Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ECP4

Protein Details
Accession A0A178ECP4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-412GFFAKNPKTKRRNQVESTRQGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
cd02672  Peptidase_C19P  
Amino Acid Sequences MEADWDELAIAQLPPPQGPHHPVIPVSTFAFDTTQELLWAGNNHGRITSFYGPHLERYTSYRGHAVADGPVKQFLFTEKGVLSISKQSVHYALRRGITQWHLTSTEFNDLKCMNFTSKGTREILVAGCQDQMFKVDVEKGTILEALPADAQYTIMKRAGQYLCAATKTGGIHILDSASLSVIKVFEGHTGSISDMDAKGDFLATCGWSPRQQYAYMLDPFTNVFSLKTLKQLPPIPFHTGAAFVRMHPRMSTTAIIASQNGHMQVIDLMNPDSANLRQINLYDSYLAGFEMAPSSEAFALADSNSHIHLWGSPSKVHFPEYSNPTEFADPHPIPPPAMDWSMDTPLNTVGMPYYKEQLLSGWPSHMMFEVGAPPTKIDSSILNSMTRTDIGFFAKNPKTKRRNQVESTRQGDKSDSLTPPKFLSEKARTSQSVNDVDAKVTETMETLTDLHLDDVTRKDVPAMYGNVEIKYSKFGVDDFDFAYYNQTPYSGLETHISNSYANPLLQLLRFTPLIRNLALQHTASPCLYESCLLCELGFLIDMLEKAAGLNCQATNFLKTFSGLSNAVSLNLLEELAPNVALTSMIQNLNRFLLDKISDEFRQMLSGQPGPSAMDKVLETQARASMRCAQCTNETIRGGKHFVNELVYPTKHVMKNTRIPRLTFSQILKSSVERQDQTRGWCTKCSRYQQMIQRKTIQSVPSVLMLNAAIQSHEAKLLWSIPNWLPQEIGIIIDQGQFFCFEGQDLKLHLQRGVHNIKVYELVGVVADINSGEHQKPHLVATINTAPSSREPDAEDKWHLFNDFLVRPIPKEEALRFEPSWKLPSVLTYQLKSARNEIDDSWKDSLDTSILYRWWSSNPTPPESKFKLLEPATETPRPGYPVAIDAEFIRLQAEEIEMKADGTRQTIRPDRKGLARVSVCRGEGEHAGLPFIDDYIAVTEKVVDYLTEWSGISPGDLNPETSSHAPVSLKHAYKKLWLLLNLGCVFVGHSLANDFRTINIHVPKAQVVDTSNLFFKSDFRRKLNLKFLAWCVLKEKIQEDTHDSIEDALTALKLWRKYEEFMDAGVLEQMLNDIYATGSQMRFKAPGSGGVAAGSSGKPVSAVGVTGRDTPDPLTTPKKGNPFGSVGFRSPMRRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.19
4 0.23
5 0.29
6 0.32
7 0.32
8 0.34
9 0.35
10 0.37
11 0.36
12 0.33
13 0.29
14 0.26
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.17
19 0.18
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.2
30 0.2
31 0.21
32 0.21
33 0.21
34 0.26
35 0.3
36 0.27
37 0.28
38 0.34
39 0.34
40 0.39
41 0.4
42 0.34
43 0.29
44 0.33
45 0.38
46 0.34
47 0.35
48 0.34
49 0.31
50 0.31
51 0.31
52 0.28
53 0.27
54 0.29
55 0.31
56 0.28
57 0.3
58 0.28
59 0.26
60 0.25
61 0.22
62 0.22
63 0.19
64 0.22
65 0.19
66 0.2
67 0.21
68 0.22
69 0.2
70 0.23
71 0.25
72 0.24
73 0.25
74 0.25
75 0.29
76 0.33
77 0.36
78 0.35
79 0.38
80 0.37
81 0.37
82 0.37
83 0.38
84 0.39
85 0.41
86 0.36
87 0.35
88 0.34
89 0.34
90 0.36
91 0.33
92 0.37
93 0.31
94 0.29
95 0.3
96 0.29
97 0.3
98 0.29
99 0.28
100 0.22
101 0.24
102 0.27
103 0.31
104 0.35
105 0.38
106 0.38
107 0.36
108 0.34
109 0.33
110 0.32
111 0.27
112 0.24
113 0.2
114 0.2
115 0.19
116 0.19
117 0.16
118 0.16
119 0.13
120 0.12
121 0.13
122 0.16
123 0.17
124 0.2
125 0.2
126 0.18
127 0.18
128 0.18
129 0.16
130 0.13
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.13
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.24
145 0.25
146 0.24
147 0.25
148 0.27
149 0.28
150 0.28
151 0.28
152 0.2
153 0.23
154 0.22
155 0.2
156 0.2
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.15
194 0.18
195 0.2
196 0.25
197 0.26
198 0.26
199 0.28
200 0.29
201 0.33
202 0.32
203 0.31
204 0.26
205 0.24
206 0.23
207 0.22
208 0.18
209 0.12
210 0.09
211 0.1
212 0.14
213 0.14
214 0.2
215 0.24
216 0.25
217 0.32
218 0.38
219 0.4
220 0.44
221 0.47
222 0.47
223 0.43
224 0.42
225 0.36
226 0.33
227 0.29
228 0.26
229 0.22
230 0.17
231 0.23
232 0.24
233 0.24
234 0.21
235 0.23
236 0.22
237 0.24
238 0.25
239 0.18
240 0.19
241 0.19
242 0.2
243 0.17
244 0.16
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.16
267 0.16
268 0.16
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.12
297 0.16
298 0.17
299 0.19
300 0.21
301 0.26
302 0.27
303 0.28
304 0.26
305 0.26
306 0.32
307 0.35
308 0.38
309 0.36
310 0.35
311 0.34
312 0.34
313 0.3
314 0.25
315 0.29
316 0.24
317 0.24
318 0.27
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.23
323 0.17
324 0.18
325 0.16
326 0.14
327 0.16
328 0.19
329 0.19
330 0.17
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.11
335 0.09
336 0.07
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.16
347 0.16
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.14
353 0.11
354 0.08
355 0.08
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.09
365 0.09
366 0.13
367 0.17
368 0.19
369 0.18
370 0.18
371 0.19
372 0.19
373 0.17
374 0.13
375 0.1
376 0.1
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.21
381 0.26
382 0.31
383 0.35
384 0.43
385 0.49
386 0.57
387 0.67
388 0.68
389 0.73
390 0.75
391 0.8
392 0.8
393 0.8
394 0.76
395 0.72
396 0.62
397 0.53
398 0.47
399 0.38
400 0.32
401 0.29
402 0.26
403 0.27
404 0.27
405 0.28
406 0.27
407 0.28
408 0.25
409 0.22
410 0.28
411 0.28
412 0.33
413 0.34
414 0.38
415 0.37
416 0.38
417 0.4
418 0.37
419 0.33
420 0.29
421 0.3
422 0.26
423 0.25
424 0.23
425 0.21
426 0.15
427 0.12
428 0.1
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.14
449 0.14
450 0.14
451 0.17
452 0.18
453 0.17
454 0.17
455 0.16
456 0.12
457 0.13
458 0.12
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.12
463 0.13
464 0.14
465 0.12
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.15
470 0.12
471 0.11
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.13
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.13
481 0.14
482 0.15
483 0.14
484 0.11
485 0.1
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.1
493 0.1
494 0.08
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.12
499 0.14
500 0.15
501 0.15
502 0.16
503 0.15
504 0.17
505 0.18
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.13
511 0.12
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.08
517 0.09
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.04
526 0.03
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.03
532 0.03
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.09
548 0.11
549 0.1
550 0.1
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.09
555 0.09
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.04
570 0.06
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.11
583 0.13
584 0.14
585 0.13
586 0.14
587 0.12
588 0.12
589 0.11
590 0.12
591 0.12
592 0.14
593 0.13
594 0.12
595 0.13
596 0.12
597 0.12
598 0.11
599 0.09
600 0.07
601 0.07
602 0.09
603 0.12
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.15
608 0.15
609 0.15
610 0.15
611 0.2
612 0.21
613 0.24
614 0.24
615 0.23
616 0.24
617 0.26
618 0.28
619 0.25
620 0.25
621 0.23
622 0.23
623 0.24
624 0.24
625 0.22
626 0.2
627 0.16
628 0.16
629 0.17
630 0.16
631 0.16
632 0.18
633 0.16
634 0.16
635 0.17
636 0.22
637 0.21
638 0.24
639 0.28
640 0.3
641 0.39
642 0.45
643 0.52
644 0.48
645 0.48
646 0.49
647 0.47
648 0.44
649 0.4
650 0.35
651 0.33
652 0.32
653 0.33
654 0.3
655 0.27
656 0.29
657 0.3
658 0.32
659 0.26
660 0.27
661 0.32
662 0.34
663 0.36
664 0.38
665 0.37
666 0.35
667 0.39
668 0.41
669 0.42
670 0.47
671 0.51
672 0.51
673 0.52
674 0.57
675 0.61
676 0.68
677 0.66
678 0.63
679 0.64
680 0.57
681 0.54
682 0.51
683 0.43
684 0.34
685 0.29
686 0.26
687 0.2
688 0.2
689 0.17
690 0.14
691 0.12
692 0.11
693 0.09
694 0.08
695 0.06
696 0.06
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.07
703 0.1
704 0.11
705 0.1
706 0.15
707 0.15
708 0.22
709 0.23
710 0.22
711 0.19
712 0.18
713 0.2
714 0.15
715 0.15
716 0.08
717 0.07
718 0.07
719 0.09
720 0.09
721 0.07
722 0.08
723 0.07
724 0.08
725 0.08
726 0.07
727 0.06
728 0.07
729 0.08
730 0.09
731 0.1
732 0.13
733 0.16
734 0.17
735 0.18
736 0.19
737 0.21
738 0.28
739 0.31
740 0.3
741 0.29
742 0.28
743 0.27
744 0.26
745 0.24
746 0.16
747 0.11
748 0.09
749 0.07
750 0.07
751 0.06
752 0.04
753 0.04
754 0.03
755 0.04
756 0.04
757 0.07
758 0.07
759 0.08
760 0.09
761 0.1
762 0.11
763 0.12
764 0.16
765 0.15
766 0.15
767 0.2
768 0.25
769 0.25
770 0.24
771 0.23
772 0.2
773 0.2
774 0.26
775 0.21
776 0.16
777 0.19
778 0.23
779 0.27
780 0.29
781 0.31
782 0.27
783 0.28
784 0.27
785 0.25
786 0.2
787 0.18
788 0.21
789 0.18
790 0.17
791 0.19
792 0.18
793 0.19
794 0.21
795 0.21
796 0.17
797 0.21
798 0.21
799 0.25
800 0.28
801 0.32
802 0.3
803 0.31
804 0.33
805 0.31
806 0.32
807 0.26
808 0.24
809 0.19
810 0.22
811 0.22
812 0.27
813 0.29
814 0.26
815 0.29
816 0.35
817 0.39
818 0.37
819 0.38
820 0.33
821 0.32
822 0.33
823 0.31
824 0.33
825 0.32
826 0.34
827 0.32
828 0.28
829 0.26
830 0.25
831 0.24
832 0.15
833 0.13
834 0.1
835 0.11
836 0.12
837 0.12
838 0.13
839 0.14
840 0.15
841 0.19
842 0.2
843 0.27
844 0.31
845 0.35
846 0.4
847 0.41
848 0.48
849 0.48
850 0.5
851 0.44
852 0.41
853 0.44
854 0.4
855 0.41
856 0.38
857 0.38
858 0.39
859 0.4
860 0.39
861 0.32
862 0.33
863 0.32
864 0.27
865 0.22
866 0.17
867 0.18
868 0.19
869 0.17
870 0.16
871 0.13
872 0.16
873 0.15
874 0.14
875 0.11
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.11
880 0.08
881 0.08
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.11
887 0.1
888 0.13
889 0.17
890 0.18
891 0.26
892 0.35
893 0.41
894 0.46
895 0.5
896 0.51
897 0.54
898 0.58
899 0.53
900 0.54
901 0.52
902 0.5
903 0.5
904 0.5
905 0.43
906 0.38
907 0.36
908 0.29
909 0.25
910 0.25
911 0.21
912 0.17
913 0.17
914 0.16
915 0.16
916 0.13
917 0.11
918 0.08
919 0.05
920 0.05
921 0.08
922 0.09
923 0.08
924 0.08
925 0.09
926 0.09
927 0.1
928 0.09
929 0.07
930 0.07
931 0.1
932 0.11
933 0.11
934 0.11
935 0.1
936 0.11
937 0.11
938 0.1
939 0.08
940 0.08
941 0.13
942 0.14
943 0.15
944 0.16
945 0.17
946 0.2
947 0.2
948 0.22
949 0.16
950 0.19
951 0.18
952 0.19
953 0.25
954 0.3
955 0.33
956 0.35
957 0.39
958 0.38
959 0.43
960 0.47
961 0.46
962 0.44
963 0.41
964 0.4
965 0.37
966 0.43
967 0.38
968 0.32
969 0.26
970 0.2
971 0.19
972 0.15
973 0.15
974 0.07
975 0.07
976 0.09
977 0.11
978 0.12
979 0.12
980 0.12
981 0.11
982 0.15
983 0.17
984 0.21
985 0.25
986 0.27
987 0.28
988 0.3
989 0.31
990 0.3
991 0.28
992 0.24
993 0.21
994 0.22
995 0.22
996 0.23
997 0.23
998 0.21
999 0.21
1000 0.19
1001 0.22
1002 0.28
1003 0.36
1004 0.42
1005 0.45
1006 0.54
1007 0.59
1008 0.69
1009 0.74
1010 0.71
1011 0.65
1012 0.63
1013 0.6
1014 0.61
1015 0.55
1016 0.48
1017 0.41
1018 0.38
1019 0.37
1020 0.34
1021 0.34
1022 0.32
1023 0.34
1024 0.36
1025 0.39
1026 0.38
1027 0.37
1028 0.35
1029 0.32
1030 0.25
1031 0.22
1032 0.19
1033 0.13
1034 0.09
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.1
1038 0.14
1039 0.17
1040 0.19
1041 0.25
1042 0.27
1043 0.3
1044 0.34
1045 0.37
1046 0.34
1047 0.31
1048 0.32
1049 0.25
1050 0.23
1051 0.2
1052 0.16
1053 0.1
1054 0.08
1055 0.08
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.05
1059 0.05
1060 0.05
1061 0.05
1062 0.07
1063 0.1
1064 0.12
1065 0.15
1066 0.17
1067 0.19
1068 0.21
1069 0.21
1070 0.27
1071 0.25
1072 0.29
1073 0.31
1074 0.31
1075 0.29
1076 0.27
1077 0.27
1078 0.19
1079 0.2
1080 0.13
1081 0.1
1082 0.08
1083 0.08
1084 0.08
1085 0.08
1086 0.1
1087 0.08
1088 0.1
1089 0.11
1090 0.14
1091 0.16
1092 0.19
1093 0.21
1094 0.2
1095 0.21
1096 0.21
1097 0.23
1098 0.23
1099 0.27
1100 0.32
1101 0.35
1102 0.41
1103 0.46
1104 0.54
1105 0.55
1106 0.56
1107 0.55
1108 0.53
1109 0.53
1110 0.55
1111 0.52
1112 0.45
1113 0.43
1114 0.44