Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E1R7

Protein Details
Accession A0A178E1R7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-274EGRKLDEKEGKKDKKKGENQELQTSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-209QKKKGKK
258-265EGKKDKKK
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036788  T_IF-3_C_sf  
IPR001288  Translation_initiation_fac_3  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Amino Acid Sequences MPPKHLSSTSQALYRVFIAPNPRPTTSIPKFYVPALTTYNASSRSPGILPHTSIRTKAYTKDTRRHAISDMFTVDSAIKADRINVVDQHGVFHRDVSLNEAFDSMDRLTYHLQQLTPGTVDEYGRANPDDLPTCRIVSKIDLRAKHRRKLDIERQQAKGQGTGPAPKSIELNWAIAEGDLKHRLDKLKEFLKEGRKVEIMLGQKKKGKKATEEEANRVMEKVMDAVGECKGAGKVKETGTVGAVFTVVFEGRKLDEKEGKKDKKKGENQELQTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.22
4 0.22
5 0.27
6 0.31
7 0.4
8 0.44
9 0.43
10 0.42
11 0.46
12 0.54
13 0.52
14 0.54
15 0.48
16 0.47
17 0.46
18 0.45
19 0.47
20 0.38
21 0.35
22 0.29
23 0.28
24 0.25
25 0.25
26 0.27
27 0.23
28 0.23
29 0.21
30 0.18
31 0.2
32 0.19
33 0.2
34 0.23
35 0.23
36 0.26
37 0.28
38 0.33
39 0.32
40 0.33
41 0.34
42 0.33
43 0.31
44 0.34
45 0.4
46 0.44
47 0.5
48 0.57
49 0.61
50 0.64
51 0.64
52 0.61
53 0.55
54 0.51
55 0.45
56 0.4
57 0.34
58 0.28
59 0.24
60 0.22
61 0.19
62 0.13
63 0.12
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.16
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.16
84 0.16
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.12
89 0.11
90 0.13
91 0.08
92 0.09
93 0.08
94 0.1
95 0.12
96 0.14
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.13
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.11
116 0.14
117 0.13
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.14
125 0.19
126 0.24
127 0.27
128 0.31
129 0.37
130 0.47
131 0.53
132 0.56
133 0.55
134 0.53
135 0.55
136 0.61
137 0.65
138 0.65
139 0.69
140 0.68
141 0.67
142 0.62
143 0.6
144 0.51
145 0.42
146 0.33
147 0.28
148 0.23
149 0.25
150 0.24
151 0.23
152 0.23
153 0.22
154 0.22
155 0.17
156 0.21
157 0.17
158 0.16
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.08
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.16
170 0.19
171 0.22
172 0.26
173 0.3
174 0.34
175 0.35
176 0.39
177 0.43
178 0.49
179 0.52
180 0.49
181 0.46
182 0.4
183 0.38
184 0.36
185 0.35
186 0.33
187 0.35
188 0.38
189 0.38
190 0.43
191 0.46
192 0.53
193 0.54
194 0.52
195 0.52
196 0.55
197 0.59
198 0.64
199 0.66
200 0.64
201 0.62
202 0.58
203 0.5
204 0.43
205 0.34
206 0.24
207 0.19
208 0.14
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.13
219 0.14
220 0.16
221 0.2
222 0.22
223 0.28
224 0.28
225 0.27
226 0.25
227 0.26
228 0.22
229 0.17
230 0.16
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.18
240 0.21
241 0.27
242 0.35
243 0.4
244 0.51
245 0.6
246 0.69
247 0.71
248 0.77
249 0.8
250 0.82
251 0.87
252 0.88
253 0.88
254 0.87