Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E500

Protein Details
Accession A0A178E500    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-49LSSPPATPVPRNPRKRKAIKAEETPEATHydrophilic
53-75KAVATPRSTKRAKRNSVKEEDADHydrophilic
95-118DDTPGTKKTKKGKKSAVVKKEEQEBasic
466-494DSPVKKPSGSKGKPKATKRKAKEVEEYESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-41RNPRKRKAIK
101-110KKTKKGKKSA
457-487RSGGRKGEVDSPVKKPSGSKGKPKATKRKAK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MARATRSSAVKAQPVNKEPTQLSSPPATPVPRNPRKRKAIKAEETPEATSLPKAVATPRSTKRAKRNSVKEEDADELPHNLGTTSDLPGKAEIGDDTPGTKKTKKGKKSAVVKKEEQENDLKPLVPKAQATTETSLQKKGNAKSGNYGLTPGQSPYPNWPHPMPEECQEVVRLLSKVHGKIEAPKTIPQPSLEVSGCGEVPSVLDALIRTRLSAATSNTNSSRAFAGLVSKFGTLKTGVGKGSVDWNKVRQADVKEIFEAIKSGGLADVKSKDIKKILQMVWEENQERRKALLSSSEEAPGSVNEAAEEKYAEVEKAEQDVVSLDHLHLLSSDDAFNALTKYPGIGPKTASCVLLFCLQRPSFAVDTHVFRLCKWLGWVPPPGDPAGLAPGAKGPFSGPTRNSTYAHCDVRIPDDLKYPLHYLFVKHGKVCPRCRAITGENSEGWEKGCAIDHLVKRSGGRKGEVDSPVKKPSGSKGKPKATKRKAKEVEEYESDAVSSGVSDAGSSELSDLVSDAEVETSEDNDSDFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.61
3 0.56
4 0.57
5 0.51
6 0.51
7 0.49
8 0.42
9 0.4
10 0.38
11 0.37
12 0.34
13 0.38
14 0.36
15 0.35
16 0.43
17 0.5
18 0.56
19 0.65
20 0.72
21 0.78
22 0.84
23 0.9
24 0.9
25 0.9
26 0.91
27 0.89
28 0.9
29 0.85
30 0.81
31 0.75
32 0.66
33 0.55
34 0.45
35 0.37
36 0.27
37 0.22
38 0.15
39 0.12
40 0.12
41 0.16
42 0.22
43 0.26
44 0.34
45 0.4
46 0.48
47 0.54
48 0.62
49 0.68
50 0.71
51 0.78
52 0.79
53 0.84
54 0.85
55 0.87
56 0.84
57 0.76
58 0.69
59 0.62
60 0.53
61 0.45
62 0.36
63 0.28
64 0.23
65 0.2
66 0.16
67 0.12
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.14
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.19
77 0.16
78 0.15
79 0.12
80 0.1
81 0.11
82 0.1
83 0.12
84 0.14
85 0.17
86 0.21
87 0.23
88 0.29
89 0.38
90 0.48
91 0.55
92 0.63
93 0.7
94 0.75
95 0.83
96 0.87
97 0.86
98 0.84
99 0.81
100 0.76
101 0.75
102 0.68
103 0.6
104 0.56
105 0.48
106 0.46
107 0.42
108 0.37
109 0.29
110 0.3
111 0.3
112 0.26
113 0.24
114 0.22
115 0.25
116 0.26
117 0.29
118 0.3
119 0.32
120 0.35
121 0.36
122 0.38
123 0.34
124 0.37
125 0.4
126 0.39
127 0.43
128 0.41
129 0.41
130 0.42
131 0.46
132 0.43
133 0.36
134 0.35
135 0.27
136 0.24
137 0.23
138 0.18
139 0.17
140 0.15
141 0.16
142 0.22
143 0.3
144 0.3
145 0.33
146 0.33
147 0.33
148 0.36
149 0.39
150 0.33
151 0.29
152 0.32
153 0.28
154 0.28
155 0.25
156 0.22
157 0.19
158 0.19
159 0.15
160 0.11
161 0.15
162 0.18
163 0.19
164 0.2
165 0.21
166 0.19
167 0.27
168 0.32
169 0.34
170 0.32
171 0.35
172 0.37
173 0.38
174 0.39
175 0.31
176 0.28
177 0.24
178 0.27
179 0.22
180 0.2
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.12
185 0.11
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.14
201 0.15
202 0.18
203 0.19
204 0.22
205 0.22
206 0.24
207 0.23
208 0.21
209 0.19
210 0.13
211 0.12
212 0.09
213 0.14
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.19
230 0.2
231 0.21
232 0.19
233 0.22
234 0.25
235 0.26
236 0.27
237 0.23
238 0.23
239 0.29
240 0.31
241 0.3
242 0.25
243 0.25
244 0.24
245 0.19
246 0.17
247 0.09
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.19
263 0.26
264 0.26
265 0.28
266 0.29
267 0.3
268 0.29
269 0.32
270 0.3
271 0.25
272 0.28
273 0.24
274 0.23
275 0.21
276 0.21
277 0.17
278 0.17
279 0.22
280 0.22
281 0.24
282 0.24
283 0.25
284 0.23
285 0.22
286 0.22
287 0.14
288 0.12
289 0.09
290 0.08
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.09
330 0.13
331 0.15
332 0.15
333 0.17
334 0.19
335 0.24
336 0.25
337 0.23
338 0.18
339 0.17
340 0.17
341 0.22
342 0.2
343 0.16
344 0.23
345 0.23
346 0.23
347 0.24
348 0.27
349 0.22
350 0.22
351 0.25
352 0.2
353 0.23
354 0.26
355 0.29
356 0.24
357 0.23
358 0.29
359 0.25
360 0.23
361 0.23
362 0.24
363 0.23
364 0.27
365 0.33
366 0.29
367 0.31
368 0.31
369 0.29
370 0.24
371 0.2
372 0.17
373 0.14
374 0.13
375 0.1
376 0.09
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.09
382 0.15
383 0.19
384 0.24
385 0.22
386 0.27
387 0.34
388 0.37
389 0.38
390 0.35
391 0.39
392 0.4
393 0.41
394 0.37
395 0.33
396 0.3
397 0.34
398 0.38
399 0.31
400 0.26
401 0.29
402 0.31
403 0.3
404 0.32
405 0.3
406 0.23
407 0.26
408 0.25
409 0.21
410 0.27
411 0.34
412 0.34
413 0.34
414 0.38
415 0.44
416 0.52
417 0.57
418 0.58
419 0.57
420 0.56
421 0.56
422 0.58
423 0.54
424 0.55
425 0.54
426 0.49
427 0.43
428 0.43
429 0.41
430 0.35
431 0.3
432 0.22
433 0.16
434 0.13
435 0.14
436 0.12
437 0.15
438 0.23
439 0.26
440 0.3
441 0.32
442 0.33
443 0.34
444 0.39
445 0.42
446 0.38
447 0.38
448 0.36
449 0.37
450 0.43
451 0.47
452 0.48
453 0.46
454 0.47
455 0.49
456 0.47
457 0.44
458 0.39
459 0.42
460 0.47
461 0.5
462 0.55
463 0.6
464 0.7
465 0.78
466 0.86
467 0.87
468 0.87
469 0.9
470 0.87
471 0.88
472 0.87
473 0.86
474 0.85
475 0.81
476 0.77
477 0.71
478 0.69
479 0.58
480 0.49
481 0.41
482 0.31
483 0.24
484 0.16
485 0.11
486 0.06
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09