Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E5A2

Protein Details
Accession A0A178E5A2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
496-515QSGMRQKTGKAPPNKRRRIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
502-516KTGKAPPNKRRRIRG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MPSDAPAPVKLSLPLEFQQDIFKELREEDELVLLARGLGLLRIVTNLLHSYDCAGNNLILLVGADERENVWIGEALAEHAAVSNAPKCRGLSLVNTDLMSVGTREKMYAQGGIFSITSRILIVDFLSGLLNPETVTGIVVLHAEKVVATSLEAFILRIYRQRNKIGFLKAFSDTPEPFTTGFAPLTNMMKNLFLQKPALYPRFHVTVANSLEGRKKAEVIELEVPMTEAMQDIQNAVLACVEASISELKKANPGLEVEDWTVDSALHKNFDQIIRRQLDPVWHRTTFKTRQVVRDLSLLRTILHALLTYDAVNFNKYLDTVLAASQPPPGSTRQNQSPWLFLDAADTIFTTAKRRVYSAKMSNAELANSTNTTFESLQPVLEEFPKWAQLADILQEIEQDAYFNPTPQDTSNGSILIMCGDQGTCSQLREFLQTMYVKPEEGNEEDDEDNEPSARFMMRRKLRNYLHWKRDFTKVSAALFSENQKAIDNSNDRNVQSGMRQKTGKAPPNKRRRIRGGGSVAAGLSRTDSGAVRTAGDRDAHIASLMAELEPTDLEAAQKPGDVGFDPLDNMEGSYELFDMDSLIIVHPYSGDLDEHILDETKPRYVIMYEPDAAFIRRIEVYRSSHTDRTVKVFFMYYGGSVEEQRYLSAVRREKDAFTRLIKERANMALTLNTNANLAPEESFLRTINTRIAGGGRLASTAEPPRVVVDVREFRSSLPSLLHGRSIVIVPCMLTVGDYVLTPQICIERKSVRDLIASFTNGRLYNQTEAMMEHYKQPMLLIEFEQNKSFTLEPFADFSAGPSTTSGLAATPDLQSKLVMLTLAFPRLRIIWSSSPYQTAEIFSELKKQQDEPDPLKAVQLGLDPNQMGDEMRSFNQTSQDMLRALPGVTESVVTTLLLKVGSIEELANMEEKEICSIIGTDVGRRVHRFFNRSVYEEVQLPTFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.28
4 0.27
5 0.3
6 0.28
7 0.3
8 0.26
9 0.25
10 0.22
11 0.22
12 0.25
13 0.23
14 0.24
15 0.21
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.14
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.15
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.13
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.09
70 0.13
71 0.16
72 0.18
73 0.21
74 0.21
75 0.22
76 0.25
77 0.26
78 0.28
79 0.33
80 0.36
81 0.35
82 0.35
83 0.33
84 0.3
85 0.27
86 0.21
87 0.14
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.16
94 0.17
95 0.21
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.19
101 0.16
102 0.15
103 0.11
104 0.11
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.21
146 0.28
147 0.34
148 0.43
149 0.45
150 0.49
151 0.56
152 0.59
153 0.57
154 0.51
155 0.49
156 0.42
157 0.4
158 0.37
159 0.35
160 0.27
161 0.27
162 0.26
163 0.24
164 0.23
165 0.24
166 0.22
167 0.19
168 0.19
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.21
182 0.21
183 0.26
184 0.33
185 0.36
186 0.3
187 0.31
188 0.34
189 0.35
190 0.35
191 0.31
192 0.25
193 0.29
194 0.3
195 0.3
196 0.26
197 0.24
198 0.29
199 0.29
200 0.3
201 0.22
202 0.22
203 0.2
204 0.24
205 0.24
206 0.24
207 0.27
208 0.24
209 0.24
210 0.22
211 0.21
212 0.16
213 0.14
214 0.09
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.03
230 0.05
231 0.08
232 0.08
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.21
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.15
248 0.14
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.17
257 0.22
258 0.26
259 0.27
260 0.34
261 0.35
262 0.36
263 0.35
264 0.33
265 0.37
266 0.37
267 0.4
268 0.38
269 0.37
270 0.38
271 0.41
272 0.48
273 0.47
274 0.5
275 0.52
276 0.5
277 0.55
278 0.6
279 0.59
280 0.52
281 0.52
282 0.45
283 0.38
284 0.36
285 0.29
286 0.23
287 0.2
288 0.19
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.19
318 0.23
319 0.29
320 0.33
321 0.37
322 0.43
323 0.42
324 0.42
325 0.37
326 0.36
327 0.3
328 0.23
329 0.21
330 0.15
331 0.14
332 0.12
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.1
338 0.13
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.22
343 0.26
344 0.35
345 0.38
346 0.43
347 0.42
348 0.42
349 0.44
350 0.4
351 0.35
352 0.27
353 0.21
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.08
358 0.08
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.08
371 0.09
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.05
387 0.04
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.11
395 0.15
396 0.12
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.09
404 0.07
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.1
415 0.1
416 0.13
417 0.14
418 0.12
419 0.16
420 0.16
421 0.17
422 0.18
423 0.17
424 0.15
425 0.14
426 0.15
427 0.13
428 0.13
429 0.15
430 0.12
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.12
436 0.11
437 0.09
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.09
444 0.19
445 0.25
446 0.33
447 0.35
448 0.44
449 0.46
450 0.55
451 0.63
452 0.63
453 0.67
454 0.66
455 0.67
456 0.61
457 0.66
458 0.59
459 0.5
460 0.47
461 0.39
462 0.33
463 0.31
464 0.28
465 0.21
466 0.2
467 0.19
468 0.15
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.16
475 0.17
476 0.16
477 0.2
478 0.22
479 0.22
480 0.23
481 0.23
482 0.18
483 0.2
484 0.26
485 0.24
486 0.26
487 0.26
488 0.25
489 0.34
490 0.41
491 0.44
492 0.47
493 0.54
494 0.6
495 0.71
496 0.8
497 0.78
498 0.78
499 0.78
500 0.77
501 0.71
502 0.7
503 0.64
504 0.56
505 0.51
506 0.42
507 0.34
508 0.25
509 0.21
510 0.12
511 0.07
512 0.05
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.1
521 0.11
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.05
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.03
540 0.03
541 0.04
542 0.05
543 0.07
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.11
593 0.13
594 0.14
595 0.17
596 0.17
597 0.17
598 0.19
599 0.18
600 0.18
601 0.16
602 0.13
603 0.1
604 0.11
605 0.11
606 0.13
607 0.17
608 0.2
609 0.24
610 0.3
611 0.33
612 0.34
613 0.38
614 0.39
615 0.36
616 0.38
617 0.35
618 0.3
619 0.26
620 0.24
621 0.2
622 0.18
623 0.16
624 0.11
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.13
636 0.2
637 0.25
638 0.24
639 0.29
640 0.31
641 0.32
642 0.37
643 0.37
644 0.35
645 0.33
646 0.39
647 0.37
648 0.42
649 0.41
650 0.37
651 0.36
652 0.35
653 0.32
654 0.26
655 0.23
656 0.21
657 0.2
658 0.21
659 0.18
660 0.15
661 0.13
662 0.13
663 0.12
664 0.09
665 0.08
666 0.07
667 0.08
668 0.09
669 0.1
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.13
674 0.14
675 0.16
676 0.16
677 0.15
678 0.14
679 0.15
680 0.13
681 0.13
682 0.13
683 0.1
684 0.09
685 0.1
686 0.09
687 0.12
688 0.14
689 0.15
690 0.13
691 0.14
692 0.14
693 0.15
694 0.15
695 0.14
696 0.19
697 0.25
698 0.27
699 0.29
700 0.29
701 0.28
702 0.33
703 0.32
704 0.25
705 0.19
706 0.2
707 0.22
708 0.23
709 0.24
710 0.19
711 0.18
712 0.18
713 0.19
714 0.15
715 0.12
716 0.11
717 0.1
718 0.09
719 0.09
720 0.08
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.09
728 0.09
729 0.09
730 0.09
731 0.14
732 0.16
733 0.18
734 0.21
735 0.25
736 0.27
737 0.34
738 0.37
739 0.33
740 0.35
741 0.34
742 0.35
743 0.32
744 0.32
745 0.27
746 0.24
747 0.26
748 0.23
749 0.23
750 0.22
751 0.21
752 0.21
753 0.22
754 0.21
755 0.18
756 0.18
757 0.21
758 0.22
759 0.2
760 0.21
761 0.22
762 0.21
763 0.21
764 0.21
765 0.2
766 0.18
767 0.19
768 0.17
769 0.22
770 0.26
771 0.28
772 0.29
773 0.26
774 0.24
775 0.25
776 0.24
777 0.18
778 0.18
779 0.18
780 0.18
781 0.2
782 0.2
783 0.18
784 0.17
785 0.18
786 0.17
787 0.16
788 0.15
789 0.13
790 0.13
791 0.13
792 0.13
793 0.12
794 0.08
795 0.09
796 0.09
797 0.1
798 0.11
799 0.13
800 0.13
801 0.14
802 0.13
803 0.13
804 0.13
805 0.12
806 0.1
807 0.08
808 0.11
809 0.13
810 0.19
811 0.19
812 0.18
813 0.19
814 0.2
815 0.22
816 0.19
817 0.24
818 0.24
819 0.28
820 0.33
821 0.33
822 0.35
823 0.34
824 0.34
825 0.29
826 0.24
827 0.23
828 0.21
829 0.22
830 0.19
831 0.27
832 0.27
833 0.3
834 0.3
835 0.3
836 0.34
837 0.41
838 0.49
839 0.45
840 0.52
841 0.52
842 0.5
843 0.49
844 0.43
845 0.34
846 0.27
847 0.25
848 0.2
849 0.18
850 0.21
851 0.2
852 0.19
853 0.19
854 0.17
855 0.15
856 0.13
857 0.14
858 0.13
859 0.15
860 0.19
861 0.2
862 0.21
863 0.27
864 0.26
865 0.26
866 0.26
867 0.29
868 0.26
869 0.25
870 0.25
871 0.2
872 0.19
873 0.17
874 0.14
875 0.11
876 0.11
877 0.11
878 0.09
879 0.09
880 0.1
881 0.09
882 0.09
883 0.09
884 0.1
885 0.09
886 0.08
887 0.08
888 0.09
889 0.09
890 0.09
891 0.09
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.12
896 0.11
897 0.11
898 0.12
899 0.13
900 0.14
901 0.13
902 0.13
903 0.11
904 0.12
905 0.12
906 0.15
907 0.16
908 0.16
909 0.22
910 0.26
911 0.3
912 0.33
913 0.36
914 0.4
915 0.48
916 0.5
917 0.5
918 0.56
919 0.57
920 0.58
921 0.59
922 0.53
923 0.48
924 0.46
925 0.42