FuNGI

A0A178DM79

Protein Details

Accession

A0A178DM79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-131	DVEEKMDKRRKMRREAREQQERDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-120	RRKMR

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 7.5, cyto_mito 6, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13181 TPR_8

Amino Acid Sequences

MSGKRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQMKEALAKRAVQIGHAPPSAYGVTEKKEEDEEDDRFQDPDSEVGLFSNGLNYDQEDDEADRIYQDVEEKMDKRRKMRREAREQQERDDYEKNNPKIQVQFADLKRALGSVTEEQWAALPEVGDMTGKAKRAREARMANARSYAVPDSVIQAASKVGELDTSISTNDSDSGMTTNFASIGAAQLSAFAVRLDSAASNPGVQTQTSGTATSVDPKGYMTALNQSQSQVGEDGLLPIEDANRGRVLLESAVKTNVHNGPAYVALARLEERMGKKQTAKKVIQRGCEMAPKSIGVWKEAIRLHDDNILNAKIVAANGIKLNPKAVALWQYAIELEQTPAAKKKIIRQALDHNPQSVELWKSLINETDDVENVKLLFAKATETVPLSEELWISYALVSDADAAQQILNKARKAIPTSWAIWVQACRLQEQLGRVDMCIKVMERAAKALTKEHATIKREEWITQAEECEEDGSTGTAAAIIKATVGWRLDENEERRDTWLEDVKSIRSRGHYETARAVLEHAVSVFPTSTNVWHASADLEKQHGTTESLLNILESAVNACPDSESLWLLYAREMWHSGNPEGARRVLGRSFGELPGNENLYTRAVDFEVNAGNYDEARNFLQIARDTAATDRIFMKSAALERQLENYEAAIDLCNQGLQNWPGSWKLHAIKGQVYEQLSKLKEAHEAFSIGTRAAPKSPMLFILLSRLQEKQGMVVKARSTLDRGKQQNPKNPELLCEAVRLERRHNNISAAQKMISSALQECPTSGLLWSEKIMYLEARTTRRPRVLEALKKVENDNRLLIVAARLFWSERSLDKARSWFTRAIVQDPDNGDGWIWFYKFLEQHGQEEMRNELITKIALAEPKHGEIWQSIAKDPKNARMSLEEILLAGVKIAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.32
3	0.29
4	0.25
5	0.18
6	0.15
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.08
12	0.09
13	0.1
14	0.11
15	0.15
16	0.15
17	0.16
18	0.2
19	0.23
20	0.25
21	0.3
22	0.3
23	0.29
24	0.31
25	0.32
26	0.31
27	0.36
28	0.38
29	0.33
30	0.32
31	0.29
32	0.28
33	0.32
34	0.33
35	0.31
36	0.28
37	0.3
38	0.3
39	0.35
40	0.34
41	0.31
42	0.33
43	0.32
44	0.36
45	0.35
46	0.34
47	0.28
48	0.31
49	0.29
50	0.23
51	0.22
52	0.19
53	0.21
54	0.24
55	0.25
56	0.24
57	0.26
58	0.27
59	0.29
60	0.31
61	0.32
62	0.33
63	0.34
64	0.33
65	0.31
66	0.3
67	0.27
68	0.22
69	0.2
70	0.16
71	0.15
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.11
76	0.1
77	0.12
78	0.1
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.14
83	0.14
84	0.14
85	0.13
86	0.14
87	0.14
88	0.15
89	0.14
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.11
95	0.11
96	0.13
97	0.2
98	0.22
99	0.31
100	0.39
101	0.43
102	0.5
103	0.58
104	0.64
105	0.69
106	0.78
107	0.79
108	0.82
109	0.88
110	0.89
111	0.91
112	0.84
113	0.79
114	0.78
115	0.7
116	0.64
117	0.6
118	0.52
119	0.51
120	0.58
121	0.55
122	0.52
123	0.51
124	0.5
125	0.49
126	0.51
127	0.44
128	0.39
129	0.44
130	0.4
131	0.47
132	0.43
133	0.39
134	0.34
135	0.31
136	0.26
137	0.18
138	0.21
139	0.15
140	0.17
141	0.17
142	0.17
143	0.17
144	0.18
145	0.18
146	0.14
147	0.11
148	0.09
149	0.08
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.09
155	0.11
156	0.14
157	0.18
158	0.2
159	0.26
160	0.32
161	0.38
162	0.44
163	0.48
164	0.54
165	0.61
166	0.61
167	0.56
168	0.53
169	0.48
170	0.39
171	0.36
172	0.28
173	0.18
174	0.16
175	0.15
176	0.15
177	0.16
178	0.16
179	0.12
180	0.11
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.08
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.07
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.12
228	0.12
229	0.11
230	0.12
231	0.11
232	0.14
233	0.14
234	0.15
235	0.12
236	0.13
237	0.13
238	0.17
239	0.17
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.12
245	0.13
246	0.09
247	0.15
248	0.17
249	0.18
250	0.18
251	0.18
252	0.19
253	0.18
254	0.18
255	0.12
256	0.1
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.11
274	0.14
275	0.13
276	0.14
277	0.16
278	0.16
279	0.16
280	0.2
281	0.2
282	0.19
283	0.17
284	0.16
285	0.16
286	0.16
287	0.17
288	0.11
289	0.09
290	0.07
291	0.08
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.11
296	0.14
297	0.2
298	0.23
299	0.26
300	0.32
301	0.38
302	0.46
303	0.51
304	0.55
305	0.56
306	0.63
307	0.65
308	0.63
309	0.6
310	0.54
311	0.48
312	0.48
313	0.42
314	0.33
315	0.29
316	0.23
317	0.21
318	0.21
319	0.19
320	0.14
321	0.15
322	0.14
323	0.19
324	0.21
325	0.21
326	0.23
327	0.24
328	0.24
329	0.28
330	0.27
331	0.23
332	0.24
333	0.23
334	0.18
335	0.17
336	0.16
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.1
344	0.12
345	0.11
346	0.12
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.11
351	0.14
352	0.13
353	0.14
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.12
358	0.11
359	0.07
360	0.06
361	0.07
362	0.08
363	0.09
364	0.12
365	0.13
366	0.15
367	0.16
368	0.24
369	0.32
370	0.38
371	0.39
372	0.4
373	0.48
374	0.55
375	0.61
376	0.54
377	0.46
378	0.4
379	0.38
380	0.35
381	0.28
382	0.19
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.13
387	0.13
388	0.15
389	0.13
390	0.12
391	0.13
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.09
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.08
416	0.07
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.06
431	0.11
432	0.14
433	0.14
434	0.16
435	0.18
436	0.2
437	0.23
438	0.24
439	0.22
440	0.23
441	0.25
442	0.25
443	0.24
444	0.22
445	0.19
446	0.17
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.11
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.14
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.13
459	0.15
460	0.14
461	0.12
462	0.11
463	0.1
464	0.08
465	0.09
466	0.12
467	0.1
468	0.11
469	0.12
470	0.13
471	0.13
472	0.14
473	0.14
474	0.14
475	0.16
476	0.21
477	0.26
478	0.26
479	0.28
480	0.27
481	0.31
482	0.3
483	0.29
484	0.25
485	0.21
486	0.21
487	0.19
488	0.18
489	0.13
490	0.12
491	0.11
492	0.1
493	0.07
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.06
509	0.06
510	0.07
511	0.07
512	0.09
513	0.12
514	0.17
515	0.2
516	0.23
517	0.24
518	0.24
519	0.25
520	0.25
521	0.23
522	0.21
523	0.25
524	0.2
525	0.21
526	0.22
527	0.24
528	0.26
529	0.26
530	0.24
531	0.21
532	0.24
533	0.26
534	0.32
535	0.31
536	0.29
537	0.31
538	0.32
539	0.29
540	0.25
541	0.22
542	0.15
543	0.13
544	0.11
545	0.08
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.05
550	0.04
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.09
555	0.11
556	0.11
557	0.11
558	0.11
559	0.11
560	0.12
561	0.13
562	0.11
563	0.11
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.12
571	0.1
572	0.11
573	0.11
574	0.1
575	0.09
576	0.08
577	0.06
578	0.04
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.06
586	0.07
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.09
596	0.1
597	0.11
598	0.11
599	0.14
600	0.17
601	0.16
602	0.19
603	0.19
604	0.2
605	0.21
606	0.2
607	0.19
608	0.17
609	0.19
610	0.16
611	0.19
612	0.17
613	0.19
614	0.21
615	0.21
616	0.22
617	0.2
618	0.21
619	0.2
620	0.21
621	0.18
622	0.15
623	0.15
624	0.14
625	0.14
626	0.12
627	0.1
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.1
632	0.11
633	0.1
634	0.11
635	0.1
636	0.1
637	0.1
638	0.1
639	0.09
640	0.09
641	0.09
642	0.09
643	0.1
644	0.1
645	0.14
646	0.15
647	0.17
648	0.16
649	0.16
650	0.16
651	0.17
652	0.21
653	0.17
654	0.17
655	0.17
656	0.16
657	0.17
658	0.16
659	0.16
660	0.13
661	0.15
662	0.17
663	0.19
664	0.2
665	0.19
666	0.23
667	0.24
668	0.22
669	0.2
670	0.16
671	0.14
672	0.12
673	0.11
674	0.08
675	0.08
676	0.07
677	0.07
678	0.08
679	0.07
680	0.07
681	0.11
682	0.12
683	0.13
684	0.13
685	0.15
686	0.17
687	0.18
688	0.19
689	0.21
690	0.23
691	0.26
692	0.29
693	0.3
694	0.31
695	0.33
696	0.35
697	0.32
698	0.31
699	0.28
700	0.26
701	0.3
702	0.27
703	0.26
704	0.25
705	0.22
706	0.27
707	0.26
708	0.26
709	0.22
710	0.22
711	0.2
712	0.22
713	0.22
714	0.15
715	0.15
716	0.15
717	0.15
718	0.15
719	0.17
720	0.15
721	0.17
722	0.18
723	0.17
724	0.18
725	0.17
726	0.15
727	0.2
728	0.21
729	0.2
730	0.21
731	0.21
732	0.19
733	0.22
734	0.22
735	0.21
736	0.25
737	0.26
738	0.27
739	0.3
740	0.3
741	0.32
742	0.33
743	0.29
744	0.27
745	0.32
746	0.37
747	0.42
748	0.47
749	0.52
750	0.59
751	0.66
752	0.71
753	0.71
754	0.69
755	0.66
756	0.6
757	0.54
758	0.51
759	0.46
760	0.37
761	0.32
762	0.28
763	0.28
764	0.34
765	0.33
766	0.34
767	0.38
768	0.43
769	0.46
770	0.47
771	0.46
772	0.46
773	0.51
774	0.48
775	0.43
776	0.37
777	0.32
778	0.3
779	0.27
780	0.21
781	0.16
782	0.14
783	0.16
784	0.18
785	0.18
786	0.17
787	0.18
788	0.18
789	0.17
790	0.15
791	0.14
792	0.13
793	0.15
794	0.15
795	0.15
796	0.15
797	0.15
798	0.16
799	0.14
800	0.14
801	0.18
802	0.23
803	0.26
804	0.33
805	0.39
806	0.45
807	0.51
808	0.52
809	0.51
810	0.55
811	0.61
812	0.63
813	0.65
814	0.67
815	0.64
816	0.63
817	0.63
818	0.58
819	0.53
820	0.47
821	0.4
822	0.33
823	0.29
824	0.28
825	0.24
826	0.22
827	0.18
828	0.15
829	0.14
830	0.13
831	0.14
832	0.14
833	0.16
834	0.15
835	0.15
836	0.22
837	0.26
838	0.29
839	0.33
840	0.39
841	0.42
842	0.45
843	0.48
844	0.44
845	0.42
846	0.46
847	0.43
848	0.41
849	0.42
850	0.38
851	0.39
852	0.38
853	0.38
854	0.31
855	0.29
856	0.24
857	0.18
858	0.19
859	0.17
860	0.15
861	0.13
862	0.13
863	0.19
864	0.2
865	0.24
866	0.31
867	0.3
868	0.32
869	0.38
870	0.4
871	0.36
872	0.37
873	0.36
874	0.28
875	0.26
876	0.24
877	0.18
878	0.17
879	0.15
880	0.13
881	0.13
882	0.14
883	0.18
884	0.18
885	0.24
886	0.26
887	0.28
888	0.29
889	0.27
890	0.26
891	0.23
892	0.28
893	0.27
894	0.26
895	0.27
896	0.33
897	0.34
898	0.41
899	0.44
900	0.48
901	0.48
902	0.47
903	0.47
904	0.44
905	0.46
906	0.4
907	0.38
908	0.29
909	0.22
910	0.22
911	0.19
912	0.14

A0A178DM79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer