Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E878

Protein Details
Accession A0A178E878    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-72ANEDERPLKKRKTAQSQRTAGSHydrophilic
178-198ATQRRVRRRAITSVDKKRRLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MAPARGKLHKTADSGTKRRSTRGSGNSQHDDVPEVFQEMLDEEQEARSSGANEDERPLKKRKTAQSQRTAGSSSQSQPSKRAVPRASRSSPQLSHDPSTSSAPPTTANEGSIDNDAPRHTRILQTIIDSDESDGSDMEWEDALGDGLDSDDEEEPVVTGPEIGDISIKIGGNKVEEVATQRRVRRRAITSVDKKRRLDIHKMHVLCLLYHVHRRNAWCNDRRTQSTLRKMVSPKILSNLVPDPTITQYSASKRFIDGMNDLKMLWSKRFKITAQGMYKPRWTEVEAAIRPFSDFDDLDDPMDKDDFRNAAHILQGSQDVGTQLFCTLLRAIGIEARLVCSLQPLPFASAAERATPQKAGPSKHTIILDPYNKPAEVSPTRPRVQTPSRPKKLSRLERIMGERHSVLNKTGVAPKKQKAYHTPYPVYWVEVFNSIYQKWVPIDTHSTFTVNSPEKLEPPLGFAQNSLTYAIAFDDDYTAKDVTRRYAKAYNAKTRKYRVECTPDGDKWYRKTMKFFKRSTTLDRDQVEDAALGRKEAAEGIPKNVQDFKGHPVYVLERHLRLNEVIHPMNQVGRVNCGTAMNPKMESIYRRSNVHLVRSSDKWYRMGRDVKEGEQPLRHAKPKKGARQQSVGIDMDMDEQMDEAGIGLYAEFQTELYIPPPIIKGRVPRNQYGNLDLYVPSMCPAGGTHIRHKLASKAARVVGVDFADAVTGFSFKGRHGTAIVQGVVVAQEYADAVTAVIEGMEYQQEESELAARSSEALRLWRRFYLGLRIAERVNAIEIDGEKGPTIDVQDEITRADKRLQEKKMAGGFFPDEAEADFAEPTGQNYQPPQYDHADYDGGGGFLPDDDEDEGVAGQTSNQPHPSATVNLNREHSFESSILDSQQLLPRRRSSLGDVYSSEDDDDDDVSGFIKHNFPTTDGTSTSKESGDPGVAFLKTTSELTARPAEPDMAGGFLTEDTKTVPEVTPARSPNSNITSAALSDKGKDVALESPPSSMPSDTGSLPLEDPEDEDADPDWLVEAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.66
4 0.62
5 0.65
6 0.65
7 0.63
8 0.63
9 0.65
10 0.68
11 0.68
12 0.75
13 0.75
14 0.7
15 0.64
16 0.54
17 0.49
18 0.39
19 0.33
20 0.25
21 0.21
22 0.19
23 0.17
24 0.17
25 0.14
26 0.14
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.19
38 0.21
39 0.22
40 0.26
41 0.33
42 0.37
43 0.41
44 0.47
45 0.47
46 0.52
47 0.6
48 0.66
49 0.7
50 0.76
51 0.82
52 0.84
53 0.85
54 0.8
55 0.74
56 0.66
57 0.56
58 0.49
59 0.44
60 0.37
61 0.38
62 0.41
63 0.39
64 0.4
65 0.46
66 0.5
67 0.51
68 0.56
69 0.56
70 0.6
71 0.68
72 0.73
73 0.73
74 0.69
75 0.7
76 0.68
77 0.64
78 0.59
79 0.58
80 0.54
81 0.51
82 0.48
83 0.44
84 0.38
85 0.39
86 0.37
87 0.31
88 0.27
89 0.24
90 0.25
91 0.26
92 0.3
93 0.26
94 0.24
95 0.23
96 0.23
97 0.24
98 0.23
99 0.2
100 0.15
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.18
105 0.2
106 0.19
107 0.23
108 0.26
109 0.29
110 0.3
111 0.3
112 0.31
113 0.29
114 0.28
115 0.24
116 0.22
117 0.18
118 0.16
119 0.13
120 0.11
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.08
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.12
162 0.13
163 0.18
164 0.22
165 0.28
166 0.32
167 0.38
168 0.45
169 0.49
170 0.54
171 0.57
172 0.57
173 0.59
174 0.62
175 0.67
176 0.7
177 0.76
178 0.81
179 0.8
180 0.76
181 0.73
182 0.73
183 0.69
184 0.69
185 0.67
186 0.66
187 0.67
188 0.67
189 0.61
190 0.56
191 0.5
192 0.39
193 0.33
194 0.27
195 0.22
196 0.29
197 0.31
198 0.32
199 0.35
200 0.4
201 0.46
202 0.51
203 0.58
204 0.58
205 0.61
206 0.65
207 0.68
208 0.68
209 0.65
210 0.65
211 0.64
212 0.66
213 0.67
214 0.61
215 0.61
216 0.59
217 0.6
218 0.59
219 0.53
220 0.45
221 0.42
222 0.43
223 0.37
224 0.38
225 0.35
226 0.27
227 0.24
228 0.22
229 0.19
230 0.19
231 0.2
232 0.16
233 0.14
234 0.18
235 0.24
236 0.3
237 0.31
238 0.29
239 0.28
240 0.31
241 0.31
242 0.3
243 0.28
244 0.26
245 0.27
246 0.26
247 0.25
248 0.23
249 0.25
250 0.23
251 0.25
252 0.26
253 0.27
254 0.32
255 0.37
256 0.36
257 0.42
258 0.47
259 0.51
260 0.5
261 0.54
262 0.53
263 0.52
264 0.55
265 0.48
266 0.41
267 0.35
268 0.31
269 0.27
270 0.28
271 0.35
272 0.32
273 0.33
274 0.32
275 0.3
276 0.28
277 0.24
278 0.2
279 0.13
280 0.11
281 0.12
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.16
287 0.14
288 0.15
289 0.12
290 0.1
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.16
298 0.16
299 0.13
300 0.12
301 0.13
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.1
329 0.12
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.14
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.15
343 0.19
344 0.23
345 0.24
346 0.27
347 0.33
348 0.34
349 0.37
350 0.38
351 0.32
352 0.31
353 0.36
354 0.35
355 0.29
356 0.31
357 0.28
358 0.27
359 0.27
360 0.23
361 0.24
362 0.23
363 0.27
364 0.32
365 0.37
366 0.4
367 0.4
368 0.41
369 0.41
370 0.46
371 0.5
372 0.54
373 0.58
374 0.64
375 0.68
376 0.68
377 0.7
378 0.73
379 0.72
380 0.7
381 0.67
382 0.61
383 0.62
384 0.64
385 0.58
386 0.48
387 0.4
388 0.32
389 0.26
390 0.25
391 0.21
392 0.18
393 0.16
394 0.16
395 0.16
396 0.21
397 0.24
398 0.28
399 0.33
400 0.36
401 0.41
402 0.43
403 0.46
404 0.48
405 0.53
406 0.55
407 0.57
408 0.56
409 0.49
410 0.52
411 0.47
412 0.41
413 0.33
414 0.25
415 0.18
416 0.18
417 0.18
418 0.14
419 0.16
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.11
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.18
429 0.18
430 0.2
431 0.19
432 0.2
433 0.18
434 0.18
435 0.23
436 0.18
437 0.18
438 0.19
439 0.19
440 0.19
441 0.2
442 0.21
443 0.14
444 0.17
445 0.19
446 0.17
447 0.16
448 0.15
449 0.15
450 0.14
451 0.15
452 0.11
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.1
467 0.11
468 0.14
469 0.2
470 0.21
471 0.23
472 0.28
473 0.33
474 0.4
475 0.46
476 0.52
477 0.53
478 0.57
479 0.57
480 0.57
481 0.61
482 0.58
483 0.56
484 0.53
485 0.54
486 0.51
487 0.51
488 0.51
489 0.43
490 0.43
491 0.41
492 0.37
493 0.32
494 0.39
495 0.41
496 0.36
497 0.44
498 0.48
499 0.55
500 0.61
501 0.6
502 0.56
503 0.57
504 0.59
505 0.58
506 0.56
507 0.5
508 0.47
509 0.46
510 0.43
511 0.36
512 0.33
513 0.26
514 0.18
515 0.15
516 0.12
517 0.11
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.1
525 0.11
526 0.14
527 0.17
528 0.17
529 0.18
530 0.2
531 0.2
532 0.16
533 0.17
534 0.19
535 0.21
536 0.21
537 0.2
538 0.19
539 0.21
540 0.21
541 0.24
542 0.21
543 0.17
544 0.19
545 0.19
546 0.19
547 0.17
548 0.16
549 0.16
550 0.19
551 0.18
552 0.17
553 0.18
554 0.17
555 0.18
556 0.18
557 0.16
558 0.11
559 0.13
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.13
564 0.12
565 0.14
566 0.15
567 0.13
568 0.13
569 0.13
570 0.14
571 0.15
572 0.16
573 0.18
574 0.24
575 0.26
576 0.27
577 0.29
578 0.34
579 0.35
580 0.39
581 0.38
582 0.33
583 0.34
584 0.35
585 0.38
586 0.36
587 0.36
588 0.35
589 0.32
590 0.32
591 0.36
592 0.41
593 0.38
594 0.42
595 0.42
596 0.39
597 0.42
598 0.41
599 0.36
600 0.31
601 0.32
602 0.3
603 0.33
604 0.37
605 0.37
606 0.39
607 0.47
608 0.54
609 0.62
610 0.65
611 0.69
612 0.67
613 0.68
614 0.66
615 0.6
616 0.55
617 0.45
618 0.35
619 0.26
620 0.21
621 0.17
622 0.13
623 0.1
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.04
628 0.04
629 0.03
630 0.03
631 0.02
632 0.02
633 0.02
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.07
646 0.09
647 0.09
648 0.11
649 0.13
650 0.2
651 0.28
652 0.36
653 0.39
654 0.42
655 0.47
656 0.51
657 0.5
658 0.47
659 0.4
660 0.33
661 0.3
662 0.25
663 0.21
664 0.15
665 0.13
666 0.1
667 0.08
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.11
672 0.16
673 0.19
674 0.25
675 0.32
676 0.33
677 0.34
678 0.35
679 0.34
680 0.36
681 0.39
682 0.36
683 0.34
684 0.34
685 0.34
686 0.34
687 0.3
688 0.24
689 0.18
690 0.15
691 0.1
692 0.09
693 0.07
694 0.07
695 0.06
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.11
703 0.12
704 0.13
705 0.14
706 0.16
707 0.18
708 0.21
709 0.21
710 0.16
711 0.15
712 0.14
713 0.13
714 0.11
715 0.07
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.03
724 0.04
725 0.03
726 0.03
727 0.03
728 0.03
729 0.03
730 0.04
731 0.04
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.06
736 0.06
737 0.09
738 0.09
739 0.09
740 0.09
741 0.08
742 0.1
743 0.1
744 0.12
745 0.1
746 0.16
747 0.22
748 0.26
749 0.29
750 0.29
751 0.3
752 0.31
753 0.32
754 0.35
755 0.35
756 0.37
757 0.36
758 0.37
759 0.35
760 0.34
761 0.32
762 0.23
763 0.17
764 0.12
765 0.1
766 0.09
767 0.1
768 0.11
769 0.11
770 0.11
771 0.1
772 0.1
773 0.1
774 0.09
775 0.1
776 0.08
777 0.08
778 0.1
779 0.11
780 0.11
781 0.12
782 0.15
783 0.15
784 0.16
785 0.2
786 0.23
787 0.3
788 0.38
789 0.42
790 0.46
791 0.47
792 0.53
793 0.54
794 0.51
795 0.43
796 0.38
797 0.35
798 0.27
799 0.26
800 0.18
801 0.12
802 0.12
803 0.13
804 0.09
805 0.08
806 0.07
807 0.07
808 0.08
809 0.08
810 0.09
811 0.12
812 0.12
813 0.13
814 0.16
815 0.21
816 0.23
817 0.25
818 0.27
819 0.28
820 0.3
821 0.29
822 0.3
823 0.26
824 0.23
825 0.23
826 0.19
827 0.14
828 0.12
829 0.1
830 0.07
831 0.06
832 0.07
833 0.05
834 0.06
835 0.06
836 0.06
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.06
841 0.07
842 0.05
843 0.05
844 0.09
845 0.13
846 0.15
847 0.17
848 0.18
849 0.18
850 0.2
851 0.23
852 0.23
853 0.26
854 0.31
855 0.33
856 0.36
857 0.4
858 0.39
859 0.38
860 0.36
861 0.32
862 0.27
863 0.24
864 0.22
865 0.2
866 0.2
867 0.19
868 0.17
869 0.16
870 0.16
871 0.22
872 0.27
873 0.29
874 0.33
875 0.38
876 0.41
877 0.43
878 0.43
879 0.44
880 0.46
881 0.45
882 0.44
883 0.41
884 0.41
885 0.4
886 0.37
887 0.3
888 0.21
889 0.17
890 0.14
891 0.13
892 0.09
893 0.08
894 0.07
895 0.08
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.13
900 0.13
901 0.18
902 0.19
903 0.21
904 0.25
905 0.28
906 0.3
907 0.28
908 0.32
909 0.3
910 0.32
911 0.31
912 0.26
913 0.23
914 0.21
915 0.22
916 0.21
917 0.19
918 0.18
919 0.19
920 0.19
921 0.19
922 0.17
923 0.17
924 0.15
925 0.15
926 0.15
927 0.14
928 0.14
929 0.19
930 0.25
931 0.24
932 0.24
933 0.25
934 0.25
935 0.23
936 0.24
937 0.2
938 0.14
939 0.13
940 0.11
941 0.1
942 0.09
943 0.1
944 0.08
945 0.08
946 0.09
947 0.1
948 0.11
949 0.13
950 0.13
951 0.18
952 0.22
953 0.26
954 0.32
955 0.34
956 0.38
957 0.39
958 0.41
959 0.44
960 0.45
961 0.43
962 0.36
963 0.35
964 0.32
965 0.3
966 0.3
967 0.24
968 0.2
969 0.19
970 0.21
971 0.2
972 0.19
973 0.18
974 0.17
975 0.19
976 0.23
977 0.25
978 0.23
979 0.25
980 0.25
981 0.27
982 0.27
983 0.22
984 0.19
985 0.18
986 0.2
987 0.18
988 0.2
989 0.2
990 0.19
991 0.19
992 0.19
993 0.17
994 0.15
995 0.16
996 0.16
997 0.16
998 0.15
999 0.15
1000 0.15
1001 0.14
1002 0.14
1003 0.12