Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DIU6

Protein Details
Accession A0A178DIU6    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-114LGNKVAQEEKKKTKPKKAPKADAGQASHydrophilic
405-427DVSGLVKTKKKPKAPAPAPTTADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-107KKKTKPKKAPK
413-419KKKPKAP
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 10, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MAEPTAKPLEPLDETEELPKTKEKLAELSQVASIHYSTKNFAAAAENYANAVEIQAELNGEMAPENAELLFYYGRALYKVAVAKSDVLGNKVAQEEKKKTKPKKAPKADAGQASSAAANGAKTEPKGESVESKPYFQLQGDENWTDLEDDEDEQDEEQEEEEDDFGNAYETFEMARVLYARQLETVAGPSGEGKGKGKAELSPQVRTIKERIADCHGFLVEISLENERFHDAISDARASLALQEELYPFEHENVTEAHYSLSLALEFASVSKVREDQTGQGTDAPETAATDDKDGVDWDLRKEAAKQTDLAIQSLEARLKKEETALSGDALTAEQKKEKRTIIEDKKGMLEDLRTRLADLQSDPTKQEFDSIDPSVFQGLLGGLLGADAATQKAKIAEATKSANDVSGLVKTKKKPKAPAPAPTTADSGSGKRKLEVDDGAANGKRAKTEEPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.34
4 0.29
5 0.29
6 0.31
7 0.28
8 0.3
9 0.34
10 0.32
11 0.36
12 0.4
13 0.47
14 0.44
15 0.43
16 0.4
17 0.36
18 0.34
19 0.27
20 0.22
21 0.17
22 0.19
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.2
27 0.19
28 0.19
29 0.21
30 0.19
31 0.23
32 0.22
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.13
38 0.12
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.09
65 0.14
66 0.19
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.2
71 0.2
72 0.25
73 0.21
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.22
81 0.29
82 0.36
83 0.44
84 0.54
85 0.61
86 0.68
87 0.75
88 0.82
89 0.85
90 0.88
91 0.89
92 0.89
93 0.88
94 0.88
95 0.84
96 0.79
97 0.7
98 0.6
99 0.49
100 0.4
101 0.31
102 0.22
103 0.16
104 0.09
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.12
112 0.14
113 0.16
114 0.16
115 0.21
116 0.22
117 0.32
118 0.31
119 0.32
120 0.3
121 0.3
122 0.3
123 0.24
124 0.25
125 0.16
126 0.2
127 0.22
128 0.22
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.16
133 0.14
134 0.11
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.18
187 0.25
188 0.27
189 0.26
190 0.28
191 0.31
192 0.31
193 0.31
194 0.29
195 0.25
196 0.26
197 0.25
198 0.24
199 0.27
200 0.27
201 0.25
202 0.24
203 0.2
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.09
260 0.1
261 0.12
262 0.14
263 0.15
264 0.2
265 0.21
266 0.2
267 0.21
268 0.21
269 0.18
270 0.17
271 0.14
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.17
290 0.21
291 0.23
292 0.23
293 0.23
294 0.22
295 0.27
296 0.27
297 0.25
298 0.19
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.18
303 0.14
304 0.14
305 0.16
306 0.17
307 0.18
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.22
312 0.21
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.15
317 0.13
318 0.13
319 0.1
320 0.11
321 0.15
322 0.18
323 0.22
324 0.28
325 0.31
326 0.34
327 0.39
328 0.49
329 0.54
330 0.6
331 0.59
332 0.56
333 0.55
334 0.51
335 0.44
336 0.34
337 0.29
338 0.25
339 0.26
340 0.28
341 0.25
342 0.25
343 0.28
344 0.28
345 0.26
346 0.22
347 0.26
348 0.27
349 0.29
350 0.29
351 0.27
352 0.28
353 0.24
354 0.27
355 0.21
356 0.2
357 0.24
358 0.24
359 0.23
360 0.22
361 0.23
362 0.19
363 0.17
364 0.14
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.12
383 0.15
384 0.17
385 0.21
386 0.26
387 0.26
388 0.28
389 0.27
390 0.25
391 0.22
392 0.2
393 0.17
394 0.18
395 0.23
396 0.25
397 0.32
398 0.38
399 0.48
400 0.56
401 0.63
402 0.67
403 0.71
404 0.78
405 0.8
406 0.83
407 0.81
408 0.8
409 0.76
410 0.68
411 0.62
412 0.51
413 0.45
414 0.37
415 0.34
416 0.34
417 0.36
418 0.35
419 0.34
420 0.37
421 0.37
422 0.4
423 0.39
424 0.36
425 0.34
426 0.35
427 0.38
428 0.36
429 0.34
430 0.32
431 0.3
432 0.27
433 0.26