Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DTG3

Protein Details
Accession A0A178DTG3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-94APEPSTKKRKLQDPQPEIKAHydrophilic
354-373AADRRAKKLNVNKPGKKENSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 9.333, nucl 4.5, mito 2.5, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF08512  Rtt106  
Amino Acid Sequences MAFTAMNNRPASQAAPAVPIHTAAPVAHAPEIDVAFAGNQELRKRVHAAIDKNPTHNTLFRDISAYILSQGSQPAPEPSTKKRKLQDPQPEIKAETNGAPTTSGSLFSTAARAWRSYPAVSFSIPQRKKFTLELLDKKDGGIRAIGASGNIEFAIAWKDVDQVFCLPIPEKAKKQHNFIIIPVHGDGVNPVPDALKASQPEPIVWTFEEATGKNIKEGEDPGPGQMAEGIHHCLIQAGTGKEVVFPTADEFASATPESHRKGEKAYHVKAHRGSKDGYLFFTSVGILYGFKKPLAFFDFAAVTSVSYTSILRNTFNLVITTPTGDVEFSMLDQADYAGINDYVQAHGLQDASLAADRRAKKLNVNKPGKKENSTGATADADVEEESELQKAERELQNQEDEDSEEDEDFDPGSDGESEGEGFDSDDDDDEGGEGYEEGDTTRVHDDDDDEDEADEMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.24
4 0.24
5 0.22
6 0.22
7 0.19
8 0.15
9 0.14
10 0.1
11 0.13
12 0.13
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.13
20 0.12
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.09
26 0.12
27 0.14
28 0.19
29 0.21
30 0.24
31 0.28
32 0.3
33 0.36
34 0.41
35 0.45
36 0.5
37 0.59
38 0.59
39 0.59
40 0.58
41 0.52
42 0.48
43 0.45
44 0.4
45 0.37
46 0.35
47 0.32
48 0.33
49 0.3
50 0.28
51 0.25
52 0.21
53 0.16
54 0.14
55 0.14
56 0.11
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.14
62 0.16
63 0.21
64 0.25
65 0.32
66 0.43
67 0.48
68 0.55
69 0.59
70 0.67
71 0.72
72 0.77
73 0.79
74 0.78
75 0.8
76 0.78
77 0.73
78 0.66
79 0.59
80 0.5
81 0.4
82 0.33
83 0.28
84 0.23
85 0.2
86 0.18
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.11
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.2
102 0.22
103 0.21
104 0.22
105 0.23
106 0.23
107 0.23
108 0.24
109 0.26
110 0.34
111 0.37
112 0.4
113 0.42
114 0.42
115 0.45
116 0.45
117 0.45
118 0.43
119 0.49
120 0.53
121 0.55
122 0.56
123 0.52
124 0.5
125 0.46
126 0.37
127 0.29
128 0.2
129 0.14
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.13
155 0.18
156 0.21
157 0.26
158 0.33
159 0.42
160 0.46
161 0.51
162 0.53
163 0.54
164 0.51
165 0.48
166 0.47
167 0.37
168 0.34
169 0.28
170 0.23
171 0.16
172 0.15
173 0.14
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.11
194 0.12
195 0.14
196 0.11
197 0.13
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.14
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.12
244 0.14
245 0.17
246 0.18
247 0.17
248 0.2
249 0.25
250 0.32
251 0.38
252 0.39
253 0.44
254 0.45
255 0.5
256 0.53
257 0.55
258 0.48
259 0.43
260 0.41
261 0.38
262 0.41
263 0.37
264 0.32
265 0.27
266 0.24
267 0.21
268 0.2
269 0.15
270 0.09
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.15
281 0.19
282 0.19
283 0.16
284 0.18
285 0.18
286 0.18
287 0.19
288 0.15
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.16
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.14
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.16
343 0.18
344 0.21
345 0.28
346 0.28
347 0.35
348 0.44
349 0.53
350 0.57
351 0.67
352 0.7
353 0.72
354 0.8
355 0.78
356 0.73
357 0.66
358 0.63
359 0.58
360 0.53
361 0.46
362 0.38
363 0.33
364 0.28
365 0.25
366 0.17
367 0.13
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.09
377 0.1
378 0.17
379 0.21
380 0.24
381 0.28
382 0.32
383 0.38
384 0.36
385 0.36
386 0.3
387 0.27
388 0.25
389 0.23
390 0.19
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.12
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.09
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.17
433 0.18
434 0.23
435 0.22
436 0.19
437 0.19
438 0.19