Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E0B0

Protein Details
Accession A0A178E0B0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-95QEQSQKRREREALRRRPETGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-91RREREALRRR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLTCRACLRRCFEPLNPQGSSASTLRPNALPLVRQSQQRLLSTRNLDRSVESRPPNPTQVKRLARNGEEPWKNSMQEQSQKRREREALRRRPETGVGAPNLAKLGRRDPAMSVSEWERRKKELRHLQDPLELAKFVRQELAKDKPTHEVLQLVRMASQSMECVVSWNHIIDHYLANSRVGDALKVYNEMKKRAQFPDSYTYTILLRGLSINAHTPHVLTKALSVYHSLYAPNSRVEPSIIHTNAALRVCARALDMDALWGIAGKIPEKGPAAANAHTYITIINAIRHSLLIDAPKGETEDQTAARKERGIMEGRRMWEGIIGRWRNADLVIDEELVCGMGRLLLVGSRPRDWDDVLSLVEQTMDIPRLVPRLGSAEREEAGLPNLRAPNVPEQLRFDDDHLAPGNASMRGDEFLPLIPQGMSALVPNSPAYAKPGNNTLSLVQEACQKIVGAKGATEYWYLLTDPTTYNIAPDLNNLNLRLRNLRQNRKSAEAAQLLQQHVVDRGVEARPGTFRIAMSTCVRDKNNHNSLKHGTKILEVMMKTLEDADTKTVAMYANLALTFPLANGSDLVDSLTVLNPLVSNIRLQLSIGAQRQDNNGVGAVYLKNEARADAIEALRKVHGLYDRLLFSNLIPEESKAPFKTERARLSAFIQRVNSKSGQRWSPAKETVVEDGDDVDPHAYLKQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.6
4 0.53
5 0.48
6 0.43
7 0.4
8 0.31
9 0.28
10 0.26
11 0.27
12 0.29
13 0.28
14 0.29
15 0.31
16 0.32
17 0.3
18 0.3
19 0.36
20 0.38
21 0.42
22 0.45
23 0.47
24 0.5
25 0.53
26 0.52
27 0.49
28 0.52
29 0.55
30 0.58
31 0.58
32 0.54
33 0.5
34 0.49
35 0.47
36 0.46
37 0.47
38 0.43
39 0.41
40 0.45
41 0.49
42 0.55
43 0.61
44 0.6
45 0.6
46 0.66
47 0.7
48 0.71
49 0.75
50 0.74
51 0.69
52 0.7
53 0.68
54 0.68
55 0.65
56 0.6
57 0.58
58 0.54
59 0.5
60 0.45
61 0.45
62 0.44
63 0.47
64 0.54
65 0.58
66 0.64
67 0.72
68 0.73
69 0.75
70 0.75
71 0.76
72 0.77
73 0.78
74 0.79
75 0.79
76 0.81
77 0.76
78 0.72
79 0.65
80 0.6
81 0.55
82 0.51
83 0.43
84 0.41
85 0.38
86 0.35
87 0.32
88 0.27
89 0.22
90 0.18
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.25
95 0.25
96 0.31
97 0.31
98 0.29
99 0.27
100 0.28
101 0.33
102 0.37
103 0.42
104 0.39
105 0.43
106 0.5
107 0.54
108 0.6
109 0.63
110 0.67
111 0.7
112 0.73
113 0.71
114 0.67
115 0.62
116 0.54
117 0.45
118 0.36
119 0.26
120 0.25
121 0.22
122 0.18
123 0.21
124 0.19
125 0.2
126 0.27
127 0.35
128 0.38
129 0.4
130 0.41
131 0.42
132 0.45
133 0.44
134 0.38
135 0.36
136 0.3
137 0.33
138 0.33
139 0.27
140 0.24
141 0.22
142 0.21
143 0.15
144 0.15
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.12
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.15
172 0.16
173 0.18
174 0.21
175 0.26
176 0.3
177 0.33
178 0.38
179 0.4
180 0.44
181 0.42
182 0.43
183 0.48
184 0.45
185 0.43
186 0.37
187 0.34
188 0.29
189 0.27
190 0.22
191 0.13
192 0.11
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.12
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.2
229 0.2
230 0.23
231 0.22
232 0.19
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.11
257 0.16
258 0.18
259 0.18
260 0.19
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.15
265 0.1
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.12
288 0.15
289 0.17
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.17
295 0.19
296 0.22
297 0.22
298 0.27
299 0.3
300 0.3
301 0.3
302 0.27
303 0.23
304 0.2
305 0.19
306 0.15
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.2
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.07
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.09
345 0.08
346 0.07
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.11
359 0.12
360 0.14
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.16
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.15
375 0.2
376 0.22
377 0.23
378 0.21
379 0.24
380 0.26
381 0.28
382 0.27
383 0.22
384 0.22
385 0.21
386 0.22
387 0.2
388 0.17
389 0.14
390 0.14
391 0.15
392 0.1
393 0.1
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.11
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.22
422 0.23
423 0.23
424 0.24
425 0.2
426 0.18
427 0.18
428 0.17
429 0.12
430 0.16
431 0.16
432 0.15
433 0.15
434 0.13
435 0.12
436 0.14
437 0.16
438 0.1
439 0.09
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.16
463 0.16
464 0.19
465 0.19
466 0.21
467 0.24
468 0.25
469 0.32
470 0.41
471 0.5
472 0.54
473 0.61
474 0.62
475 0.62
476 0.63
477 0.57
478 0.55
479 0.48
480 0.42
481 0.39
482 0.4
483 0.34
484 0.32
485 0.28
486 0.21
487 0.18
488 0.18
489 0.13
490 0.09
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.14
498 0.16
499 0.14
500 0.14
501 0.16
502 0.17
503 0.2
504 0.21
505 0.24
506 0.26
507 0.3
508 0.31
509 0.32
510 0.38
511 0.45
512 0.51
513 0.54
514 0.52
515 0.52
516 0.58
517 0.59
518 0.55
519 0.48
520 0.39
521 0.34
522 0.34
523 0.31
524 0.28
525 0.22
526 0.2
527 0.18
528 0.17
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.1
568 0.09
569 0.09
570 0.11
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.14
575 0.15
576 0.22
577 0.24
578 0.25
579 0.25
580 0.27
581 0.29
582 0.31
583 0.28
584 0.22
585 0.2
586 0.17
587 0.16
588 0.16
589 0.14
590 0.11
591 0.13
592 0.12
593 0.15
594 0.15
595 0.15
596 0.14
597 0.15
598 0.17
599 0.19
600 0.21
601 0.23
602 0.23
603 0.25
604 0.24
605 0.23
606 0.2
607 0.2
608 0.23
609 0.2
610 0.23
611 0.26
612 0.28
613 0.29
614 0.3
615 0.26
616 0.21
617 0.26
618 0.24
619 0.21
620 0.2
621 0.2
622 0.22
623 0.25
624 0.31
625 0.24
626 0.29
627 0.3
628 0.35
629 0.44
630 0.49
631 0.53
632 0.53
633 0.56
634 0.53
635 0.55
636 0.57
637 0.5
638 0.47
639 0.45
640 0.44
641 0.43
642 0.46
643 0.46
644 0.44
645 0.48
646 0.51
647 0.52
648 0.53
649 0.58
650 0.59
651 0.62
652 0.62
653 0.57
654 0.53
655 0.5
656 0.49
657 0.44
658 0.38
659 0.3
660 0.27
661 0.25
662 0.21
663 0.18
664 0.13
665 0.11
666 0.11