FuNGI

A0A178E6B5

Protein Details

Accession

A0A178E6B5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
448-473	FLEGHHTQGKRRVRKGRQQTGLEQLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
351-357	GRKKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRRFIDKKSAVNFRLVHRAQNDPRIHDEDAPQMVFAETSAPNMREEDQPAGSSRASQYSAATGRSKIRSRRDLEGEFASKVRTNEGEAANYGIFYDDTEYDYMQHMRDLGSGGGEAYFVEAPGEKKKNKQKVDLADALRNTSLDDRQSDAGLSINSNVSSVSDFFGEDLAPSEFVRKTTYQDQQNIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVDDEDDIFNQLAEDGYEIDQREWDYTSYDNDDRDAMARFLDEEDDPGWETDDTIKASSPKQKTKPASSEKDHSDPASLPAPNEAPTPTDADDLAYLEEFRKFKNDVKASGKAPKPAAPSDMQSSIMTGASALTAGGRKKKRKGAMTSTSGYSMSSSALHRTEGLTLLDQRFDKIEEEYADDGFDFPDDASMASGMSKMSGLSKMSAVSGMSAWSSNSEAPQLRGDFDSIMDDFLEGHHTQGKRRVRKGRQQTGLEQLDEVRMGLGPARVSAGTSARAAGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.6
3	0.62
4	0.53
5	0.52
6	0.45
7	0.54
8	0.52
9	0.58
10	0.59
11	0.52
12	0.58
13	0.56
14	0.55
15	0.49
16	0.46
17	0.43
18	0.43
19	0.38
20	0.31
21	0.27
22	0.24
23	0.2
24	0.17
25	0.14
26	0.1
27	0.14
28	0.18
29	0.18
30	0.19
31	0.21
32	0.24
33	0.24
34	0.27
35	0.27
36	0.25
37	0.26
38	0.27
39	0.28
40	0.26
41	0.24
42	0.23
43	0.23
44	0.23
45	0.22
46	0.21
47	0.24
48	0.27
49	0.28
50	0.28
51	0.27
52	0.32
53	0.39
54	0.46
55	0.47
56	0.55
57	0.6
58	0.63
59	0.68
60	0.7
61	0.65
62	0.62
63	0.61
64	0.54
65	0.46
66	0.42
67	0.35
68	0.3
69	0.28
70	0.26
71	0.2
72	0.21
73	0.25
74	0.27
75	0.26
76	0.23
77	0.26
78	0.22
79	0.21
80	0.18
81	0.12
82	0.1
83	0.08
84	0.1
85	0.08
86	0.1
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.14
91	0.15
92	0.13
93	0.13
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.13
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.08
102	0.08
103	0.07
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.05
108	0.06
109	0.07
110	0.09
111	0.17
112	0.24
113	0.25
114	0.34
115	0.44
116	0.53
117	0.58
118	0.65
119	0.65
120	0.67
121	0.73
122	0.73
123	0.66
124	0.61
125	0.56
126	0.48
127	0.4
128	0.31
129	0.24
130	0.19
131	0.17
132	0.15
133	0.15
134	0.16
135	0.17
136	0.17
137	0.16
138	0.14
139	0.14
140	0.12
141	0.11
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.08
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.08
155	0.07
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.14
165	0.14
166	0.18
167	0.24
168	0.32
169	0.35
170	0.41
171	0.44
172	0.44
173	0.48
174	0.44
175	0.37
176	0.31
177	0.24
178	0.19
179	0.16
180	0.12
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.06
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.13
190	0.13
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.12
195	0.11
196	0.11
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.05
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.1
229	0.13
230	0.14
231	0.13
232	0.13
233	0.13
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.07
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.06
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.09
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.14
259	0.21
260	0.26
261	0.33
262	0.38
263	0.46
264	0.51
265	0.57
266	0.64
267	0.65
268	0.66
269	0.62
270	0.63
271	0.59
272	0.57
273	0.5
274	0.41
275	0.34
276	0.27
277	0.25
278	0.23
279	0.19
280	0.15
281	0.16
282	0.16
283	0.15
284	0.15
285	0.13
286	0.1
287	0.11
288	0.13
289	0.12
290	0.12
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.1
295	0.09
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.14
303	0.16
304	0.21
305	0.31
306	0.34
307	0.37
308	0.43
309	0.48
310	0.47
311	0.54
312	0.51
313	0.46
314	0.44
315	0.41
316	0.39
317	0.36
318	0.36
319	0.29
320	0.29
321	0.28
322	0.28
323	0.25
324	0.21
325	0.2
326	0.17
327	0.15
328	0.12
329	0.08
330	0.07
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.07
336	0.09
337	0.18
338	0.26
339	0.33
340	0.41
341	0.49
342	0.57
343	0.63
344	0.7
345	0.72
346	0.73
347	0.72
348	0.68
349	0.61
350	0.54
351	0.45
352	0.36
353	0.27
354	0.18
355	0.12
356	0.11
357	0.11
358	0.13
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.14
363	0.15
364	0.15
365	0.15
366	0.14
367	0.18
368	0.18
369	0.21
370	0.2
371	0.2
372	0.19
373	0.19
374	0.18
375	0.15
376	0.18
377	0.15
378	0.19
379	0.2
380	0.19
381	0.17
382	0.16
383	0.15
384	0.11
385	0.1
386	0.06
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.08
401	0.1
402	0.11
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.14
408	0.12
409	0.11
410	0.1
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.09
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.16
420	0.17
421	0.19
422	0.25
423	0.24
424	0.24
425	0.25
426	0.25
427	0.2
428	0.19
429	0.2
430	0.15
431	0.14
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.1
436	0.14
437	0.1
438	0.12
439	0.17
440	0.18
441	0.23
442	0.32
443	0.42
444	0.47
445	0.57
446	0.66
447	0.71
448	0.8
449	0.87
450	0.89
451	0.89
452	0.86
453	0.82
454	0.81
455	0.75
456	0.65
457	0.55
458	0.45
459	0.37
460	0.31
461	0.25
462	0.15
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.13
467	0.11
468	0.11
469	0.14
470	0.13
471	0.14
472	0.16
473	0.17
474	0.17
475	0.17
476	0.19

A0A178E6B5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer