FuNGI

A0A178EHW6

Protein Details

Accession

A0A178EHW6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
306-325	YEDYNKDRKRARQCFQKAFE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12, nucl 11, cyto 11, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039226 Ski3/TTC37 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0055087 C:Ski complex GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF13432 TPR_16 PF13181 TPR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR PS50293 TPR_REGION

Amino Acid Sequences

MASHGDNSAHDLIDLDISTLRQFIELFPNDGLSKVITGYLASGISKYPLIAEGQTKDAPDLSEGGVALTQDVPVSQEDCLVLMTEGISEAEKSPLAHCLLADYYLSLEEYESAVESTRKGLKYSAAESKKTDLSFQRTRDALSSTLATALVYYQTPRNHPEAKTIFQSILKRKPQFTSALIGIGLVLEEEEEYEQAFQFLEQALKQDPSNGRIGAESAWCQALTGDYQAGLERLEKYLDYPQLDASKQRGRELRAQTLYRIGVCMWELDTSKAARRGRNGAYAKLLAAIKANPNYAPAYTLLGIFYEDYNKDRKRARQCFQKAFELSPSEIVAAERLARLFADQGEWDIVEVVSQRVVDSGKARQIAGSKKKGVSWPFSALGVVQMNKLDYQKSIISFLSALRISPDDYYSYVGLGESYHNSGRYNSASRAFNYAENPQDGVAMKKTEDESWFTKYMLANVNRELSEFNKALEGYEEVLSIRPKEFGVSIALLQTLVEKSWRCIETGFYGEAVDSSVRALEVALTITEYKPDAFNLWKAVGDACSVFTWVQGKLEAFPAEQLAQILSSKSELGSDFDSLKDLDGIGQDAVDSLSKNGNPSLESILNTAILAHKRAISSCKHDTHAQAVAWYNLGWTEYRAHVCLEQEGDQKSKLTTFLRASMKCFKRAIEFEAGNSEFWNALGVITTTLSPKVAQHALVRSLHLNERSVHTWTNLGALYLLQNDFELAHMAFSRAQSQDPDYSLAWVGEGIIALVTGETNEALSHFTHAFELSESSLLLPKRQYAVSAFDFLHSSPSSSSDITNLIQPLFALQQLKLQAPYDIPHNHLAALFLERVGNHDAAVTALQAVTASVEEEYENSESLLSLARVAQAKTDLARNLLATHANEAAVEEAETAIDLLSELDSNAKQSVMSTEQLTAVKLSARLTAGLAHYFNGAFDAAIPYFRTALEATDSNPDIICLLAEVLWAKGGENEREVARNQLFTAIEKHEGHVGLLTLIGAMTVLDDDAETMDAIKDDLDRLRTRKSLTDIQLARVEKVVEAISIAQGGEAQDLDEARRSVMLAPWKHTGWSELADATHGEGSVFASTLAKETAMRNAPPNGGLDALGLAGAMGSTGVVGDAQRGIVLAPWRLKGWKALRTCVGGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.11
3	0.1
4	0.11
5	0.11
6	0.11
7	0.11
8	0.1
9	0.1
10	0.12
11	0.2
12	0.22
13	0.25
14	0.24
15	0.27
16	0.26
17	0.26
18	0.25
19	0.16
20	0.14
21	0.11
22	0.12
23	0.09
24	0.09
25	0.1
26	0.1
27	0.1
28	0.1
29	0.1
30	0.1
31	0.12
32	0.12
33	0.11
34	0.1
35	0.11
36	0.12
37	0.15
38	0.19
39	0.2
40	0.25
41	0.26
42	0.26
43	0.25
44	0.25
45	0.23
46	0.19
47	0.18
48	0.14
49	0.15
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.1
56	0.09
57	0.07
58	0.07
59	0.08
60	0.09
61	0.1
62	0.09
63	0.1
64	0.1
65	0.11
66	0.11
67	0.1
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.06
72	0.07
73	0.07
74	0.07
75	0.07
76	0.08
77	0.1
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.16
82	0.18
83	0.17
84	0.16
85	0.18
86	0.18
87	0.18
88	0.17
89	0.12
90	0.11
91	0.11
92	0.12
93	0.09
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.09
101	0.1
102	0.1
103	0.14
104	0.21
105	0.21
106	0.22
107	0.24
108	0.28
109	0.33
110	0.38
111	0.44
112	0.43
113	0.45
114	0.47
115	0.5
116	0.49
117	0.44
118	0.44
119	0.4
120	0.43
121	0.48
122	0.49
123	0.51
124	0.47
125	0.48
126	0.44
127	0.4
128	0.33
129	0.27
130	0.25
131	0.19
132	0.19
133	0.17
134	0.14
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.08
139	0.1
140	0.14
141	0.18
142	0.22
143	0.26
144	0.32
145	0.37
146	0.37
147	0.46
148	0.46
149	0.47
150	0.48
151	0.46
152	0.42
153	0.4
154	0.48
155	0.46
156	0.5
157	0.55
158	0.56
159	0.57
160	0.58
161	0.58
162	0.55
163	0.49
164	0.45
165	0.37
166	0.33
167	0.29
168	0.26
169	0.21
170	0.15
171	0.12
172	0.06
173	0.04
174	0.03
175	0.03
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.11
190	0.14
191	0.15
192	0.15
193	0.21
194	0.23
195	0.24
196	0.28
197	0.26
198	0.24
199	0.23
200	0.24
201	0.19
202	0.18
203	0.16
204	0.14
205	0.14
206	0.13
207	0.13
208	0.12
209	0.11
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.09
220	0.1
221	0.11
222	0.11
223	0.12
224	0.19
225	0.23
226	0.22
227	0.22
228	0.24
229	0.27
230	0.28
231	0.29
232	0.29
233	0.31
234	0.31
235	0.36
236	0.38
237	0.38
238	0.47
239	0.51
240	0.54
241	0.55
242	0.55
243	0.5
244	0.5
245	0.47
246	0.38
247	0.32
248	0.22
249	0.17
250	0.15
251	0.15
252	0.1
253	0.11
254	0.12
255	0.12
256	0.15
257	0.15
258	0.19
259	0.25
260	0.29
261	0.3
262	0.34
263	0.4
264	0.41
265	0.5
266	0.48
267	0.44
268	0.44
269	0.41
270	0.37
271	0.33
272	0.3
273	0.2
274	0.19
275	0.18
276	0.19
277	0.2
278	0.21
279	0.17
280	0.19
281	0.2
282	0.18
283	0.17
284	0.13
285	0.14
286	0.13
287	0.13
288	0.11
289	0.1
290	0.11
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.12
296	0.2
297	0.21
298	0.26
299	0.31
300	0.4
301	0.48
302	0.57
303	0.64
304	0.67
305	0.76
306	0.8
307	0.79
308	0.79
309	0.7
310	0.62
311	0.57
312	0.49
313	0.4
314	0.32
315	0.27
316	0.19
317	0.17
318	0.15
319	0.11
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.07
337	0.06
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.1
347	0.14
348	0.17
349	0.19
350	0.19
351	0.19
352	0.24
353	0.32
354	0.39
355	0.42
356	0.43
357	0.43
358	0.46
359	0.5
360	0.49
361	0.45
362	0.41
363	0.38
364	0.35
365	0.33
366	0.3
367	0.24
368	0.23
369	0.19
370	0.15
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.12
375	0.13
376	0.11
377	0.09
378	0.12
379	0.14
380	0.14
381	0.16
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.14
386	0.15
387	0.13
388	0.12
389	0.11
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.13
394	0.1
395	0.11
396	0.13
397	0.11
398	0.11
399	0.1
400	0.09
401	0.08
402	0.07
403	0.08
404	0.07
405	0.09
406	0.1
407	0.11
408	0.12
409	0.12
410	0.14
411	0.16
412	0.19
413	0.19
414	0.23
415	0.25
416	0.25
417	0.29
418	0.27
419	0.26
420	0.25
421	0.26
422	0.23
423	0.22
424	0.21
425	0.17
426	0.17
427	0.15
428	0.15
429	0.13
430	0.11
431	0.11
432	0.12
433	0.13
434	0.14
435	0.15
436	0.18
437	0.18
438	0.22
439	0.23
440	0.21
441	0.23
442	0.21
443	0.23
444	0.26
445	0.27
446	0.24
447	0.24
448	0.27
449	0.24
450	0.24
451	0.21
452	0.15
453	0.18
454	0.16
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.09
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.08
474	0.1
475	0.1
476	0.1
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.06
483	0.05
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.14
488	0.15
489	0.14
490	0.15
491	0.16
492	0.17
493	0.19
494	0.18
495	0.12
496	0.12
497	0.11
498	0.11
499	0.1
500	0.07
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.03
508	0.03
509	0.04
510	0.03
511	0.04
512	0.05
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.08
520	0.08
521	0.1
522	0.11
523	0.11
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.1
528	0.09
529	0.08
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.08
547	0.08
548	0.07
549	0.05
550	0.05
551	0.06
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.07
560	0.08
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.1
565	0.09
566	0.08
567	0.07
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.06
572	0.05
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.06
581	0.07
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.09
586	0.1
587	0.13
588	0.12
589	0.12
590	0.13
591	0.12
592	0.12
593	0.11
594	0.1
595	0.09
596	0.08
597	0.09
598	0.09
599	0.1
600	0.1
601	0.11
602	0.15
603	0.15
604	0.21
605	0.26
606	0.28
607	0.29
608	0.32
609	0.32
610	0.32
611	0.33
612	0.26
613	0.22
614	0.2
615	0.18
616	0.15
617	0.14
618	0.1
619	0.07
620	0.07
621	0.05
622	0.06
623	0.07
624	0.09
625	0.1
626	0.11
627	0.11
628	0.12
629	0.12
630	0.13
631	0.13
632	0.14
633	0.16
634	0.17
635	0.18
636	0.17
637	0.17
638	0.16
639	0.15
640	0.15
641	0.13
642	0.16
643	0.17
644	0.24
645	0.3
646	0.3
647	0.34
648	0.41
649	0.42
650	0.42
651	0.41
652	0.35
653	0.34
654	0.35
655	0.35
656	0.32
657	0.3
658	0.26
659	0.3
660	0.3
661	0.24
662	0.22
663	0.18
664	0.11
665	0.11
666	0.11
667	0.05
668	0.04
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.1
680	0.11
681	0.12
682	0.15
683	0.17
684	0.21
685	0.21
686	0.22
687	0.19
688	0.2
689	0.21
690	0.2
691	0.19
692	0.17
693	0.2
694	0.21
695	0.22
696	0.2
697	0.18
698	0.17
699	0.15
700	0.17
701	0.13
702	0.11
703	0.09
704	0.08
705	0.08
706	0.09
707	0.08
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.07
714	0.05
715	0.06
716	0.06
717	0.07
718	0.08
719	0.09
720	0.12
721	0.11
722	0.12
723	0.13
724	0.16
725	0.17
726	0.17
727	0.19
728	0.16
729	0.16
730	0.16
731	0.15
732	0.12
733	0.09
734	0.08
735	0.05
736	0.05
737	0.04
738	0.03
739	0.03
740	0.03
741	0.03
742	0.02
743	0.02
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.03
748	0.04
749	0.05
750	0.05
751	0.08
752	0.08
753	0.08
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.08
760	0.08
761	0.07
762	0.07
763	0.11
764	0.11
765	0.12
766	0.12
767	0.13
768	0.16
769	0.16
770	0.17
771	0.15
772	0.21
773	0.21
774	0.23
775	0.22
776	0.2
777	0.2
778	0.19
779	0.21
780	0.15
781	0.14
782	0.11
783	0.14
784	0.15
785	0.15
786	0.15
787	0.13
788	0.15
789	0.14
790	0.16
791	0.15
792	0.12
793	0.12
794	0.11
795	0.11
796	0.1
797	0.11
798	0.1
799	0.09
800	0.13
801	0.15
802	0.16
803	0.16
804	0.16
805	0.15
806	0.15
807	0.15
808	0.18
809	0.18
810	0.2
811	0.22
812	0.22
813	0.21
814	0.2
815	0.2
816	0.15
817	0.15
818	0.12
819	0.1
820	0.1
821	0.09
822	0.12
823	0.14
824	0.13
825	0.11
826	0.11
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.08
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.04
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.04
839	0.04
840	0.04
841	0.05
842	0.05
843	0.08
844	0.08
845	0.08
846	0.08
847	0.08
848	0.07
849	0.08
850	0.09
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.1
855	0.12
856	0.12
857	0.13
858	0.13
859	0.15
860	0.15
861	0.19
862	0.17
863	0.17
864	0.18
865	0.17
866	0.16
867	0.16
868	0.18
869	0.14
870	0.15
871	0.15
872	0.13
873	0.13
874	0.12
875	0.11
876	0.09
877	0.08
878	0.06
879	0.05
880	0.05
881	0.05
882	0.05
883	0.04
884	0.03
885	0.03
886	0.03
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.06
891	0.07
892	0.08
893	0.09
894	0.09
895	0.08
896	0.09
897	0.13
898	0.14
899	0.15
900	0.15
901	0.16
902	0.19
903	0.19
904	0.19
905	0.16
906	0.13
907	0.13
908	0.14
909	0.14
910	0.13
911	0.13
912	0.14
913	0.14
914	0.16
915	0.16
916	0.17
917	0.16
918	0.14
919	0.14
920	0.14
921	0.13
922	0.11
923	0.09
924	0.07
925	0.07
926	0.1
927	0.09
928	0.1
929	0.11
930	0.11
931	0.11
932	0.11
933	0.13
934	0.1
935	0.11
936	0.14
937	0.14
938	0.14
939	0.19
940	0.2
941	0.19
942	0.18
943	0.17
944	0.13
945	0.13
946	0.11
947	0.05
948	0.05
949	0.05
950	0.06
951	0.06
952	0.06
953	0.07
954	0.07
955	0.07
956	0.11
957	0.15
958	0.16
959	0.17
960	0.19
961	0.19
962	0.22
963	0.23
964	0.26
965	0.24
966	0.23
967	0.22
968	0.24
969	0.24
970	0.23
971	0.27
972	0.23
973	0.27
974	0.27
975	0.27
976	0.27
977	0.26
978	0.25
979	0.21
980	0.18
981	0.12
982	0.12
983	0.1
984	0.06
985	0.06
986	0.05
987	0.04
988	0.03
989	0.03
990	0.03
991	0.03
992	0.03
993	0.03
994	0.04
995	0.04
996	0.05
997	0.05
998	0.05
999	0.06
1000	0.06
1001	0.06
1002	0.07
1003	0.07
1004	0.09
1005	0.12
1006	0.17
1007	0.22
1008	0.26
1009	0.32
1010	0.35
1011	0.38
1012	0.42
1013	0.46
1014	0.49
1015	0.49
1016	0.56
1017	0.52
1018	0.52
1019	0.56
1020	0.51
1021	0.45
1022	0.38
1023	0.33
1024	0.23
1025	0.23
1026	0.19
1027	0.12
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.07
1034	0.08
1035	0.08
1036	0.08
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.08
1040	0.08
1041	0.1
1042	0.13
1043	0.13
1044	0.12
1045	0.13
1046	0.13
1047	0.14
1048	0.18
1049	0.26
1050	0.26
1051	0.3
1052	0.34
1053	0.34
1054	0.35
1055	0.34
1056	0.32
1057	0.26
1058	0.25
1059	0.23
1060	0.2
1061	0.19
1062	0.19
1063	0.19
1064	0.18
1065	0.15
1066	0.12
1067	0.1
1068	0.09
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.13
1080	0.21
1081	0.25
1082	0.27
1083	0.3
1084	0.34
1085	0.35
1086	0.34
1087	0.35
1088	0.28
1089	0.23
1090	0.21
1091	0.17
1092	0.13
1093	0.11
1094	0.09
1095	0.07
1096	0.05
1097	0.04
1098	0.03
1099	0.03
1100	0.02
1101	0.02
1102	0.02
1103	0.02
1104	0.03
1105	0.03
1106	0.04
1107	0.05
1108	0.06
1109	0.06
1110	0.07
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.1
1114	0.14
1115	0.18
1116	0.21
1117	0.23
1118	0.26
1119	0.28
1120	0.3
1121	0.36
1122	0.4
1123	0.43
1124	0.45
1125	0.5
1126	0.53

A0A178EHW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer