Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A178E5A2

Protein Details
Accession A0A178E5A2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
496-515QSGMRQKTGKAPPNKRRRIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
502-516KTGKAPPNKRRRIRG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MPSDAPAPVKLSLPLEFQQDIFKELREEDELVLLARGLGLLRIVTNLLHSYDCAGNNLILLVGADERENVWIGEALAEHAAVSNAPKCRGLSLVNTDLMSVGTREKMYAQGGIFSITSRILIVDFLSGLLNPETVTGIVVLHAEKVVATSLEAFILRIYRQRNKIGFLKAFSDTPEPFTTGFAPLTNMMKNLFLQKPALYPRFHVTVANSLEGRKKAEVIELEVPMTEAMQDIQNAVLACVEASISELKKANPGLEVEDWTVDSALHKNFDQIIRRQLDPVWHRTTFKTRQVVRDLSLLRTILHALLTYDAVNFNKYLDTVLAASQPPPGSTRQNQSPWLFLDAADTIFTTAKRRVYSAKMSNAELANSTNTTFESLQPVLEEFPKWAQLADILQEIEQDAYFNPTPQDTSNGSILIMCGDQGTCSQLREFLQTMYVKPEEGNEEDDEDNEPSARFMMRRKLRNYLHWKRDFTKVSAALFSENQKAIDNSNDRNVQSGMRQKTGKAPPNKRRRIRGGGSVAAGLSRTDSGAVRTAGDRDAHIASLMAELEPTDLEAAQKPGDVGFDPLDNMEGSYELFDMDSLIIVHPYSGDLDEHILDETKPRYVIMYEPDAAFIRRIEVYRSSHTDRTVKVFFMYYGGSVEEQRYLSAVRREKDAFTRLIKERANMALTLNTNANLAPEESFLRTINTRIAGGGRLASTAEPPRVVVDVREFRSSLPSLLHGRSIVIVPCMLTVGDYVLTPQICIERKSVRDLIASFTNGRLYNQTEAMMEHYKQPMLLIEFEQNKSFTLEPFADFSAGPSTTSGLAATPDLQSKLVMLTLAFPRLRIIWSSSPYQTAEIFSELKKQQDEPDPLKAVQLGLDPNQMGDEMRSFNQTSQDMLRALPGVTESVVTTLLLKVGSIEELANMEEKEICSIIGTDVGRRVHRFFNRSVYEEVQLPTFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.28
4 0.27
5 0.3
6 0.28
7 0.3
8 0.26
9 0.25
10 0.22
11 0.22
12 0.25
13 0.23
14 0.24
15 0.21
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.14
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.15
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.13
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.09
70 0.13
71 0.16
72 0.18
73 0.21
74 0.21
75 0.22
76 0.25
77 0.26
78 0.28
79 0.33
80 0.36
81 0.35
82 0.35
83 0.33
84 0.3
85 0.27
86 0.21
87 0.14
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.16
94 0.17
95 0.21
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.19
101 0.16
102 0.15
103 0.11
104 0.11
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.21
146 0.28
147 0.34
148 0.43
149 0.45
150 0.49
151 0.56
152 0.59
153 0.57
154 0.51
155 0.49
156 0.42
157 0.4
158 0.37
159 0.35
160 0.27
161 0.27
162 0.26
163 0.24
164 0.23
165 0.24
166 0.22
167 0.19
168 0.19
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.21
182 0.21
183 0.26
184 0.33
185 0.36
186 0.3
187 0.31
188 0.34
189 0.35
190 0.35
191 0.31
192 0.25
193 0.29
194 0.3
195 0.3
196 0.26
197 0.24
198 0.29
199 0.29
200 0.3
201 0.22
202 0.22
203 0.2
204 0.24
205 0.24
206 0.24
207 0.27
208 0.24
209 0.24
210 0.22
211 0.21
212 0.16
213 0.14
214 0.09
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.03
230 0.05
231 0.08
232 0.08
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.21
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.15
248 0.14
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.17
257 0.22
258 0.26
259 0.27
260 0.34
261 0.35
262 0.36
263 0.35
264 0.33
265 0.37
266 0.37
267 0.4
268 0.38
269 0.37
270 0.38
271 0.41
272 0.48
273 0.47
274 0.5
275 0.52
276 0.5
277 0.55
278 0.6
279 0.59
280 0.52
281 0.52
282 0.45
283 0.38
284 0.36
285 0.29
286 0.23
287 0.2
288 0.19
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.19
318 0.23
319 0.29
320 0.33
321 0.37
322 0.43
323 0.42
324 0.42
325 0.37
326 0.36
327 0.3
328 0.23
329 0.21
330 0.15
331 0.14
332 0.12
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.1
338 0.13
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.22
343 0.26
344 0.35
345 0.38
346 0.43
347 0.42
348 0.42
349 0.44
350 0.4
351 0.35
352 0.27
353 0.21
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.08
358 0.08
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.08
371 0.09
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.05
387 0.04
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.11
395 0.15
396 0.12
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.09
404 0.07
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.1
415 0.1
416 0.13
417 0.14
418 0.12
419 0.16
420 0.16
421 0.17
422 0.18
423 0.17
424 0.15
425 0.14
426 0.15
427 0.13
428 0.13
429 0.15
430 0.12
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.12
436 0.11
437 0.09
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.09
444 0.19
445 0.25
446 0.33
447 0.35
448 0.44
449 0.46
450 0.55
451 0.63
452 0.63
453 0.67
454 0.66
455 0.67
456 0.61
457 0.66
458 0.59
459 0.5
460 0.47
461 0.39
462 0.33
463 0.31
464 0.28
465 0.21
466 0.2
467 0.19
468 0.15
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.16
475 0.17
476 0.16
477 0.2
478 0.22
479 0.22
480 0.23
481 0.23
482 0.18
483 0.2
484 0.26
485 0.24
486 0.26
487 0.26
488 0.25
489 0.34
490 0.41
491 0.44
492 0.47
493 0.54
494 0.6
495 0.71
496 0.8
497 0.78
498 0.78
499 0.78
500 0.77
501 0.71
502 0.7
503 0.64
504 0.56
505 0.51
506 0.42
507 0.34
508 0.25
509 0.21
510 0.12
511 0.07
512 0.05
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.1
521 0.11
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.05
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.03
540 0.03
541 0.04
542 0.05
543 0.07
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.11
593 0.13
594 0.14
595 0.17
596 0.17
597 0.17
598 0.19
599 0.18
600 0.18
601 0.16
602 0.13
603 0.1
604 0.11
605 0.11
606 0.13
607 0.17
608 0.2
609 0.24
610 0.3
611 0.33
612 0.34
613 0.38
614 0.39
615 0.36
616 0.38
617 0.35
618 0.3
619 0.26
620 0.24
621 0.2
622 0.18
623 0.16
624 0.11
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.13
636 0.2
637 0.25
638 0.24
639 0.29
640 0.31
641 0.32
642 0.37
643 0.37
644 0.35
645 0.33
646 0.39
647 0.37
648 0.42
649 0.41
650 0.37
651 0.36
652 0.35
653 0.32
654 0.26
655 0.23
656 0.21
657 0.2
658 0.21
659 0.18
660 0.15
661 0.13
662 0.13
663 0.12
664 0.09
665 0.08
666 0.07
667 0.08
668 0.09
669 0.1
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.13
674 0.14
675 0.16
676 0.16
677 0.15
678 0.14
679 0.15
680 0.13
681 0.13
682 0.13
683 0.1
684 0.09
685 0.1
686 0.09
687 0.12
688 0.14
689 0.15
690 0.13
691 0.14
692 0.14
693 0.15
694 0.15
695 0.14
696 0.19
697 0.25
698 0.27
699 0.29
700 0.29
701 0.28
702 0.33
703 0.32
704 0.25
705 0.19
706 0.2
707 0.22
708 0.23
709 0.24
710 0.19
711 0.18
712 0.18
713 0.19
714 0.15
715 0.12
716 0.11
717 0.1
718 0.09
719 0.09
720 0.08
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.09
728 0.09
729 0.09
730 0.09
731 0.14
732 0.16
733 0.18
734 0.21
735 0.25
736 0.27
737 0.34
738 0.37
739 0.33
740 0.35
741 0.34
742 0.35
743 0.32
744 0.32
745 0.27
746 0.24
747 0.26
748 0.23
749 0.23
750 0.22
751 0.21
752 0.21
753 0.22
754 0.21
755 0.18
756 0.18
757 0.21
758 0.22
759 0.2
760 0.21
761 0.22
762 0.21
763 0.21
764 0.21
765 0.2
766 0.18
767 0.19
768 0.17
769 0.22
770 0.26
771 0.28
772 0.29
773 0.26
774 0.24
775 0.25
776 0.24
777 0.18
778 0.18
779 0.18
780 0.18
781 0.2
782 0.2
783 0.18
784 0.17
785 0.18
786 0.17
787 0.16
788 0.15
789 0.13
790 0.13
791 0.13
792 0.13
793 0.12
794 0.08
795 0.09
796 0.09
797 0.1
798 0.11
799 0.13
800 0.13
801 0.14
802 0.13
803 0.13
804 0.13
805 0.12
806 0.1
807 0.08
808 0.11
809 0.13
810 0.19
811 0.19
812 0.18
813 0.19
814 0.2
815 0.22
816 0.19
817 0.24
818 0.24
819 0.28
820 0.33
821 0.33
822 0.35
823 0.34
824 0.34
825 0.29
826 0.24
827 0.23
828 0.21
829 0.22
830 0.19
831 0.27
832 0.27
833 0.3
834 0.3
835 0.3
836 0.34
837 0.41
838 0.49
839 0.45
840 0.52
841 0.52
842 0.5
843 0.49
844 0.43
845 0.34
846 0.27
847 0.25
848 0.2
849 0.18
850 0.21
851 0.2
852 0.19
853 0.19
854 0.17
855 0.15
856 0.13
857 0.14
858 0.13
859 0.15
860 0.19
861 0.2
862 0.21
863 0.27
864 0.26
865 0.26
866 0.26
867 0.29
868 0.26
869 0.25
870 0.25
871 0.2
872 0.19
873 0.17
874 0.14
875 0.11
876 0.11
877 0.11
878 0.09
879 0.09
880 0.1
881 0.09
882 0.09
883 0.09
884 0.1
885 0.09
886 0.08
887 0.08
888 0.09
889 0.09
890 0.09
891 0.09
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.12
896 0.11
897 0.11
898 0.12
899 0.13
900 0.14
901 0.13
902 0.13
903 0.11
904 0.12
905 0.12
906 0.15
907 0.16
908 0.16
909 0.22
910 0.26
911 0.3
912 0.33
913 0.36
914 0.4
915 0.48
916 0.5
917 0.5
918 0.56
919 0.57
920 0.58
921 0.59
922 0.53
923 0.48
924 0.46
925 0.42