Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EKU3

Protein Details
Accession A0A178EKU3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-373GSNTLQKPEKNKKRKRGNDAGDPTEHydrophilic
550-572RLNDATTEGSKKKRKKKRKTDQABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
356-364PEKNKKRKR
559-568SKKKRKKKRK
Subcellular Location(s) cyto 18, nucl 9, cyto_mito 9, cyto_pero 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR023267  RCMT  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MSLYYEAATVLANPENVGGSLKSRIYKQKDLKSTPGQIFALIAEASKWSVVLKDVIEKCGLLAAEKKLTPILSVLLSHDLLLTKNGVAAATNHALKLAITRHKARLGAELTKARIKYGYATLDAFKEAVSNGDLNKEDGNGPKSHHPRWVRVNTIKSSLQEQLSTTFAGYAKTDKLENILFAPKKSKVYYEDPNIPNLLALPSKIDLSRSHAYTRGQIIFQDKASCFPAYLLDPTPDDGDVIDATAAPGNKTTHLAAIVSERSTPSEGSKVIAFERDKGRSFTLQKMVKLATADSIVHVKGSSDFIAASPNSDEFSNVGAILLDPSCSGTGIVGRDDAIEMHLPQAPGGSNTLQKPEKNKKRKRGNDAGDPTESIATLNVDLDDTTPEEVPIDGKLSERLTALSSFQVHILTHAMRFANAHKITYSTCSIHFEENEGVVFQALASPVAKERGWRILKREIQVNGLQKWHRRGVWEDGKLGCAVDEVSKQDVLDGCIRCDKATEEGTMGFFVAGFVRDEHAVTASTMSVDVNEEDEWNGFSDAEGEQTLNRLNDATTEGSKKKRKKKRKTDQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.11
6 0.12
7 0.16
8 0.2
9 0.22
10 0.28
11 0.37
12 0.43
13 0.53
14 0.6
15 0.66
16 0.73
17 0.76
18 0.79
19 0.78
20 0.79
21 0.73
22 0.69
23 0.59
24 0.49
25 0.43
26 0.34
27 0.28
28 0.19
29 0.15
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.12
39 0.13
40 0.22
41 0.24
42 0.26
43 0.26
44 0.25
45 0.23
46 0.24
47 0.22
48 0.15
49 0.18
50 0.2
51 0.24
52 0.25
53 0.26
54 0.25
55 0.25
56 0.24
57 0.2
58 0.18
59 0.14
60 0.14
61 0.15
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.14
77 0.17
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.17
82 0.16
83 0.19
84 0.21
85 0.24
86 0.29
87 0.34
88 0.39
89 0.43
90 0.45
91 0.42
92 0.43
93 0.41
94 0.4
95 0.42
96 0.41
97 0.41
98 0.43
99 0.42
100 0.35
101 0.31
102 0.27
103 0.24
104 0.26
105 0.26
106 0.23
107 0.25
108 0.25
109 0.25
110 0.25
111 0.21
112 0.14
113 0.12
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.19
126 0.22
127 0.19
128 0.22
129 0.3
130 0.36
131 0.37
132 0.44
133 0.44
134 0.48
135 0.57
136 0.61
137 0.61
138 0.63
139 0.67
140 0.61
141 0.62
142 0.57
143 0.48
144 0.44
145 0.39
146 0.33
147 0.27
148 0.25
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.15
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.12
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.21
167 0.21
168 0.21
169 0.26
170 0.25
171 0.29
172 0.29
173 0.3
174 0.28
175 0.34
176 0.4
177 0.43
178 0.49
179 0.47
180 0.47
181 0.44
182 0.38
183 0.32
184 0.24
185 0.19
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.17
195 0.21
196 0.22
197 0.23
198 0.25
199 0.26
200 0.28
201 0.32
202 0.27
203 0.23
204 0.23
205 0.25
206 0.23
207 0.23
208 0.24
209 0.19
210 0.19
211 0.21
212 0.19
213 0.16
214 0.14
215 0.15
216 0.12
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.21
263 0.23
264 0.24
265 0.25
266 0.26
267 0.27
268 0.29
269 0.3
270 0.34
271 0.34
272 0.33
273 0.33
274 0.32
275 0.28
276 0.25
277 0.2
278 0.13
279 0.11
280 0.1
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.06
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.13
339 0.19
340 0.21
341 0.22
342 0.31
343 0.4
344 0.5
345 0.58
346 0.66
347 0.71
348 0.8
349 0.88
350 0.89
351 0.88
352 0.85
353 0.84
354 0.81
355 0.75
356 0.65
357 0.56
358 0.46
359 0.36
360 0.28
361 0.17
362 0.11
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.12
399 0.11
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.21
406 0.21
407 0.22
408 0.19
409 0.21
410 0.22
411 0.25
412 0.26
413 0.18
414 0.19
415 0.23
416 0.25
417 0.26
418 0.25
419 0.24
420 0.22
421 0.21
422 0.2
423 0.15
424 0.13
425 0.1
426 0.09
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.16
438 0.25
439 0.32
440 0.35
441 0.39
442 0.46
443 0.52
444 0.54
445 0.58
446 0.5
447 0.48
448 0.51
449 0.51
450 0.44
451 0.45
452 0.45
453 0.44
454 0.48
455 0.49
456 0.45
457 0.42
458 0.44
459 0.48
460 0.54
461 0.52
462 0.5
463 0.45
464 0.45
465 0.41
466 0.36
467 0.25
468 0.16
469 0.13
470 0.11
471 0.12
472 0.13
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.18
477 0.18
478 0.19
479 0.23
480 0.22
481 0.22
482 0.28
483 0.28
484 0.26
485 0.26
486 0.25
487 0.24
488 0.26
489 0.25
490 0.21
491 0.22
492 0.23
493 0.21
494 0.2
495 0.13
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.1
532 0.09
533 0.12
534 0.16
535 0.14
536 0.15
537 0.14
538 0.13
539 0.14
540 0.18
541 0.2
542 0.21
543 0.27
544 0.33
545 0.42
546 0.51
547 0.59
548 0.67
549 0.74
550 0.8
551 0.85
552 0.91