FuNGI

A0A178DL20

Protein Details

Accession

A0A178DL20

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-158	LNGTQDSSKKKRKRGDKEEIEETY	Hydrophilic
431-462	LPRLLRVTRCKAEKKNKDKPRGPPPSKAPKAN	Hydrophilic
514-540	LKFKGSGGKKKGPNGRKARSASWKKTG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
143-151	KKKRKRGDK
441-464	KAEKKNKDKPRGPPPSKAPKANGK
506-543	SEKQGKSGLKFKGSGGKKKGPNGRKARSASWKKTGGKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MAKSKESRPAKTASLPKAGQPSIKVDKKAFDPTLASLFAASSGPVQAPPKSRYQERIVRKPVEDPEDEVSEDEEEEESGQDDASQGASSDVSSESSEAEDEDMEEDTEDDDASDSSAPPEKNADAVLARIREAALNGTQDSSKKKRKRGDKEEIEETYMRKLAREEEKEEEQRQKKRKTAAQEDKSDSSSETSEEETEEFTVPQHESLTNTNDKDASELEKAARTVFLSNVSSDCINTKSAEKALKKHLESFIPDLADNKPAHKIESLRFRSTAFATALPKRAAFAKKEIMDSTTKSTNAYAVYTTKIAAREAVKRLNGSILLNRHLHVDSVAHPMKVEHRRCVFVGNLPFVDDESQTPNEDGTEKKKKTPADVEEGLWIQFGKVGKVESVRVVRDAKTRVGKGFAYVQFVDENGVEAALQLNEKKFPPMLPRLLRVTRCKAEKKNKDKPRGPPPSKAPKANGKTGYAPKLTEEQKSMQGRARSMLGKVAKAQTKESFTFEGHRASEKQGKSGLKFKGSGGKKKGPNGRKARSASWKKTGGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.56
3	0.56
4	0.6
5	0.56
6	0.51
7	0.44
8	0.46
9	0.47
10	0.53
11	0.53
12	0.47
13	0.5
14	0.51
15	0.58
16	0.51
17	0.44
18	0.4
19	0.39
20	0.4
21	0.36
22	0.3
23	0.21
24	0.19
25	0.17
26	0.14
27	0.11
28	0.08
29	0.08
30	0.09
31	0.12
32	0.15
33	0.19
34	0.25
35	0.28
36	0.36
37	0.42
38	0.46
39	0.5
40	0.56
41	0.61
42	0.65
43	0.72
44	0.73
45	0.72
46	0.68
47	0.69
48	0.67
49	0.64
50	0.56
51	0.49
52	0.44
53	0.4
54	0.39
55	0.32
56	0.26
57	0.2
58	0.18
59	0.15
60	0.11
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.08
65	0.07
66	0.07
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.07
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.08
85	0.08
86	0.07
87	0.07
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.08
103	0.14
104	0.14
105	0.14
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.17
110	0.17
111	0.12
112	0.15
113	0.18
114	0.15
115	0.15
116	0.15
117	0.15
118	0.13
119	0.13
120	0.14
121	0.12
122	0.13
123	0.13
124	0.13
125	0.14
126	0.16
127	0.23
128	0.29
129	0.38
130	0.44
131	0.52
132	0.6
133	0.69
134	0.78
135	0.82
136	0.84
137	0.85
138	0.84
139	0.83
140	0.76
141	0.69
142	0.59
143	0.49
144	0.41
145	0.33
146	0.26
147	0.19
148	0.18
149	0.22
150	0.29
151	0.33
152	0.35
153	0.37
154	0.45
155	0.49
156	0.52
157	0.55
158	0.53
159	0.57
160	0.62
161	0.64
162	0.63
163	0.66
164	0.67
165	0.67
166	0.71
167	0.73
168	0.72
169	0.72
170	0.72
171	0.66
172	0.62
173	0.52
174	0.41
175	0.32
176	0.24
177	0.17
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.09
187	0.08
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.13
195	0.17
196	0.2
197	0.2
198	0.2
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.17
203	0.15
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.14
210	0.13
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.11
220	0.1
221	0.11
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.11
226	0.11
227	0.15
228	0.22
229	0.23
230	0.26
231	0.34
232	0.4
233	0.39
234	0.42
235	0.42
236	0.37
237	0.38
238	0.36
239	0.29
240	0.23
241	0.22
242	0.19
243	0.17
244	0.2
245	0.17
246	0.15
247	0.17
248	0.17
249	0.18
250	0.19
251	0.21
252	0.2
253	0.31
254	0.35
255	0.32
256	0.33
257	0.32
258	0.32
259	0.3
260	0.28
261	0.19
262	0.17
263	0.18
264	0.2
265	0.23
266	0.22
267	0.21
268	0.18
269	0.22
270	0.23
271	0.21
272	0.23
273	0.26
274	0.27
275	0.29
276	0.29
277	0.26
278	0.24
279	0.24
280	0.24
281	0.2
282	0.18
283	0.17
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.11
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.13
297	0.14
298	0.19
299	0.22
300	0.26
301	0.25
302	0.25
303	0.25
304	0.24
305	0.22
306	0.18
307	0.18
308	0.17
309	0.19
310	0.19
311	0.19
312	0.2
313	0.19
314	0.18
315	0.14
316	0.13
317	0.11
318	0.19
319	0.2
320	0.17
321	0.17
322	0.18
323	0.26
324	0.33
325	0.34
326	0.33
327	0.35
328	0.37
329	0.38
330	0.4
331	0.33
332	0.3
333	0.31
334	0.27
335	0.24
336	0.22
337	0.22
338	0.2
339	0.2
340	0.14
341	0.11
342	0.12
343	0.13
344	0.13
345	0.13
346	0.13
347	0.12
348	0.13
349	0.14
350	0.19
351	0.28
352	0.29
353	0.34
354	0.39
355	0.4
356	0.46
357	0.53
358	0.49
359	0.47
360	0.48
361	0.44
362	0.42
363	0.41
364	0.34
365	0.25
366	0.19
367	0.11
368	0.11
369	0.1
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.11
374	0.13
375	0.14
376	0.17
377	0.2
378	0.2
379	0.23
380	0.24
381	0.25
382	0.3
383	0.32
384	0.33
385	0.36
386	0.38
387	0.36
388	0.38
389	0.35
390	0.32
391	0.37
392	0.32
393	0.3
394	0.28
395	0.27
396	0.24
397	0.24
398	0.22
399	0.14
400	0.13
401	0.08
402	0.08
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.09
410	0.12
411	0.13
412	0.15
413	0.15
414	0.18
415	0.25
416	0.31
417	0.39
418	0.41
419	0.45
420	0.5
421	0.56
422	0.59
423	0.59
424	0.6
425	0.58
426	0.62
427	0.66
428	0.69
429	0.73
430	0.78
431	0.81
432	0.84
433	0.87
434	0.89
435	0.88
436	0.88
437	0.88
438	0.88
439	0.83
440	0.82
441	0.82
442	0.82
443	0.82
444	0.78
445	0.74
446	0.73
447	0.73
448	0.73
449	0.67
450	0.6
451	0.6
452	0.61
453	0.61
454	0.53
455	0.48
456	0.41
457	0.45
458	0.44
459	0.4
460	0.37
461	0.33
462	0.4
463	0.44
464	0.45
465	0.43
466	0.44
467	0.42
468	0.4
469	0.42
470	0.35
471	0.32
472	0.36
473	0.33
474	0.31
475	0.35
476	0.4
477	0.4
478	0.4
479	0.44
480	0.43
481	0.46
482	0.46
483	0.45
484	0.4
485	0.37
486	0.4
487	0.38
488	0.37
489	0.32
490	0.35
491	0.33
492	0.36
493	0.43
494	0.39
495	0.41
496	0.42
497	0.46
498	0.46
499	0.52
500	0.52
501	0.49
502	0.49
503	0.48
504	0.51
505	0.53
506	0.58
507	0.59
508	0.62
509	0.63
510	0.7
511	0.78
512	0.77
513	0.8
514	0.81
515	0.8
516	0.81
517	0.8
518	0.8
519	0.81
520	0.82
521	0.81
522	0.79
523	0.8

A0A178DL20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer