Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EFB0

Protein Details
Accession A0A178EFB0    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MARKYRPKKEKKGSPEDEAFIBasic
306-327TAALKKQKPSGRAKKAKVEDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12YRPKKEKK
226-251KREAEKEAKEVASKPDSKPKAKSQKK
310-321KKQKPSGRAKKA
345-356PRKAKAKPKAKG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MARKYRPKKEKKGSPEDEAFINDVEDDVDAEDGPPTIDPYAVLELEKEASAEDVKKAYRKLALKHHPDKAAEEDKEAAHKSFQEVAFAYAVLSDERRRARYDRTGSTAETLEDDDEFDWLKFYRAQFEDIVNEDAINNIANEYKGSDEEREDIINAYDEGKGSLGYIYSQVMLSDILVDDDRFRKIIDEEIANGTVKSYQLYYLETDETRQNAKDAEQKRRDAFDKREAEKEAKEVASKPDSKPKAKSQKKSGGDMSDLAAMIQQRQKSRAGNFFDHLEAKYAPKSRGSKRATPMEEPPEEAFQATAALKKQKPSGRAKKAKVEDDDMDLDDEDIGDSEEEEEAPRKAKAKPKAKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.82
3 0.73
4 0.64
5 0.56
6 0.47
7 0.36
8 0.29
9 0.2
10 0.14
11 0.12
12 0.09
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.07
26 0.1
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.11
35 0.08
36 0.09
37 0.11
38 0.12
39 0.13
40 0.15
41 0.18
42 0.22
43 0.24
44 0.26
45 0.31
46 0.36
47 0.41
48 0.48
49 0.56
50 0.62
51 0.69
52 0.72
53 0.7
54 0.66
55 0.62
56 0.59
57 0.58
58 0.48
59 0.42
60 0.37
61 0.32
62 0.35
63 0.34
64 0.26
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.24
69 0.23
70 0.22
71 0.21
72 0.22
73 0.2
74 0.19
75 0.16
76 0.1
77 0.1
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.15
82 0.18
83 0.21
84 0.24
85 0.27
86 0.34
87 0.42
88 0.48
89 0.48
90 0.5
91 0.5
92 0.47
93 0.46
94 0.39
95 0.3
96 0.23
97 0.18
98 0.13
99 0.1
100 0.1
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.11
109 0.11
110 0.18
111 0.18
112 0.21
113 0.22
114 0.23
115 0.23
116 0.23
117 0.24
118 0.17
119 0.15
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.06
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.14
201 0.21
202 0.25
203 0.34
204 0.39
205 0.43
206 0.45
207 0.49
208 0.5
209 0.5
210 0.5
211 0.49
212 0.52
213 0.5
214 0.53
215 0.51
216 0.5
217 0.44
218 0.41
219 0.35
220 0.27
221 0.26
222 0.23
223 0.25
224 0.28
225 0.31
226 0.3
227 0.36
228 0.41
229 0.44
230 0.49
231 0.54
232 0.59
233 0.65
234 0.72
235 0.72
236 0.76
237 0.76
238 0.76
239 0.71
240 0.63
241 0.56
242 0.48
243 0.38
244 0.3
245 0.25
246 0.19
247 0.15
248 0.11
249 0.13
250 0.15
251 0.18
252 0.18
253 0.21
254 0.25
255 0.29
256 0.35
257 0.4
258 0.43
259 0.44
260 0.43
261 0.43
262 0.42
263 0.38
264 0.33
265 0.28
266 0.22
267 0.2
268 0.24
269 0.26
270 0.25
271 0.31
272 0.38
273 0.42
274 0.52
275 0.56
276 0.59
277 0.62
278 0.71
279 0.68
280 0.65
281 0.66
282 0.63
283 0.58
284 0.53
285 0.48
286 0.4
287 0.35
288 0.31
289 0.23
290 0.15
291 0.16
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.23
296 0.25
297 0.29
298 0.37
299 0.4
300 0.49
301 0.57
302 0.64
303 0.67
304 0.76
305 0.79
306 0.81
307 0.84
308 0.83
309 0.78
310 0.73
311 0.64
312 0.59
313 0.55
314 0.45
315 0.39
316 0.3
317 0.25
318 0.18
319 0.16
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.09
329 0.11
330 0.12
331 0.14
332 0.17
333 0.2
334 0.26
335 0.35
336 0.43