Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DSH3

Protein Details
Accession A0A178DSH3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-212AYIKVRTKFKSKKEFDRVFLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040324  WDR44/Dgr2  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MADDVPKIKVINPQIKGAGRPFDRQDIGITTTIEGPLSNKKLTAKLRSPTSPSAQSIDTKVANSDSRGPSEAAIDPLSQQILQRTNTSPAVPKLRSSNTEPIYSQSPTSPNEANADKKQSGETPRDMGGASKADKKKGVSFLSRFIGSNKKKGGLDSLSDNGSEADDLRREGMDAQLYVDNVSFSPKVPQPPAYIKVRTKFKSKKEFDRVFLAQELRSGSDKKSPPAAGSNPAPQSGSAATQNPIWAVEFSKDGKYLAAGGQDRVVRVWAVISSSEERRSHEHDESAPQAFGGEVKHLSAPVFQQKIFREYRGHTSTILDLSWSKNNFLLSSSMDKTVRLWHVSRDENLCIFKHSDFVPSVKFHPTDDRFFLAGSLDAKLRLWSIPDKNVAYSTTVPDMITAVAFTPDGKTCIAGTLGGLCMFYDTEGLKWQAQLHVKSTRGQNAKGSKITGIQATYWPPGSESGEVKLLVSSNDSRVRVYNMRDKSLEMKFRGHENNCSQIRAAFADSSGHIICGSEDRKTYIWSTSMPEGEKRDQRPVEMFDAHNSITTCTIIAPVHTRRLLSASEDPIYDLCNPPPVTLVSRAESVISSKAPTEAGSPFPTPTATDSVFKKAEESPAYRARSAHCDGNIIVTADYTGSLKVFRQDCAFAKRIRLSEAWETTSMKRAGSKIGRPNSMISRSSRSRRDSISTQPPMDRIMTWRQGISHGSFDSTNSSLPRRSASPRKSLAGLSFASTRHSLSQADSPILGPTLTLETDTTHSGPPGTPKTSLSMDRGPSTQSLPQPELERLSPQPQSTQPKLYQHFNRQPSASNPLAVYDGQSWLFWSTRDKSRLTAPGEEGRPGLDPRRSDNSQVSEVSQLSQLTDEISGVSGEEEEGKDEGFDKGVQKGVQKGTQKGKVKGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.53
4 0.51
5 0.5
6 0.44
7 0.48
8 0.48
9 0.49
10 0.48
11 0.44
12 0.43
13 0.38
14 0.38
15 0.34
16 0.3
17 0.24
18 0.24
19 0.23
20 0.2
21 0.16
22 0.15
23 0.21
24 0.25
25 0.24
26 0.25
27 0.29
28 0.37
29 0.44
30 0.52
31 0.51
32 0.55
33 0.62
34 0.65
35 0.69
36 0.67
37 0.66
38 0.63
39 0.57
40 0.53
41 0.47
42 0.44
43 0.4
44 0.39
45 0.34
46 0.28
47 0.27
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.32
52 0.3
53 0.32
54 0.34
55 0.33
56 0.29
57 0.31
58 0.3
59 0.23
60 0.22
61 0.19
62 0.17
63 0.18
64 0.18
65 0.15
66 0.15
67 0.18
68 0.22
69 0.24
70 0.27
71 0.28
72 0.32
73 0.34
74 0.36
75 0.35
76 0.37
77 0.44
78 0.41
79 0.41
80 0.44
81 0.48
82 0.5
83 0.51
84 0.54
85 0.48
86 0.51
87 0.49
88 0.44
89 0.43
90 0.4
91 0.34
92 0.28
93 0.29
94 0.27
95 0.31
96 0.29
97 0.27
98 0.3
99 0.33
100 0.36
101 0.37
102 0.43
103 0.39
104 0.37
105 0.38
106 0.4
107 0.42
108 0.42
109 0.4
110 0.37
111 0.37
112 0.37
113 0.34
114 0.29
115 0.26
116 0.24
117 0.23
118 0.29
119 0.32
120 0.34
121 0.38
122 0.4
123 0.43
124 0.46
125 0.5
126 0.5
127 0.5
128 0.52
129 0.53
130 0.51
131 0.45
132 0.4
133 0.44
134 0.39
135 0.44
136 0.42
137 0.42
138 0.42
139 0.42
140 0.46
141 0.39
142 0.38
143 0.35
144 0.34
145 0.3
146 0.29
147 0.28
148 0.21
149 0.17
150 0.14
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.12
168 0.1
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.16
173 0.19
174 0.24
175 0.27
176 0.31
177 0.33
178 0.4
179 0.45
180 0.46
181 0.5
182 0.5
183 0.55
184 0.61
185 0.59
186 0.62
187 0.66
188 0.69
189 0.72
190 0.74
191 0.77
192 0.79
193 0.82
194 0.75
195 0.74
196 0.66
197 0.58
198 0.54
199 0.45
200 0.34
201 0.3
202 0.28
203 0.21
204 0.22
205 0.21
206 0.19
207 0.25
208 0.28
209 0.28
210 0.34
211 0.32
212 0.32
213 0.37
214 0.38
215 0.35
216 0.36
217 0.4
218 0.35
219 0.35
220 0.33
221 0.26
222 0.25
223 0.2
224 0.19
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.14
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.16
246 0.15
247 0.15
248 0.18
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.17
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.1
260 0.13
261 0.15
262 0.21
263 0.21
264 0.23
265 0.26
266 0.31
267 0.34
268 0.33
269 0.34
270 0.31
271 0.34
272 0.35
273 0.32
274 0.27
275 0.21
276 0.18
277 0.15
278 0.13
279 0.1
280 0.09
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.18
289 0.2
290 0.2
291 0.25
292 0.26
293 0.32
294 0.33
295 0.32
296 0.3
297 0.3
298 0.38
299 0.37
300 0.36
301 0.31
302 0.3
303 0.29
304 0.26
305 0.23
306 0.15
307 0.12
308 0.14
309 0.18
310 0.17
311 0.16
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.16
317 0.13
318 0.18
319 0.18
320 0.2
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.23
325 0.24
326 0.22
327 0.22
328 0.23
329 0.29
330 0.31
331 0.34
332 0.31
333 0.3
334 0.28
335 0.29
336 0.25
337 0.21
338 0.2
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.16
343 0.15
344 0.17
345 0.18
346 0.18
347 0.2
348 0.21
349 0.21
350 0.19
351 0.27
352 0.29
353 0.3
354 0.3
355 0.31
356 0.27
357 0.27
358 0.26
359 0.17
360 0.15
361 0.11
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.09
370 0.14
371 0.16
372 0.2
373 0.24
374 0.24
375 0.24
376 0.25
377 0.23
378 0.2
379 0.18
380 0.16
381 0.13
382 0.13
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.04
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.07
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.14
420 0.18
421 0.18
422 0.2
423 0.24
424 0.25
425 0.28
426 0.3
427 0.33
428 0.31
429 0.31
430 0.34
431 0.35
432 0.37
433 0.35
434 0.33
435 0.26
436 0.25
437 0.25
438 0.2
439 0.15
440 0.12
441 0.12
442 0.14
443 0.14
444 0.12
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.11
461 0.15
462 0.16
463 0.16
464 0.17
465 0.21
466 0.22
467 0.25
468 0.3
469 0.28
470 0.3
471 0.3
472 0.31
473 0.32
474 0.34
475 0.35
476 0.29
477 0.3
478 0.29
479 0.34
480 0.39
481 0.36
482 0.37
483 0.34
484 0.41
485 0.39
486 0.38
487 0.33
488 0.27
489 0.26
490 0.21
491 0.19
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.11
497 0.1
498 0.09
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.11
506 0.13
507 0.14
508 0.16
509 0.17
510 0.14
511 0.15
512 0.14
513 0.17
514 0.17
515 0.19
516 0.18
517 0.2
518 0.22
519 0.27
520 0.32
521 0.31
522 0.37
523 0.35
524 0.36
525 0.36
526 0.35
527 0.34
528 0.31
529 0.29
530 0.22
531 0.24
532 0.22
533 0.21
534 0.18
535 0.14
536 0.12
537 0.11
538 0.1
539 0.07
540 0.09
541 0.07
542 0.08
543 0.13
544 0.15
545 0.19
546 0.2
547 0.2
548 0.19
549 0.21
550 0.21
551 0.2
552 0.22
553 0.2
554 0.2
555 0.2
556 0.2
557 0.18
558 0.19
559 0.16
560 0.13
561 0.1
562 0.16
563 0.16
564 0.16
565 0.17
566 0.17
567 0.18
568 0.21
569 0.23
570 0.18
571 0.19
572 0.19
573 0.18
574 0.17
575 0.15
576 0.13
577 0.11
578 0.1
579 0.09
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.13
586 0.16
587 0.17
588 0.16
589 0.16
590 0.16
591 0.15
592 0.15
593 0.16
594 0.15
595 0.18
596 0.19
597 0.24
598 0.25
599 0.24
600 0.24
601 0.22
602 0.26
603 0.27
604 0.29
605 0.3
606 0.36
607 0.39
608 0.38
609 0.38
610 0.34
611 0.36
612 0.36
613 0.34
614 0.27
615 0.26
616 0.25
617 0.27
618 0.25
619 0.19
620 0.16
621 0.11
622 0.11
623 0.08
624 0.09
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.06
629 0.07
630 0.13
631 0.14
632 0.15
633 0.17
634 0.21
635 0.25
636 0.31
637 0.35
638 0.31
639 0.35
640 0.39
641 0.38
642 0.38
643 0.34
644 0.33
645 0.36
646 0.38
647 0.34
648 0.32
649 0.33
650 0.31
651 0.37
652 0.32
653 0.25
654 0.25
655 0.23
656 0.29
657 0.33
658 0.4
659 0.42
660 0.48
661 0.5
662 0.49
663 0.52
664 0.5
665 0.49
666 0.44
667 0.39
668 0.4
669 0.44
670 0.5
671 0.53
672 0.52
673 0.51
674 0.53
675 0.56
676 0.53
677 0.55
678 0.58
679 0.57
680 0.54
681 0.51
682 0.48
683 0.43
684 0.4
685 0.32
686 0.25
687 0.28
688 0.3
689 0.29
690 0.29
691 0.28
692 0.29
693 0.31
694 0.29
695 0.25
696 0.2
697 0.2
698 0.19
699 0.19
700 0.21
701 0.18
702 0.18
703 0.17
704 0.19
705 0.2
706 0.21
707 0.23
708 0.24
709 0.31
710 0.4
711 0.44
712 0.51
713 0.53
714 0.55
715 0.54
716 0.52
717 0.46
718 0.4
719 0.34
720 0.27
721 0.25
722 0.22
723 0.23
724 0.21
725 0.2
726 0.18
727 0.19
728 0.18
729 0.18
730 0.24
731 0.23
732 0.23
733 0.22
734 0.21
735 0.19
736 0.19
737 0.16
738 0.09
739 0.08
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.1
745 0.12
746 0.15
747 0.15
748 0.14
749 0.14
750 0.15
751 0.16
752 0.22
753 0.26
754 0.26
755 0.26
756 0.27
757 0.31
758 0.34
759 0.36
760 0.35
761 0.35
762 0.36
763 0.37
764 0.36
765 0.34
766 0.31
767 0.31
768 0.31
769 0.29
770 0.32
771 0.31
772 0.34
773 0.35
774 0.36
775 0.36
776 0.32
777 0.32
778 0.3
779 0.34
780 0.34
781 0.32
782 0.35
783 0.39
784 0.47
785 0.47
786 0.51
787 0.51
788 0.56
789 0.6
790 0.64
791 0.66
792 0.68
793 0.72
794 0.71
795 0.7
796 0.63
797 0.63
798 0.58
799 0.56
800 0.46
801 0.39
802 0.33
803 0.29
804 0.29
805 0.24
806 0.22
807 0.17
808 0.18
809 0.16
810 0.15
811 0.15
812 0.16
813 0.16
814 0.15
815 0.19
816 0.23
817 0.31
818 0.36
819 0.37
820 0.37
821 0.44
822 0.51
823 0.5
824 0.5
825 0.46
826 0.5
827 0.51
828 0.5
829 0.42
830 0.35
831 0.33
832 0.3
833 0.31
834 0.28
835 0.28
836 0.33
837 0.42
838 0.43
839 0.45
840 0.5
841 0.5
842 0.49
843 0.48
844 0.44
845 0.39
846 0.37
847 0.33
848 0.28
849 0.22
850 0.18
851 0.17
852 0.16
853 0.13
854 0.12
855 0.11
856 0.09
857 0.09
858 0.08
859 0.07
860 0.08
861 0.06
862 0.07
863 0.09
864 0.09
865 0.1
866 0.11
867 0.11
868 0.11
869 0.12
870 0.12
871 0.11
872 0.14
873 0.14
874 0.17
875 0.22
876 0.24
877 0.26
878 0.33
879 0.38
880 0.42
881 0.46
882 0.52
883 0.57
884 0.64
885 0.69