Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E1Q1

Protein Details
Accession A0A178E1Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
501-524VCPFCPDREHKYPRPDNLQRHVRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-72KARTIPPPQGKPIRIPSRKPAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, cyto 8.5, pero 4, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MAPNDTQLTLALGLAGLHPSDSTNSSVESLALVEAPKKIPPTFKIPELPSKARTIPPPQGKPIRIPSRKPAKTRLGLPITLHAPDTLATVLACADTGADVNIISNDLAFALANGKIVEAFFQINALCSFGIETEVSFSMQCAFYVLHKVATPIIMGMGFLAETKTMTEHRERLVRVPRPAFQALSVRSINKPQTLLACQLDRLGTLATADSGAEIDLMSSSFASERGFIVHDGEEKIEMADGSIAITSGVVQVQLAITDINQLKSKVASVDFFLLDNLVHDLIVGEDSLEELEVFTTNRHALVDAPIKYGPLGLNRIRHLGAIDRITKWIKNKILGKSSDDDDQVGDTPSCVSNLQEIDRREREAARIAALPLDEQEAAIQQEVQRQKDYNTNLPFPSRDIAAGSPPRTNLPYLLDLSSRLLPPPNPILPLVGTFKCDFPNCDAAPFQTQYLLNSHANIHSQSRPHFCPVANCPRGEGGRGFKRKNEMIRHGIVHRSPGYVCPFCPDREHKYPRPDNLQRHVRVHHVDMNEDDARLQEVLAQRPEGGSRGRRRFER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.07
7 0.1
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.17
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.13
22 0.14
23 0.17
24 0.2
25 0.22
26 0.28
27 0.31
28 0.39
29 0.41
30 0.46
31 0.51
32 0.53
33 0.6
34 0.62
35 0.63
36 0.58
37 0.58
38 0.56
39 0.53
40 0.55
41 0.53
42 0.55
43 0.59
44 0.62
45 0.66
46 0.71
47 0.69
48 0.69
49 0.72
50 0.73
51 0.7
52 0.69
53 0.71
54 0.73
55 0.78
56 0.77
57 0.76
58 0.75
59 0.73
60 0.74
61 0.74
62 0.68
63 0.64
64 0.59
65 0.55
66 0.47
67 0.41
68 0.35
69 0.25
70 0.19
71 0.17
72 0.16
73 0.11
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.06
152 0.08
153 0.11
154 0.16
155 0.19
156 0.22
157 0.28
158 0.29
159 0.34
160 0.43
161 0.45
162 0.48
163 0.49
164 0.49
165 0.49
166 0.5
167 0.43
168 0.36
169 0.36
170 0.31
171 0.32
172 0.3
173 0.26
174 0.26
175 0.3
176 0.31
177 0.26
178 0.25
179 0.21
180 0.24
181 0.24
182 0.27
183 0.24
184 0.22
185 0.2
186 0.21
187 0.19
188 0.15
189 0.14
190 0.1
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.02
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.02
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.11
290 0.17
291 0.16
292 0.18
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.14
298 0.11
299 0.15
300 0.17
301 0.21
302 0.22
303 0.24
304 0.23
305 0.22
306 0.2
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.2
311 0.18
312 0.21
313 0.22
314 0.24
315 0.24
316 0.28
317 0.27
318 0.32
319 0.38
320 0.41
321 0.46
322 0.46
323 0.46
324 0.42
325 0.4
326 0.37
327 0.31
328 0.25
329 0.18
330 0.17
331 0.14
332 0.13
333 0.11
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.14
343 0.18
344 0.2
345 0.26
346 0.28
347 0.29
348 0.28
349 0.28
350 0.28
351 0.28
352 0.27
353 0.22
354 0.22
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.15
359 0.1
360 0.11
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.14
370 0.18
371 0.2
372 0.21
373 0.22
374 0.24
375 0.3
376 0.34
377 0.36
378 0.37
379 0.39
380 0.38
381 0.39
382 0.38
383 0.33
384 0.3
385 0.22
386 0.17
387 0.16
388 0.15
389 0.2
390 0.25
391 0.24
392 0.25
393 0.25
394 0.26
395 0.26
396 0.26
397 0.21
398 0.19
399 0.21
400 0.21
401 0.22
402 0.2
403 0.2
404 0.22
405 0.22
406 0.19
407 0.16
408 0.17
409 0.16
410 0.2
411 0.25
412 0.25
413 0.24
414 0.24
415 0.24
416 0.22
417 0.25
418 0.25
419 0.19
420 0.2
421 0.2
422 0.21
423 0.23
424 0.23
425 0.23
426 0.23
427 0.3
428 0.28
429 0.29
430 0.29
431 0.28
432 0.32
433 0.3
434 0.26
435 0.22
436 0.22
437 0.21
438 0.23
439 0.25
440 0.21
441 0.21
442 0.22
443 0.2
444 0.22
445 0.22
446 0.23
447 0.23
448 0.27
449 0.31
450 0.36
451 0.38
452 0.4
453 0.42
454 0.39
455 0.43
456 0.48
457 0.53
458 0.5
459 0.47
460 0.44
461 0.45
462 0.45
463 0.4
464 0.36
465 0.34
466 0.4
467 0.49
468 0.5
469 0.49
470 0.56
471 0.6
472 0.64
473 0.64
474 0.63
475 0.61
476 0.64
477 0.64
478 0.6
479 0.6
480 0.52
481 0.48
482 0.42
483 0.37
484 0.32
485 0.33
486 0.37
487 0.33
488 0.32
489 0.32
490 0.33
491 0.33
492 0.4
493 0.41
494 0.43
495 0.51
496 0.6
497 0.62
498 0.7
499 0.77
500 0.77
501 0.81
502 0.82
503 0.81
504 0.82
505 0.84
506 0.79
507 0.77
508 0.72
509 0.69
510 0.64
511 0.6
512 0.56
513 0.48
514 0.44
515 0.39
516 0.43
517 0.36
518 0.31
519 0.26
520 0.2
521 0.2
522 0.17
523 0.15
524 0.13
525 0.17
526 0.23
527 0.26
528 0.26
529 0.25
530 0.26
531 0.28
532 0.27
533 0.29
534 0.32
535 0.4
536 0.49