Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ELI1

Protein Details
Accession A0A178ELI1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-97MSRTKEEKKRKRDEEAVAEDVAKKSKKSKKTEDVQDAPAPETAVVEAKKDKKDKKEKKSKKSKDVADAASEDAPVKEKKEKKSKKSKKDTDSAPTDEHydrophilic
118-150PMPDADSKKDKKKSKKDKESKKSKKNKEASDDIBasic
162-199EEPASEKKEKKDKKEKKEKKEKKDKKDKKAKKAAESETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-13EKKRKRD
22-30AKKSKKSKK
47-88AKKDKKDKKEKKSKKSKDVADAASEDAPVKEKKEKKSKKSKK
125-144KKDKKKSKKDKESKKSKKNK
167-194EKKEKKDKKEKKEKKEKKDKKDKKAKKA
329-372RKSKIAAKNEKLHDERAKDREKRAEIEMKQGERKEKKDARAKKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSRTKEEKKRKRDEEAVAEDVAKKSKKSKKTEDVQDAPAPETAVVEAKKDKKDKKEKKSKKSKDVADAASEDAPVKEKKEKKSKKSKKDTDSAPTDEAELIHDMKASENFISVDDDEPMPDADSKKDKKKSKKDKESKKSKKNKEASDDIVPDAEIQNGQPEEPASEKKEKKDKKEKKEKKEKKDKKDKKAKKAAESETNGAVAEADSTAETNGETTAEEQNGEVVDGADGSKKGRFIVFVGNLPYSATKEQIEEHFVKIKPTEIRLRTYKGTNKFMGTCFVEFDRFDRMETCLKKYHHSLFPDGKKGSEGRKINVELSAGGGGNSEERKSKIAAKNEKLHDERAKDREKRAEIEMKQGERKEKKDARAKKGGTEADTSSAEDVQPNNGNINPARLAMMSRPEPTQFRRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.83
3 0.75
4 0.65
5 0.58
6 0.51
7 0.44
8 0.41
9 0.32
10 0.27
11 0.34
12 0.42
13 0.5
14 0.57
15 0.66
16 0.7
17 0.78
18 0.87
19 0.87
20 0.84
21 0.81
22 0.76
23 0.66
24 0.57
25 0.48
26 0.38
27 0.27
28 0.21
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.16
33 0.23
34 0.29
35 0.37
36 0.45
37 0.53
38 0.58
39 0.7
40 0.77
41 0.81
42 0.86
43 0.89
44 0.92
45 0.95
46 0.95
47 0.95
48 0.94
49 0.91
50 0.89
51 0.87
52 0.79
53 0.72
54 0.62
55 0.54
56 0.44
57 0.36
58 0.27
59 0.18
60 0.19
61 0.15
62 0.17
63 0.24
64 0.3
65 0.4
66 0.51
67 0.61
68 0.68
69 0.78
70 0.86
71 0.88
72 0.93
73 0.93
74 0.91
75 0.9
76 0.87
77 0.84
78 0.81
79 0.74
80 0.64
81 0.54
82 0.46
83 0.37
84 0.3
85 0.22
86 0.17
87 0.13
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.11
108 0.11
109 0.13
110 0.22
111 0.28
112 0.36
113 0.45
114 0.53
115 0.62
116 0.72
117 0.8
118 0.83
119 0.89
120 0.9
121 0.93
122 0.95
123 0.95
124 0.95
125 0.95
126 0.94
127 0.93
128 0.93
129 0.91
130 0.88
131 0.84
132 0.79
133 0.73
134 0.69
135 0.6
136 0.49
137 0.41
138 0.32
139 0.25
140 0.19
141 0.15
142 0.08
143 0.06
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.14
152 0.15
153 0.24
154 0.27
155 0.33
156 0.43
157 0.48
158 0.56
159 0.65
160 0.71
161 0.73
162 0.82
163 0.86
164 0.87
165 0.93
166 0.92
167 0.92
168 0.94
169 0.93
170 0.92
171 0.94
172 0.93
173 0.92
174 0.93
175 0.92
176 0.91
177 0.92
178 0.87
179 0.84
180 0.83
181 0.77
182 0.74
183 0.67
184 0.58
185 0.48
186 0.42
187 0.33
188 0.23
189 0.18
190 0.09
191 0.06
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.17
226 0.18
227 0.19
228 0.21
229 0.2
230 0.2
231 0.19
232 0.18
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.24
244 0.24
245 0.24
246 0.23
247 0.26
248 0.24
249 0.27
250 0.34
251 0.3
252 0.36
253 0.39
254 0.43
255 0.41
256 0.46
257 0.49
258 0.47
259 0.51
260 0.47
261 0.45
262 0.44
263 0.41
264 0.39
265 0.34
266 0.27
267 0.23
268 0.22
269 0.21
270 0.18
271 0.18
272 0.2
273 0.18
274 0.18
275 0.17
276 0.19
277 0.25
278 0.28
279 0.31
280 0.32
281 0.33
282 0.37
283 0.42
284 0.46
285 0.45
286 0.46
287 0.49
288 0.52
289 0.56
290 0.6
291 0.55
292 0.47
293 0.43
294 0.43
295 0.42
296 0.41
297 0.38
298 0.33
299 0.4
300 0.42
301 0.4
302 0.38
303 0.33
304 0.24
305 0.22
306 0.21
307 0.13
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.14
316 0.16
317 0.18
318 0.27
319 0.32
320 0.41
321 0.5
322 0.56
323 0.64
324 0.67
325 0.73
326 0.67
327 0.67
328 0.64
329 0.6
330 0.6
331 0.59
332 0.64
333 0.61
334 0.66
335 0.68
336 0.65
337 0.63
338 0.63
339 0.64
340 0.56
341 0.6
342 0.6
343 0.56
344 0.57
345 0.58
346 0.61
347 0.58
348 0.6
349 0.61
350 0.61
351 0.66
352 0.7
353 0.76
354 0.75
355 0.78
356 0.77
357 0.72
358 0.73
359 0.69
360 0.62
361 0.56
362 0.48
363 0.42
364 0.41
365 0.35
366 0.27
367 0.23
368 0.2
369 0.18
370 0.17
371 0.19
372 0.22
373 0.22
374 0.24
375 0.24
376 0.28
377 0.26
378 0.3
379 0.25
380 0.21
381 0.22
382 0.2
383 0.21
384 0.21
385 0.28
386 0.27
387 0.28
388 0.3
389 0.33
390 0.39
391 0.44