
432	0.25
433	0.21
434	0.16
435	0.09
436	0.09
437	0.06
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.09
444	0.1
445	0.15
446	0.15
447	0.17
448	0.18
449	0.23
450	0.26
451	0.26
452	0.26
453	0.25
454	0.27
455	0.3
456	0.29
457	0.25
458	0.21
459	0.18
460	0.16
461	0.14
462	0.12
463	0.1
464	0.11
465	0.16
466	0.17
467	0.19
468	0.21
469	0.21
470	0.19
471	0.17
472	0.17
473	0.12
474	0.11
475	0.09
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.06
486	0.12
487	0.2
488	0.29
489	0.4
490	0.48
491	0.55
492	0.58
493	0.61
494	0.59
495	0.56
496	0.5
497	0.43
498	0.39
499	0.31
500	0.29
501	0.24
502	0.21
503	0.16
504	0.13
505	0.08
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.09
516	0.1
517	0.11
518	0.11
519	0.15
520	0.15
521	0.18
522	0.21
523	0.23
524	0.23
525	0.23
526	0.23
527	0.19
528	0.16
529	0.12
530	0.1
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.12
550	0.13
551	0.16
552	0.19
553	0.22
554	0.28
555	0.34
556	0.41
557	0.47
558	0.57
559	0.64
560	0.69
561	0.74
562	0.78
563	0.81
564	0.82
565	0.81
566	0.8
567	0.81
568	0.82
569	0.82
570	0.79
571	0.77
572	0.73
573	0.68
574	0.63
575	0.55
576	0.49
577	0.47
578	0.44
579	0.38
580	0.34
581	0.36
582	0.34
583	0.36
584	0.35
585	0.3
586	0.27
587	0.28
588	0.27
589	0.23
590	0.21
591	0.17
592	0.15
593	0.15
594	0.14
595	0.14
596	0.14
597	0.13
598	0.12
599	0.13
600	0.16
601	0.16
602	0.16
603	0.18
604	0.18
605	0.18
606	0.19
607	0.19
608	0.22
609	0.22
610	0.2
611	0.22
612	0.25
613	0.29
614	0.34
615	0.36
616	0.32
617	0.34
618	0.35
619	0.3
620	0.32
621	0.29
622	0.23
623	0.21
624	0.2
625	0.25
626	0.29
627	0.32
628	0.32
629	0.34
630	0.37
631	0.37
632	0.37
633	0.36
634	0.37
635	0.41
636	0.42
637	0.41
638	0.38
639	0.38
640	0.36
641	0.3
642	0.25
643	0.19
644	0.16
645	0.13
646	0.13
647	0.12
648	0.12
649	0.12
650	0.1
651	0.08
652	0.08
653	0.09
654	0.09
655	0.11
656	0.13
657	0.14
658	0.19
659	0.29
660	0.33
661	0.38
662	0.41
663	0.47
664	0.53
665	0.56
666	0.55
667	0.49
668	0.47
669	0.45
670	0.48
671	0.4
672	0.39
673	0.43
674	0.43
675	0.42
676	0.41
677	0.4
678	0.42
679	0.52
680	0.55
681	0.57
682	0.6
683	0.66
684	0.74
685	0.8
686	0.83
687	0.82
688	0.81
689	0.8
690	0.8
691	0.76
692	0.74
693	0.75
694	0.71
695	0.69
696	0.66
697	0.68
698	0.7
699	0.77
700	0.79
701	0.79
702	0.8
703	0.81
704	0.81
705	0.81
706	0.77
707	0.73
708	0.72
709	0.68
710	0.68
711	0.64
712	0.65
713	0.66
714	0.69
715	0.73
716	0.71
717	0.72
718	0.73
719	0.78
720	0.79
721	0.8
722	0.78
723	0.72
724	0.71
725	0.65
726	0.59
727	0.56
728	0.56
729	0.55
730	0.56
731	0.61
732	0.6
733	0.68
734	0.76
735	0.76
736	0.78
737	0.78
738	0.79

A0A178EMJ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer