Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ECW5

Protein Details
Accession A0A178ECW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-218SSAQRKEVKIQMKKEKKKEQEYVRRKAEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-210QMKKEKKKEQE
213-214RR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 11.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR018856  Stn1_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF10451  Stn1  
CDD cd03524  RPA2_OBF_family  
Amino Acid Sequences MSKHQPARPYRIYPAYYFRASPTYDAWVKITAADVQSLRSESGFTGQHIYFYLNHPIRFVRLVGVIVAIDDINASYTVLTIDDGSGATIELKIVRILPVERNPLDSSSATTIDNVNIISRLGVFEVLVNDHILDIGTVIKAKGTLSEFRGIKQVDLKRAWVVSSTDEEARAWTETALFKQKVLSEPWHLSSAQRKEVKIQMKKEKKKEQEYVRRKAEYQAKKIEQREAKELYMIQKEARDEVKRRKEEVMMNSGALI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.57
3 0.51
4 0.46
5 0.41
6 0.37
7 0.35
8 0.33
9 0.28
10 0.29
11 0.29
12 0.29
13 0.29
14 0.26
15 0.25
16 0.23
17 0.22
18 0.18
19 0.16
20 0.18
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.14
27 0.14
28 0.11
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.18
33 0.18
34 0.18
35 0.18
36 0.2
37 0.17
38 0.19
39 0.28
40 0.26
41 0.26
42 0.27
43 0.27
44 0.28
45 0.28
46 0.25
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.13
51 0.13
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.06
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.09
84 0.13
85 0.17
86 0.22
87 0.22
88 0.25
89 0.26
90 0.25
91 0.26
92 0.22
93 0.19
94 0.16
95 0.17
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.09
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.06
130 0.08
131 0.11
132 0.13
133 0.2
134 0.2
135 0.21
136 0.26
137 0.24
138 0.22
139 0.27
140 0.29
141 0.29
142 0.3
143 0.3
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.21
148 0.18
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.12
158 0.1
159 0.08
160 0.1
161 0.1
162 0.14
163 0.2
164 0.19
165 0.19
166 0.21
167 0.23
168 0.24
169 0.26
170 0.27
171 0.26
172 0.29
173 0.31
174 0.31
175 0.29
176 0.28
177 0.33
178 0.35
179 0.37
180 0.39
181 0.37
182 0.4
183 0.47
184 0.54
185 0.53
186 0.57
187 0.6
188 0.67
189 0.76
190 0.82
191 0.85
192 0.85
193 0.86
194 0.86
195 0.86
196 0.87
197 0.87
198 0.87
199 0.85
200 0.79
201 0.7
202 0.69
203 0.68
204 0.66
205 0.65
206 0.65
207 0.65
208 0.69
209 0.71
210 0.72
211 0.69
212 0.64
213 0.63
214 0.57
215 0.5
216 0.45
217 0.44
218 0.41
219 0.4
220 0.37
221 0.31
222 0.3
223 0.31
224 0.32
225 0.37
226 0.38
227 0.41
228 0.5
229 0.59
230 0.61
231 0.64
232 0.64
233 0.64
234 0.64
235 0.64
236 0.61
237 0.52