Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E7M5

Protein Details
Accession A0A178E7M5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-129EERLRRPQPPQQHQQHQQPQHREEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037318  Hex1_S1  
IPR001884  IF5A-like  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0045901  P:positive regulation of translational elongation  
CDD cd04469  S1_Hex1  
Amino Acid Sequences MTAVSRVRLNPNLSDDRHCWNAYAVDPLRNVVYKVPIPFSVFPSAYRNAEKSESTTVKVEGEAKVTEQASHGREGHEETHATFSATVSAPNRRDTHIKEEVRVYEEERLRRPQPPQQHQQHQQPQHREEIHIHEQTRFREPEQQRFQRSERVEFDVSRDRDTQSPLFPHLLFLDQADLPSSFSYQPPSSQSTLEVQDRTYDRHFNTVHGPATDYAPSQIDVTERQFRERTRPIVAGASYSKESFTAKHDTSPYRRQVDNVVDSRYPSSEVRVEETTRSTADAPKKYKRDMGYYDDDGHYHSFRHGISKAAHKVADRIVHPIHPHRHHHHSHEHSFPGAKYSDSREEVVVKEKFTTSAGPSQPIRPVPSSSVDKVVRVHSNTSVAPTRAPAASVARAPVRKMASPNTITIPCHHIRIGDLLILQGRPCQVIRITTSSQTGQHRYLGVDLFTKQLHEESSFISNPAPSVVVQNMLGPVFKQYRVLDIREDNRVVAMTETGDVKQGLPVLDQSGLLARLTESFDNGRGSVRILVINDDGLEMAVDYKVVHGSRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.49
3 0.49
4 0.51
5 0.46
6 0.39
7 0.34
8 0.34
9 0.29
10 0.35
11 0.32
12 0.32
13 0.32
14 0.32
15 0.32
16 0.3
17 0.3
18 0.23
19 0.27
20 0.26
21 0.29
22 0.31
23 0.3
24 0.35
25 0.36
26 0.37
27 0.38
28 0.35
29 0.34
30 0.36
31 0.38
32 0.36
33 0.38
34 0.35
35 0.32
36 0.35
37 0.34
38 0.33
39 0.38
40 0.36
41 0.35
42 0.35
43 0.33
44 0.3
45 0.31
46 0.3
47 0.22
48 0.22
49 0.2
50 0.19
51 0.22
52 0.22
53 0.2
54 0.19
55 0.23
56 0.22
57 0.26
58 0.26
59 0.23
60 0.24
61 0.27
62 0.27
63 0.25
64 0.24
65 0.21
66 0.24
67 0.23
68 0.22
69 0.19
70 0.17
71 0.17
72 0.16
73 0.18
74 0.17
75 0.25
76 0.26
77 0.32
78 0.34
79 0.33
80 0.4
81 0.42
82 0.47
83 0.5
84 0.5
85 0.48
86 0.51
87 0.5
88 0.47
89 0.43
90 0.37
91 0.35
92 0.38
93 0.4
94 0.39
95 0.43
96 0.43
97 0.47
98 0.5
99 0.5
100 0.56
101 0.6
102 0.66
103 0.69
104 0.76
105 0.79
106 0.84
107 0.86
108 0.84
109 0.84
110 0.82
111 0.75
112 0.73
113 0.67
114 0.59
115 0.53
116 0.51
117 0.51
118 0.47
119 0.45
120 0.42
121 0.44
122 0.44
123 0.48
124 0.41
125 0.35
126 0.4
127 0.43
128 0.49
129 0.55
130 0.61
131 0.58
132 0.62
133 0.63
134 0.61
135 0.6
136 0.56
137 0.5
138 0.48
139 0.45
140 0.4
141 0.43
142 0.44
143 0.41
144 0.38
145 0.35
146 0.31
147 0.31
148 0.35
149 0.32
150 0.27
151 0.28
152 0.27
153 0.29
154 0.27
155 0.26
156 0.22
157 0.2
158 0.16
159 0.14
160 0.14
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.09
169 0.1
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.19
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.23
178 0.22
179 0.25
180 0.26
181 0.23
182 0.19
183 0.23
184 0.23
185 0.25
186 0.25
187 0.26
188 0.23
189 0.3
190 0.3
191 0.27
192 0.31
193 0.31
194 0.3
195 0.25
196 0.26
197 0.19
198 0.21
199 0.19
200 0.15
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.14
209 0.21
210 0.2
211 0.23
212 0.26
213 0.27
214 0.35
215 0.38
216 0.38
217 0.34
218 0.35
219 0.33
220 0.33
221 0.32
222 0.26
223 0.21
224 0.19
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.12
229 0.12
230 0.1
231 0.14
232 0.18
233 0.17
234 0.21
235 0.25
236 0.3
237 0.35
238 0.42
239 0.45
240 0.43
241 0.43
242 0.4
243 0.41
244 0.42
245 0.42
246 0.37
247 0.33
248 0.29
249 0.29
250 0.29
251 0.24
252 0.21
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.19
260 0.17
261 0.19
262 0.17
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.16
267 0.21
268 0.27
269 0.31
270 0.38
271 0.41
272 0.42
273 0.46
274 0.43
275 0.43
276 0.41
277 0.42
278 0.4
279 0.39
280 0.4
281 0.35
282 0.32
283 0.27
284 0.24
285 0.18
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.14
291 0.13
292 0.15
293 0.18
294 0.25
295 0.28
296 0.28
297 0.3
298 0.26
299 0.28
300 0.27
301 0.29
302 0.22
303 0.23
304 0.21
305 0.22
306 0.24
307 0.29
308 0.34
309 0.35
310 0.41
311 0.43
312 0.5
313 0.52
314 0.55
315 0.58
316 0.58
317 0.58
318 0.55
319 0.5
320 0.43
321 0.41
322 0.35
323 0.29
324 0.21
325 0.17
326 0.14
327 0.18
328 0.23
329 0.23
330 0.24
331 0.22
332 0.23
333 0.24
334 0.3
335 0.26
336 0.21
337 0.2
338 0.2
339 0.19
340 0.18
341 0.19
342 0.14
343 0.2
344 0.21
345 0.24
346 0.25
347 0.26
348 0.3
349 0.3
350 0.3
351 0.25
352 0.26
353 0.24
354 0.29
355 0.31
356 0.29
357 0.34
358 0.31
359 0.31
360 0.31
361 0.33
362 0.32
363 0.29
364 0.3
365 0.24
366 0.27
367 0.25
368 0.27
369 0.26
370 0.22
371 0.2
372 0.19
373 0.19
374 0.16
375 0.16
376 0.14
377 0.13
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.2
382 0.21
383 0.21
384 0.25
385 0.25
386 0.25
387 0.28
388 0.31
389 0.34
390 0.35
391 0.36
392 0.36
393 0.35
394 0.33
395 0.32
396 0.33
397 0.27
398 0.27
399 0.25
400 0.21
401 0.2
402 0.23
403 0.22
404 0.16
405 0.15
406 0.13
407 0.15
408 0.14
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.12
413 0.11
414 0.13
415 0.13
416 0.17
417 0.21
418 0.25
419 0.27
420 0.28
421 0.31
422 0.3
423 0.34
424 0.36
425 0.36
426 0.32
427 0.32
428 0.31
429 0.29
430 0.3
431 0.26
432 0.21
433 0.19
434 0.18
435 0.18
436 0.17
437 0.16
438 0.14
439 0.14
440 0.15
441 0.14
442 0.14
443 0.15
444 0.2
445 0.2
446 0.19
447 0.19
448 0.17
449 0.16
450 0.16
451 0.14
452 0.09
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.11
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.21
466 0.2
467 0.29
468 0.33
469 0.35
470 0.35
471 0.4
472 0.44
473 0.45
474 0.46
475 0.37
476 0.34
477 0.32
478 0.27
479 0.2
480 0.16
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.13
489 0.15
490 0.14
491 0.13
492 0.14
493 0.15
494 0.15
495 0.14
496 0.13
497 0.14
498 0.14
499 0.13
500 0.12
501 0.1
502 0.11
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.17
507 0.2
508 0.22
509 0.22
510 0.22
511 0.19
512 0.21
513 0.21
514 0.2
515 0.2
516 0.19
517 0.22
518 0.2
519 0.2
520 0.18
521 0.15
522 0.14
523 0.11
524 0.1
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.11