Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DLX6

Protein Details
Accession A0A178DLX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-417EAKAYPPPPSEKKKEKKKKDKGTFHPGKKVEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
392-415PPPSEKKKEKKKKDKGTFHPGKKV
Subcellular Location(s) cyto 19, nucl 7.5, mito_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MADSVAIQDEIAVIEKRIEELQEQLKDAKARLLKSQEESLASGPGADLSQDEKLALIKVNLQEVLNPEIMEEALKKSGHLKVYWGTATTGRPHCGYFVPILKIAQFLAAGCHVKILLADIHGFLDNLKAPIELVKFRAEYYRYTITALLKAVKVPIDKLEFVLGSSYELNSDYTMDLLRLASITSERDAKKAGAEVVKQTENAPLSGLIYPLMQALDEQYLDVDVQFGGVDQRKIFALAKDVLPKIGYKERAHLMNPMVPGLQGGKMSSSDPDSKIDVLDDADVVKRKLKKAFAPPKVVEENGVLSFVEYVLLPASHLNYGEAKFVVERRDAEPLVYTNIKQMQEDYVNDILIPQDLKPAVTKALNQLLEPVQAEFQANPAWKEIEAKAYPPPPSEKKKEKKKKDKGTFHPGKKVEAKPDGHMEGADKATVDVGTVGGEKAIENLTLEEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.14
4 0.15
5 0.16
6 0.14
7 0.2
8 0.28
9 0.29
10 0.31
11 0.31
12 0.34
13 0.35
14 0.35
15 0.36
16 0.32
17 0.31
18 0.37
19 0.42
20 0.43
21 0.45
22 0.5
23 0.46
24 0.43
25 0.43
26 0.36
27 0.31
28 0.25
29 0.21
30 0.15
31 0.12
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.13
43 0.11
44 0.15
45 0.17
46 0.2
47 0.21
48 0.2
49 0.2
50 0.22
51 0.25
52 0.21
53 0.19
54 0.16
55 0.15
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.1
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.18
64 0.23
65 0.26
66 0.25
67 0.27
68 0.26
69 0.31
70 0.32
71 0.28
72 0.25
73 0.25
74 0.27
75 0.31
76 0.31
77 0.28
78 0.29
79 0.28
80 0.28
81 0.26
82 0.26
83 0.23
84 0.24
85 0.25
86 0.25
87 0.25
88 0.24
89 0.23
90 0.21
91 0.17
92 0.11
93 0.09
94 0.09
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.12
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.23
125 0.21
126 0.21
127 0.26
128 0.28
129 0.25
130 0.26
131 0.28
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.21
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.18
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.11
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.19
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.17
189 0.16
190 0.13
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.05
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.2
234 0.24
235 0.2
236 0.24
237 0.27
238 0.29
239 0.29
240 0.29
241 0.26
242 0.24
243 0.23
244 0.19
245 0.17
246 0.14
247 0.13
248 0.11
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.16
260 0.17
261 0.16
262 0.16
263 0.15
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.08
270 0.1
271 0.1
272 0.14
273 0.17
274 0.21
275 0.27
276 0.31
277 0.36
278 0.46
279 0.56
280 0.59
281 0.65
282 0.62
283 0.62
284 0.6
285 0.53
286 0.43
287 0.33
288 0.28
289 0.2
290 0.19
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.15
313 0.17
314 0.16
315 0.18
316 0.18
317 0.24
318 0.24
319 0.23
320 0.23
321 0.21
322 0.23
323 0.22
324 0.2
325 0.19
326 0.25
327 0.25
328 0.23
329 0.23
330 0.23
331 0.25
332 0.26
333 0.27
334 0.22
335 0.21
336 0.21
337 0.2
338 0.15
339 0.13
340 0.12
341 0.07
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.13
346 0.15
347 0.17
348 0.18
349 0.2
350 0.21
351 0.29
352 0.29
353 0.28
354 0.3
355 0.28
356 0.28
357 0.27
358 0.22
359 0.14
360 0.15
361 0.16
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.15
366 0.15
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.21
371 0.2
372 0.24
373 0.24
374 0.25
375 0.29
376 0.33
377 0.35
378 0.35
379 0.41
380 0.42
381 0.5
382 0.58
383 0.63
384 0.69
385 0.78
386 0.86
387 0.89
388 0.92
389 0.94
390 0.95
391 0.95
392 0.96
393 0.94
394 0.94
395 0.94
396 0.91
397 0.9
398 0.81
399 0.77
400 0.76
401 0.72
402 0.7
403 0.68
404 0.62
405 0.57
406 0.62
407 0.56
408 0.48
409 0.42
410 0.35
411 0.3
412 0.28
413 0.24
414 0.16
415 0.14
416 0.15
417 0.14
418 0.12
419 0.08
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.08
426 0.07
427 0.09
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.11