Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DZH8

Protein Details
Accession A0A178DZH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-354KIAKAQKKGGKRGGRGQGQGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-350PKTEEAEKPKTEEAEKPKTEEAEKPKTEEAEKIAKAQKKGGKRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAGRSPGSSKGLYGPSSIDPAMRSRLTRELDERDAFIAKEAEKASKGLPYRRLPPWANDSFSEALNFPDVADRHMRQMDEADKMLPLIREARKERKTLQQISNAKISIKDIKSRCRPAPSANEARDMQPKEAQSAQSAPGPVPKMTIDAIKSRYESALRVSETRDVEPNPKGVREAREHGDQRGRGDIGGSRHSDDATQAQPKAYPAFWSRWQICSDITHLIGYIDGHDGMKFALRVEKLEPKTYGGDVYHDLGLCKKHFTAGPTCPFGWEECPFRHWAIEQVEEAWVDPNWLASVRRMDREKPKTEEAEKPKTEEAEKPKTEEAEKPKTEEAEKIAKAQKKGGKRGGRGQGQGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.29
4 0.28
5 0.23
6 0.2
7 0.22
8 0.27
9 0.26
10 0.26
11 0.26
12 0.34
13 0.36
14 0.4
15 0.43
16 0.44
17 0.48
18 0.49
19 0.46
20 0.4
21 0.38
22 0.32
23 0.28
24 0.24
25 0.18
26 0.21
27 0.21
28 0.22
29 0.21
30 0.23
31 0.22
32 0.24
33 0.29
34 0.31
35 0.39
36 0.42
37 0.48
38 0.52
39 0.59
40 0.56
41 0.57
42 0.59
43 0.55
44 0.53
45 0.46
46 0.46
47 0.39
48 0.36
49 0.32
50 0.23
51 0.18
52 0.17
53 0.16
54 0.11
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.21
59 0.21
60 0.25
61 0.27
62 0.27
63 0.23
64 0.28
65 0.28
66 0.26
67 0.26
68 0.21
69 0.18
70 0.19
71 0.2
72 0.15
73 0.13
74 0.17
75 0.2
76 0.27
77 0.33
78 0.43
79 0.46
80 0.51
81 0.54
82 0.57
83 0.63
84 0.64
85 0.64
86 0.64
87 0.65
88 0.64
89 0.65
90 0.55
91 0.46
92 0.37
93 0.34
94 0.32
95 0.29
96 0.33
97 0.33
98 0.41
99 0.5
100 0.56
101 0.58
102 0.56
103 0.57
104 0.55
105 0.61
106 0.6
107 0.6
108 0.54
109 0.55
110 0.49
111 0.48
112 0.49
113 0.41
114 0.35
115 0.3
116 0.28
117 0.26
118 0.28
119 0.26
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.18
124 0.18
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.14
135 0.16
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.19
140 0.2
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.18
148 0.22
149 0.22
150 0.23
151 0.22
152 0.19
153 0.22
154 0.22
155 0.25
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.21
160 0.23
161 0.24
162 0.26
163 0.25
164 0.32
165 0.33
166 0.34
167 0.37
168 0.34
169 0.31
170 0.29
171 0.26
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.15
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.18
195 0.22
196 0.29
197 0.29
198 0.31
199 0.32
200 0.29
201 0.28
202 0.25
203 0.23
204 0.18
205 0.17
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.11
222 0.11
223 0.13
224 0.16
225 0.25
226 0.26
227 0.3
228 0.3
229 0.28
230 0.3
231 0.29
232 0.28
233 0.19
234 0.19
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.18
242 0.16
243 0.17
244 0.15
245 0.16
246 0.18
247 0.22
248 0.27
249 0.32
250 0.37
251 0.39
252 0.39
253 0.37
254 0.36
255 0.33
256 0.3
257 0.26
258 0.25
259 0.23
260 0.25
261 0.27
262 0.27
263 0.27
264 0.23
265 0.26
266 0.26
267 0.27
268 0.25
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.21
273 0.16
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.22
283 0.24
284 0.31
285 0.35
286 0.42
287 0.51
288 0.6
289 0.64
290 0.61
291 0.65
292 0.66
293 0.67
294 0.7
295 0.68
296 0.69
297 0.64
298 0.61
299 0.58
300 0.54
301 0.51
302 0.49
303 0.49
304 0.49
305 0.49
306 0.49
307 0.49
308 0.49
309 0.49
310 0.49
311 0.49
312 0.49
313 0.49
314 0.49
315 0.49
316 0.49
317 0.48
318 0.44
319 0.41
320 0.4
321 0.4
322 0.43
323 0.47
324 0.49
325 0.49
326 0.54
327 0.55
328 0.55
329 0.64
330 0.67
331 0.69
332 0.7
333 0.78
334 0.8
335 0.8