FuNGI

A0A178E0T8

Protein Details

Accession

A0A178E0T8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-53	DAIAGEQRPPKRQRKTRETIKKELEHEF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
35-40	PKRQRK
530-591	KVPAAKEAQGGRGGGSRGGPPARGGQNQRGRGQPNGGRGGAPRGGGAPANRGRGNIARTGRG

Subcellular Location(s)

cyto 13, cyto_nucl 12.5, nucl 10, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MEDLSEELEKLALGANTLDGDEGWIDAIAGEQRPPKRQRKTRETIKKELEHEFLTPSRSFNTQWLNQLQQRWDAPTNYRSLFQIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAAIEDEAIDQQEKANARKSEGLDRVINFGAESGLLEIPPGFTRGLDFSKKELTDTNTAKEVEKTLGEKPDKINDAGADEEESADDVDVNGEDDLNDALEEEIDSLLPVEFPALAPHGPLAMAAGRKGGREWAHMVDVNRDITNFRELVPEMAREYPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRLTFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTHEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPIPLEHYLWAGKSMHKIVTADKKFIDNGWKDANDVLSGKDKVKVPAAKEAQGGRGGGSRGGPPARGGQNQRGRGQPNGGRGGAPRGGGAPANRGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLIQHLRSKDLLPACIFVFSKKRCEENAEALSNLDYCTAAEKSAIHMTIEKSLARLSREDRELPQIKRLRELLSRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGREFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGTVIICAPGADEAPPAGRLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMMLNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHQKQVKLSEADLEKIKREPCDICDIDLEACHQSCEDYKRLTNEMHLSLLVNPVGRRVLGKNRLIVYKKDNKRTAGMLLQDGTSKGNEPAVKVLEIAQNQDRKADDLLPYLGPFARFFRTLPKDAKDLRLKTAFVPLNDIECFSKTIIDVPESVQNLNRKKDSLKLAQTQFLPLCQSWNYEDWDEYDYSRIKSLKFRELEEARKKEGQNAVAKHCLQCPNFLKHFSMEHDQWLVKENILALRQLMSDQNLQLLPDYEQRTRVLKDLGFIDEGSRVELKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTDVEPTLTASLERGVAKIVEISEKVNQIQTLHQVILSADDSNDFVSKPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPTLFQKMGTCQELIKRDICNCASLYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.1
4	0.1
5	0.1
6	0.07
7	0.08
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.06
12	0.06
13	0.05
14	0.07
15	0.09
16	0.1
17	0.13
18	0.19
19	0.24
20	0.34
21	0.44
22	0.53
23	0.61
24	0.7
25	0.78
26	0.82
27	0.88
28	0.9
29	0.92
30	0.9
31	0.9
32	0.9
33	0.87
34	0.81
35	0.76
36	0.7
37	0.6
38	0.53
39	0.48
40	0.4
41	0.37
42	0.33
43	0.28
44	0.26
45	0.27
46	0.27
47	0.28
48	0.35
49	0.35
50	0.42
51	0.46
52	0.51
53	0.53
54	0.58
55	0.54
56	0.52
57	0.49
58	0.48
59	0.47
60	0.44
61	0.45
62	0.44
63	0.47
64	0.42
65	0.41
66	0.36
67	0.35
68	0.32
69	0.29
70	0.33
71	0.3
72	0.35
73	0.36
74	0.37
75	0.36
76	0.39
77	0.38
78	0.37
79	0.38
80	0.37
81	0.37
82	0.38
83	0.39
84	0.39
85	0.39
86	0.35
87	0.34
88	0.3
89	0.29
90	0.31
91	0.27
92	0.24
93	0.23
94	0.21
95	0.17
96	0.19
97	0.2
98	0.16
99	0.17
100	0.16
101	0.2
102	0.2
103	0.2
104	0.2
105	0.2
106	0.19
107	0.19
108	0.2
109	0.21
110	0.26
111	0.29
112	0.35
113	0.4
114	0.44
115	0.51
116	0.59
117	0.6
118	0.59
119	0.59
120	0.58
121	0.54
122	0.5
123	0.46
124	0.37
125	0.32
126	0.27
127	0.24
128	0.18
129	0.14
130	0.14
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.09
135	0.09
136	0.08
137	0.09
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.04
150	0.05
151	0.06
152	0.06
153	0.07
154	0.11
155	0.15
156	0.18
157	0.26
158	0.26
159	0.29
160	0.36
161	0.38
162	0.44
163	0.45
164	0.47
165	0.43
166	0.43
167	0.43
168	0.37
169	0.34
170	0.24
171	0.2
172	0.15
173	0.1
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.08
181	0.09
182	0.1
183	0.08
184	0.08
185	0.1
186	0.14
187	0.19
188	0.23
189	0.24
190	0.26
191	0.33
192	0.33
193	0.33
194	0.34
195	0.33
196	0.38
197	0.39
198	0.39
199	0.37
200	0.38
201	0.37
202	0.34
203	0.31
204	0.24
205	0.24
206	0.23
207	0.23
208	0.31
209	0.32
210	0.34
211	0.35
212	0.41
213	0.41
214	0.39
215	0.37
216	0.29
217	0.29
218	0.26
219	0.23
220	0.17
221	0.14
222	0.13
223	0.11
224	0.11
225	0.08
226	0.07
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.06
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.13
267	0.13
268	0.14
269	0.15
270	0.19
271	0.18
272	0.21
273	0.25
274	0.23
275	0.26
276	0.29
277	0.29
278	0.28
279	0.29
280	0.27
281	0.24
282	0.21
283	0.18
284	0.17
285	0.2
286	0.16
287	0.14
288	0.16
289	0.16
290	0.19
291	0.2
292	0.19
293	0.18
294	0.21
295	0.21
296	0.18
297	0.19
298	0.17
299	0.16
300	0.15
301	0.15
302	0.14
303	0.16
304	0.18
305	0.16
306	0.16
307	0.15
308	0.16
309	0.18
310	0.18
311	0.17
312	0.15
313	0.15
314	0.14
315	0.15
316	0.14
317	0.1
318	0.07
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.1
347	0.11
348	0.18
349	0.19
350	0.21
351	0.23
352	0.26
353	0.26
354	0.3
355	0.38
356	0.38
357	0.47
358	0.47
359	0.52
360	0.52
361	0.53
362	0.59
363	0.5
364	0.43
365	0.41
366	0.42
367	0.35
368	0.32
369	0.31
370	0.2
371	0.2
372	0.18
373	0.1
374	0.06
375	0.07
376	0.08
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.07
396	0.08
397	0.11
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.09
406	0.09
407	0.1
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.09
412	0.07
413	0.06
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.09
419	0.07
420	0.09
421	0.09
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.05
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.04
442	0.03
443	0.03
444	0.04
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.13
456	0.13
457	0.19
458	0.24
459	0.28
460	0.31
461	0.36
462	0.4
463	0.39
464	0.44
465	0.4
466	0.41
467	0.44
468	0.47
469	0.44
470	0.43
471	0.41
472	0.37
473	0.37
474	0.31
475	0.25
476	0.25
477	0.27
478	0.25
479	0.24
480	0.26
481	0.24
482	0.23
483	0.23
484	0.18
485	0.16
486	0.17
487	0.17
488	0.15
489	0.16
490	0.17
491	0.2
492	0.29
493	0.3
494	0.29
495	0.27
496	0.28
497	0.27
498	0.28
499	0.31
500	0.22
501	0.23
502	0.26
503	0.25
504	0.24
505	0.24
506	0.23
507	0.16
508	0.15
509	0.13
510	0.13
511	0.14
512	0.15
513	0.18
514	0.19
515	0.19
516	0.25
517	0.27
518	0.25
519	0.33
520	0.34
521	0.33
522	0.34
523	0.34
524	0.29
525	0.28
526	0.26
527	0.17
528	0.17
529	0.15
530	0.12
531	0.12
532	0.11
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.11
537	0.16
538	0.19
539	0.22
540	0.25
541	0.32
542	0.39
543	0.43
544	0.45
545	0.44
546	0.43
547	0.4
548	0.42
549	0.37
550	0.35
551	0.34
552	0.31
553	0.27
554	0.26
555	0.28
556	0.23
557	0.2
558	0.14
559	0.11
560	0.11
561	0.12
562	0.12
563	0.15
564	0.17
565	0.2
566	0.2
567	0.2
568	0.21
569	0.24
570	0.25
571	0.24
572	0.23
573	0.21
574	0.21
575	0.23
576	0.22
577	0.21
578	0.2
579	0.15
580	0.14
581	0.13
582	0.15
583	0.19
584	0.19
585	0.18
586	0.18
587	0.19
588	0.19
589	0.19
590	0.17
591	0.11
592	0.11
593	0.14
594	0.16
595	0.15
596	0.19
597	0.19
598	0.2
599	0.21
600	0.2
601	0.2
602	0.19
603	0.2
604	0.15
605	0.16
606	0.15
607	0.16
608	0.16
609	0.13
610	0.19
611	0.18
612	0.25
613	0.25
614	0.28
615	0.27
616	0.32
617	0.34
618	0.34
619	0.38
620	0.32
621	0.3
622	0.28
623	0.27
624	0.21
625	0.17
626	0.1
627	0.05
628	0.04
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.08
635	0.1
636	0.11
637	0.09
638	0.1
639	0.11
640	0.14
641	0.15
642	0.12
643	0.11
644	0.12
645	0.14
646	0.13
647	0.15
648	0.14
649	0.18
650	0.21
651	0.22
652	0.22
653	0.29
654	0.35
655	0.33
656	0.39
657	0.4
658	0.38
659	0.39
660	0.39
661	0.34
662	0.31
663	0.33
664	0.29
665	0.25
666	0.25
667	0.22
668	0.21
669	0.18
670	0.15
671	0.12
672	0.08
673	0.06
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.06
688	0.06
689	0.07
690	0.06
691	0.08
692	0.06
693	0.07
694	0.06
695	0.06
696	0.08
697	0.08
698	0.09
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.08
703	0.07
704	0.06
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.07
711	0.07
712	0.07
713	0.08
714	0.1
715	0.12
716	0.18
717	0.19
718	0.23
719	0.24
720	0.25
721	0.3
722	0.34
723	0.37
724	0.39
725	0.4
726	0.37
727	0.41
728	0.4
729	0.35
730	0.3
731	0.25
732	0.18
733	0.15
734	0.15
735	0.09
736	0.1
737	0.09
738	0.08
739	0.09
740	0.11
741	0.11
742	0.12
743	0.12
744	0.12
745	0.12
746	0.12
747	0.11
748	0.09
749	0.1
750	0.08
751	0.07
752	0.07
753	0.06
754	0.05
755	0.04
756	0.04
757	0.03
758	0.04
759	0.04
760	0.04
761	0.04
762	0.05
763	0.06
764	0.07
765	0.07
766	0.08
767	0.08
768	0.1
769	0.13
770	0.13
771	0.14
772	0.17
773	0.18
774	0.19
775	0.19
776	0.2
777	0.19
778	0.21
779	0.2
780	0.2
781	0.24
782	0.29
783	0.32
784	0.37
785	0.35
786	0.38
787	0.38
788	0.36
789	0.32
790	0.25
791	0.22
792	0.15
793	0.13
794	0.09
795	0.07
796	0.06
797	0.05
798	0.06
799	0.06
800	0.07
801	0.09
802	0.11
803	0.13
804	0.14
805	0.14
806	0.15
807	0.16
808	0.18
809	0.17
810	0.2
811	0.19
812	0.2
813	0.21
814	0.2
815	0.19
816	0.17
817	0.18
818	0.16
819	0.18
820	0.21
821	0.21
822	0.23
823	0.23
824	0.25
825	0.27
826	0.26
827	0.23
828	0.24
829	0.23
830	0.24
831	0.27
832	0.25
833	0.22
834	0.24
835	0.26
836	0.21
837	0.24
838	0.23
839	0.22
840	0.3
841	0.29
842	0.27
843	0.26
844	0.26
845	0.22
846	0.21
847	0.19
848	0.12
849	0.11
850	0.1
851	0.09
852	0.08
853	0.12
854	0.16
855	0.18
856	0.2
857	0.22
858	0.25
859	0.28
860	0.28
861	0.29
862	0.29
863	0.27
864	0.24
865	0.22
866	0.19
867	0.17
868	0.18
869	0.15
870	0.12
871	0.1
872	0.11
873	0.11
874	0.1
875	0.12
876	0.14
877	0.23
878	0.29
879	0.33
880	0.36
881	0.39
882	0.46
883	0.47
884	0.46
885	0.46
886	0.48
887	0.53
888	0.58
889	0.6
890	0.56
891	0.56
892	0.55
893	0.5
894	0.44
895	0.38
896	0.31
897	0.27
898	0.24
899	0.22
900	0.2
901	0.17
902	0.12
903	0.11
904	0.1
905	0.13
906	0.13
907	0.14
908	0.17
909	0.18
910	0.17
911	0.16
912	0.19
913	0.19
914	0.19
915	0.22
916	0.23
917	0.25
918	0.25
919	0.27
920	0.25
921	0.22
922	0.24
923	0.23
924	0.2
925	0.18
926	0.2
927	0.19
928	0.18
929	0.18
930	0.17
931	0.14
932	0.14
933	0.14
934	0.15
935	0.15
936	0.15
937	0.24
938	0.29
939	0.34
940	0.38
941	0.39
942	0.43
943	0.45
944	0.54
945	0.53
946	0.5
947	0.5
948	0.49
949	0.47
950	0.41
951	0.47
952	0.42
953	0.33
954	0.35
955	0.3
956	0.29
957	0.28
958	0.28
959	0.2
960	0.18
961	0.19
962	0.14
963	0.14
964	0.11
965	0.15
966	0.15
967	0.15
968	0.15
969	0.15
970	0.21
971	0.21
972	0.21
973	0.21
974	0.27
975	0.32
976	0.36
977	0.37
978	0.33
979	0.34
980	0.41
981	0.44
982	0.46
983	0.49
984	0.52
985	0.53
986	0.56
987	0.55
988	0.52
989	0.45
990	0.37
991	0.32
992	0.23
993	0.23
994	0.19
995	0.21
996	0.19
997	0.21
998	0.23
999	0.21
1000	0.22
1001	0.21
1002	0.23
1003	0.21
1004	0.19
1005	0.21
1006	0.2
1007	0.19
1008	0.23
1009	0.23
1010	0.22
1011	0.29
1012	0.35
1013	0.4
1014	0.4
1015	0.41
1016	0.47
1017	0.51
1018	0.59
1019	0.62
1020	0.6
1021	0.57
1022	0.6
1023	0.58
1024	0.55
1025	0.55
1026	0.52
1027	0.5
1028	0.5
1029	0.51
1030	0.51
1031	0.53
1032	0.48
1033	0.48
1034	0.48
1035	0.41
1036	0.45
1037	0.45
1038	0.47
1039	0.49
1040	0.5
1041	0.46
1042	0.41
1043	0.43
1044	0.39
1045	0.4
1046	0.33
1047	0.32
1048	0.33
1049	0.32
1050	0.29
1051	0.31
1052	0.27
1053	0.2
1054	0.2
1055	0.18
1056	0.18
1057	0.19
1058	0.19
1059	0.15
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.16
1064	0.14
1065	0.16
1066	0.16
1067	0.19
1068	0.17
1069	0.17
1070	0.17
1071	0.17
1072	0.16
1073	0.2
1074	0.25
1075	0.23
1076	0.26
1077	0.28
1078	0.31
1079	0.32
1080	0.33
1081	0.31
1082	0.27
1083	0.29
1084	0.29
1085	0.29
1086	0.26
1087	0.24
1088	0.22
1089	0.19
1090	0.19
1091	0.18
1092	0.16
1093	0.13
1094	0.14
1095	0.16
1096	0.18
1097	0.19
1098	0.2
1099	0.22
1100	0.22
1101	0.23
1102	0.25
1103	0.25
1104	0.24
1105	0.22
1106	0.22
1107	0.17
1108	0.17
1109	0.16
1110	0.13
1111	0.11
1112	0.09
1113	0.07
1114	0.07
1115	0.07
1116	0.06
1117	0.05
1118	0.04
1119	0.04
1120	0.05
1121	0.04
1122	0.04
1123	0.05
1124	0.06
1125	0.06
1126	0.06
1127	0.06
1128	0.06
1129	0.06
1130	0.06
1131	0.06
1132	0.04
1133	0.04
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.05
1137	0.06
1138	0.05
1139	0.08
1140	0.08
1141	0.12
1142	0.14
1143	0.15
1144	0.15
1145	0.16
1146	0.18
1147	0.18
1148	0.18
1149	0.15
1150	0.13
1151	0.13
1152	0.16
1153	0.15
1154	0.13
1155	0.12
1156	0.12
1157	0.13
1158	0.14
1159	0.14
1160	0.14
1161	0.15
1162	0.17
1163	0.2
1164	0.23
1165	0.23
1166	0.24
1167	0.24
1168	0.22
1169	0.24
1170	0.28
1171	0.27
1172	0.24
1173	0.23
1174	0.21
1175	0.2
1176	0.22
1177	0.19
1178	0.14
1179	0.11
1180	0.11
1181	0.12
1182	0.12
1183	0.13
1184	0.1
1185	0.12
1186	0.15
1187	0.17
1188	0.17
1189	0.19
1190	0.18
1191	0.19
1192	0.25
1193	0.23
1194	0.24
1195	0.23
1196	0.26
1197	0.23
1198	0.23
1199	0.21
1200	0.16
1201	0.14
1202	0.1
1203	0.11
1204	0.17
1205	0.22
1206	0.23
1207	0.26
1208	0.26
1209	0.28
1210	0.28
1211	0.28
1212	0.21
1213	0.17
1214	0.16
1215	0.13
1216	0.14
1217	0.12
1218	0.11
1219	0.12
1220	0.1
1221	0.09
1222	0.1
1223	0.1
1224	0.11
1225	0.16
1226	0.17
1227	0.19
1228	0.24
1229	0.29
1230	0.35
1231	0.38
1232	0.38
1233	0.36
1234	0.39
1235	0.43
1236	0.44
1237	0.42
1238	0.37
1239	0.36
1240	0.38
1241	0.4
1242	0.36
1243	0.28
1244	0.26
1245	0.29
1246	0.27
1247	0.26
1248	0.24
1249	0.24
1250	0.3
1251	0.31
1252	0.29
1253	0.26
1254	0.34
1255	0.39
1256	0.4
1257	0.39
1258	0.37
1259	0.37
1260	0.44
1261	0.43
1262	0.39

A0A178E0T8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer