FuNGI

A0A178EL29

Protein Details

Accession

A0A178EL29

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
171-198	AANGDKTPPIEKKRKRRRWEEVAEPTEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
179-188	PIEKKRKRRR

Subcellular Location(s)

plas 14, nucl 5.5, cyto_nucl 5, cyto 3.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MAGPRAGKKSQANGAANANTSTKQSLTEASDKELYSDNAHDKFSGYNSSIAVHAHDDDDTEDAQLNGRSLVGQYTASADMLNEYAHGDTAEADILDSREKQAQIASRETDYQRRRFDRALSPDGLSYKDTMKEREYEREEARVNRLIEDQERSGGNAVLDHQPTLKDGAPAANGDKTPPIEKKRKRRRWEEVAEPTEATEDKPPVVEEPDSAPKRSRWDTKTVATASAFGPGPAPNGTHAPTFAFGTDVSKRNAPMSDEQLDALLPGEDKGYRILKPPPGYEPAIRPVGMPALPTGYQGFLIPEVDNSLAAMGRQLPTEIPGVGDLQFFKNEDMKYFGKLVDGADESEMHVEELKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKTALRQITDNARQFGAGALFNQILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDLDHQDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCKSKKSWHARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLKGLVECIGDNLNDEQTKVRMVTALALAALAEAAAPYGIESFDEILNPLWTGARRQRGKALASFLKAVGYVIPLMDEEYSNYYTSQIMEIVIREFESPDEEMKKVVLKVVSQCSGTAGVTKVYLKDEVLPNFFKHFWVRRMALDKRNYRQVVDTTVDLAQKAGVSEIVGRIVGNMKDENEAYRKMTIETVDKIISTLGAHDVDQRLEEQLIDGILVAFQDQTIEDPIVIDGFATVVNALGERTKPYLPQIVATVLTRLNNKSATVRQQAADLISRITFVMQKCEEDPQLIKLAQALYEYLGEEYPEVLGSILGALRAIVTVVGLSAMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGADHVSPREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGYIAKAIGPQDVLATLLGNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFMFEYIGEMAKDYVYAIVPLLEDALIDRDQVHRQTAAAVVKHVALGCVGLDCEDAMIHLLNLLWPNLFETSPHVIDRVIEAIEGIRNAVGTPLVMNYLWAGLFHPARKVRQPYWRIYNDTYVQHADSMVPTYPSFDDPAIRRHELDILI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.52
3	0.48
4	0.42
5	0.37
6	0.28
7	0.27
8	0.26
9	0.19
10	0.19
11	0.19
12	0.22
13	0.26
14	0.33
15	0.32
16	0.35
17	0.39
18	0.36
19	0.37
20	0.36
21	0.31
22	0.27
23	0.31
24	0.33
25	0.31
26	0.32
27	0.31
28	0.28
29	0.28
30	0.27
31	0.28
32	0.23
33	0.22
34	0.22
35	0.23
36	0.23
37	0.21
38	0.2
39	0.16
40	0.15
41	0.14
42	0.14
43	0.13
44	0.13
45	0.15
46	0.13
47	0.12
48	0.11
49	0.1
50	0.13
51	0.13
52	0.13
53	0.11
54	0.11
55	0.1
56	0.1
57	0.12
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.13
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.07
75	0.07
76	0.08
77	0.09
78	0.07
79	0.07
80	0.08
81	0.09
82	0.12
83	0.12
84	0.13
85	0.18
86	0.18
87	0.19
88	0.23
89	0.29
90	0.31
91	0.36
92	0.36
93	0.33
94	0.4
95	0.42
96	0.47
97	0.49
98	0.53
99	0.57
100	0.59
101	0.62
102	0.6
103	0.64
104	0.64
105	0.65
106	0.63
107	0.56
108	0.52
109	0.5
110	0.47
111	0.41
112	0.32
113	0.25
114	0.22
115	0.25
116	0.26
117	0.27
118	0.29
119	0.34
120	0.37
121	0.45
122	0.47
123	0.48
124	0.48
125	0.51
126	0.52
127	0.5
128	0.51
129	0.48
130	0.44
131	0.39
132	0.39
133	0.36
134	0.35
135	0.36
136	0.31
137	0.28
138	0.27
139	0.26
140	0.25
141	0.22
142	0.19
143	0.15
144	0.16
145	0.18
146	0.19
147	0.18
148	0.18
149	0.17
150	0.18
151	0.2
152	0.19
153	0.15
154	0.15
155	0.18
156	0.18
157	0.19
158	0.21
159	0.21
160	0.19
161	0.19
162	0.21
163	0.21
164	0.25
165	0.31
166	0.38
167	0.45
168	0.55
169	0.65
170	0.73
171	0.82
172	0.86
173	0.89
174	0.91
175	0.91
176	0.91
177	0.9
178	0.89
179	0.82
180	0.74
181	0.63
182	0.53
183	0.44
184	0.35
185	0.25
186	0.19
187	0.17
188	0.15
189	0.15
190	0.16
191	0.16
192	0.19
193	0.18
194	0.15
195	0.19
196	0.29
197	0.3
198	0.32
199	0.33
200	0.33
201	0.4
202	0.45
203	0.49
204	0.44
205	0.5
206	0.55
207	0.56
208	0.61
209	0.55
210	0.51
211	0.42
212	0.39
213	0.31
214	0.29
215	0.24
216	0.16
217	0.16
218	0.13
219	0.14
220	0.13
221	0.14
222	0.11
223	0.14
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.15
228	0.15
229	0.15
230	0.13
231	0.12
232	0.1
233	0.14
234	0.19
235	0.21
236	0.22
237	0.23
238	0.24
239	0.25
240	0.27
241	0.27
242	0.26
243	0.29
244	0.3
245	0.28
246	0.28
247	0.25
248	0.23
249	0.19
250	0.15
251	0.09
252	0.06
253	0.05
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.11
258	0.14
259	0.14
260	0.18
261	0.24
262	0.3
263	0.34
264	0.36
265	0.37
266	0.39
267	0.41
268	0.4
269	0.38
270	0.37
271	0.35
272	0.33
273	0.28
274	0.24
275	0.24
276	0.21
277	0.17
278	0.13
279	0.13
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.12
316	0.13
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.21
321	0.2
322	0.22
323	0.23
324	0.21
325	0.17
326	0.18
327	0.17
328	0.15
329	0.14
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.07
337	0.08
338	0.07
339	0.11
340	0.15
341	0.16
342	0.18
343	0.19
344	0.2
345	0.22
346	0.27
347	0.28
348	0.34
349	0.42
350	0.46
351	0.51
352	0.52
353	0.5
354	0.52
355	0.52
356	0.49
357	0.47
358	0.43
359	0.44
360	0.47
361	0.46
362	0.44
363	0.49
364	0.51
365	0.46
366	0.44
367	0.42
368	0.46
369	0.53
370	0.52
371	0.43
372	0.34
373	0.32
374	0.3
375	0.27
376	0.2
377	0.12
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.1
392	0.11
393	0.12
394	0.12
395	0.12
396	0.15
397	0.16
398	0.16
399	0.14
400	0.14
401	0.14
402	0.18
403	0.2
404	0.18
405	0.19
406	0.19
407	0.19
408	0.19
409	0.18
410	0.14
411	0.14
412	0.15
413	0.14
414	0.16
415	0.18
416	0.17
417	0.17
418	0.19
419	0.19
420	0.17
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.14
425	0.14
426	0.12
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.06
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.1
442	0.1
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.15
447	0.15
448	0.14
449	0.12
450	0.1
451	0.07
452	0.07
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.04
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.1
466	0.15
467	0.15
468	0.15
469	0.19
470	0.2
471	0.22
472	0.24
473	0.2
474	0.16
475	0.16
476	0.16
477	0.14
478	0.13
479	0.11
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.08
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.04
489	0.04
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.04
497	0.06
498	0.07
499	0.12
500	0.16
501	0.21
502	0.23
503	0.3
504	0.4
505	0.48
506	0.56
507	0.6
508	0.63
509	0.64
510	0.69
511	0.66
512	0.62
513	0.55
514	0.49
515	0.46
516	0.39
517	0.35
518	0.27
519	0.24
520	0.18
521	0.16
522	0.13
523	0.08
524	0.06
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.04
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.09
549	0.08
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.08
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.02
562	0.02
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.02
567	0.02
568	0.02
569	0.02
570	0.02
571	0.03
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.09
583	0.14
584	0.22
585	0.24
586	0.25
587	0.31
588	0.34
589	0.36
590	0.35
591	0.36
592	0.31
593	0.3
594	0.29
595	0.24
596	0.2
597	0.18
598	0.15
599	0.09
600	0.06
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.07
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.1
616	0.09
617	0.07
618	0.06
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.07
628	0.07
629	0.09
630	0.11
631	0.11
632	0.11
633	0.11
634	0.13
635	0.11
636	0.13
637	0.12
638	0.11
639	0.16
640	0.19
641	0.21
642	0.19
643	0.19
644	0.17
645	0.17
646	0.16
647	0.13
648	0.09
649	0.08
650	0.09
651	0.09
652	0.09
653	0.1
654	0.1
655	0.09
656	0.12
657	0.16
658	0.18
659	0.21
660	0.21
661	0.21
662	0.23
663	0.23
664	0.2
665	0.22
666	0.24
667	0.24
668	0.28
669	0.29
670	0.31
671	0.38
672	0.43
673	0.45
674	0.49
675	0.53
676	0.51
677	0.58
678	0.55
679	0.49
680	0.46
681	0.4
682	0.35
683	0.3
684	0.26
685	0.19
686	0.2
687	0.2
688	0.16
689	0.14
690	0.1
691	0.08
692	0.08
693	0.06
694	0.04
695	0.04
696	0.05
697	0.06
698	0.06
699	0.05
700	0.05
701	0.06
702	0.08
703	0.08
704	0.09
705	0.1
706	0.1
707	0.12
708	0.12
709	0.14
710	0.14
711	0.15
712	0.15
713	0.16
714	0.16
715	0.15
716	0.16
717	0.16
718	0.17
719	0.17
720	0.18
721	0.17
722	0.16
723	0.15
724	0.14
725	0.12
726	0.09
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.1
732	0.11
733	0.11
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.1
738	0.09
739	0.07
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.05
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.04
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.06
759	0.06
760	0.05
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.04
770	0.05
771	0.06
772	0.07
773	0.1
774	0.11
775	0.12
776	0.15
777	0.21
778	0.2
779	0.21
780	0.2
781	0.19
782	0.2
783	0.19
784	0.18
785	0.13
786	0.15
787	0.16
788	0.16
789	0.17
790	0.16
791	0.17
792	0.2
793	0.24
794	0.29
795	0.32
796	0.33
797	0.31
798	0.31
799	0.31
800	0.28
801	0.26
802	0.19
803	0.15
804	0.12
805	0.12
806	0.11
807	0.11
808	0.13
809	0.11
810	0.17
811	0.17
812	0.19
813	0.19
814	0.23
815	0.23
816	0.22
817	0.23
818	0.18
819	0.22
820	0.2
821	0.19
822	0.17
823	0.17
824	0.15
825	0.14
826	0.12
827	0.09
828	0.09
829	0.1
830	0.08
831	0.08
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.06
836	0.05
837	0.05
838	0.04
839	0.04
840	0.04
841	0.04
842	0.04
843	0.04
844	0.04
845	0.03
846	0.03
847	0.04
848	0.04
849	0.03
850	0.03
851	0.03
852	0.03
853	0.03
854	0.03
855	0.04
856	0.06
857	0.07
858	0.08
859	0.08
860	0.09
861	0.11
862	0.13
863	0.13
864	0.13
865	0.18
866	0.2
867	0.22
868	0.24
869	0.26
870	0.31
871	0.37
872	0.45
873	0.45
874	0.5
875	0.53
876	0.58
877	0.61
878	0.63
879	0.61
880	0.6
881	0.57
882	0.52
883	0.5
884	0.41
885	0.35
886	0.27
887	0.23
888	0.14
889	0.11
890	0.08
891	0.07
892	0.07
893	0.06
894	0.09
895	0.11
896	0.12
897	0.13
898	0.15
899	0.16
900	0.18
901	0.19
902	0.24
903	0.22
904	0.23
905	0.27
906	0.26
907	0.26
908	0.24
909	0.23
910	0.21
911	0.21
912	0.21
913	0.17
914	0.18
915	0.22
916	0.21
917	0.24
918	0.21
919	0.27
920	0.33
921	0.43
922	0.49
923	0.5
924	0.59
925	0.65
926	0.71
927	0.67
928	0.59
929	0.51
930	0.41
931	0.38
932	0.29
933	0.21
934	0.13
935	0.14
936	0.14
937	0.13
938	0.13
939	0.11
940	0.11
941	0.1
942	0.09
943	0.07
944	0.07
945	0.07
946	0.08
947	0.09
948	0.09
949	0.09
950	0.11
951	0.13
952	0.14
953	0.21
954	0.24
955	0.3
956	0.34
957	0.37
958	0.37
959	0.35
960	0.34
961	0.28
962	0.25
963	0.19
964	0.15
965	0.11
966	0.09
967	0.08
968	0.07
969	0.06
970	0.04
971	0.04
972	0.04
973	0.05
974	0.05
975	0.06
976	0.09
977	0.1
978	0.1
979	0.11
980	0.16
981	0.16
982	0.18
983	0.18
984	0.17
985	0.18
986	0.18
987	0.19
988	0.2
989	0.23
990	0.25
991	0.26
992	0.24
993	0.27
994	0.26
995	0.26
996	0.2
997	0.16
998	0.14
999	0.14
1000	0.15
1001	0.11
1002	0.11
1003	0.1
1004	0.11
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.12
1008	0.11
1009	0.11
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.07
1016	0.07
1017	0.07
1018	0.07
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.06
1023	0.06
1024	0.06
1025	0.09
1026	0.08
1027	0.09
1028	0.1
1029	0.13
1030	0.17
1031	0.2
1032	0.22
1033	0.19
1034	0.19
1035	0.21
1036	0.26
1037	0.28
1038	0.24
1039	0.23
1040	0.22
1041	0.22
1042	0.23
1043	0.21
1044	0.16
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.06
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.06
1056	0.06
1057	0.06
1058	0.06
1059	0.06
1060	0.06
1061	0.08
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.09
1065	0.09
1066	0.11
1067	0.13
1068	0.12
1069	0.11
1070	0.16
1071	0.21
1072	0.23
1073	0.24
1074	0.22
1075	0.21
1076	0.22
1077	0.23
1078	0.2
1079	0.14
1080	0.11
1081	0.11
1082	0.12
1083	0.13
1084	0.13
1085	0.11
1086	0.09
1087	0.09
1088	0.09
1089	0.09
1090	0.08
1091	0.06
1092	0.07
1093	0.07
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.1
1099	0.09
1100	0.09
1101	0.09
1102	0.13
1103	0.17
1104	0.19
1105	0.26
1106	0.31
1107	0.36
1108	0.45
1109	0.52
1110	0.55
1111	0.62
1112	0.67
1113	0.69
1114	0.74
1115	0.76
1116	0.74
1117	0.7
1118	0.7
1119	0.66
1120	0.61
1121	0.56
1122	0.49
1123	0.43
1124	0.36
1125	0.32
1126	0.25
1127	0.21
1128	0.21
1129	0.18
1130	0.17
1131	0.16
1132	0.18
1133	0.19
1134	0.2
1135	0.21
1136	0.19
1137	0.24
1138	0.25
1139	0.33
1140	0.37
1141	0.38
1142	0.37
1143	0.37

A0A178EL29

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer