FuNGI

A0A178ECU8

Protein Details

Accession

A0A178ECU8

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-48	TSKVRQAAKHGSRKSKGPKLDKAKCDGA	Hydrophilic
156-185	RQSSAEKKSARRNCQKWKDRRRFQSSHQAN	Hydrophilic
295-321	SERQKEKARIFQRQKRQKKRDAASRST	Hydrophilic
495-519	GFDRVRLRKDWKRWVLKRWERHPSA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-40	QAAKHGSRKSKGPKL
297-328	RQKEKARIFQRQKRQKKRDAASRSTLKGQKLK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA

Amino Acid Sequences

MSESRAAHDKAASPEAVERITSKVRQAAKHGSRKSKGPKLDKAKCDGAELDACVAMPPISNLPRQEPPEALATTLEDSTSLPDQSVTLEFGAKVADASLISSDDGSDLINTVIEPDPDSHLTLTRLKHSDRFGYTYEAEQIDTSTMFEVRVYSFGRQSSAEKKSARRNCQKWKDRRRFQSSHQANGLVYLILRYPGSPSSETISPPSTSPQRPASLLDALSKPPGWPFNMEKPLPAYHDSPMRKDLSFLELGPDAVDFTSTPPVTMPETSKTIDTDDKAHLQGVSFFYSRQEEKSERQKEKARIFQRQKRQKKRDAASRSTLKGQKLKSRAQLQPPNTYSSEHLSSSKKKRYCWSSDWYYTDQSGWVRNLVISDRGVQRRAFCYEDSPYAAVNEKELAGTKTSAEDKSALATIDSEGGTFDIYSDPVLIKKILDFLFSEDNLRRDTTLRKYMTSDGFVAVAVLAGVKQLRRFNVDVIKSACRDMESIELSKEMDGFDRVRLRKDWKRWVLKRWERHPSAMDGRPPAMRSLMRFEDREIPSAGYAEWPSLEATVKRLSNFDDWYSSRTGLVSF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.31
3	0.28
4	0.24
5	0.2
6	0.21
7	0.27
8	0.28
9	0.28
10	0.33
11	0.39
12	0.42
13	0.48
14	0.54
15	0.58
16	0.66
17	0.71
18	0.74
19	0.72
20	0.78
21	0.81
22	0.79
23	0.79
24	0.78
25	0.79
26	0.8
27	0.86
28	0.83
29	0.8
30	0.78
31	0.69
32	0.64
33	0.54
34	0.47
35	0.4
36	0.35
37	0.28
38	0.21
39	0.19
40	0.16
41	0.15
42	0.11
43	0.08
44	0.09
45	0.13
46	0.16
47	0.2
48	0.22
49	0.27
50	0.34
51	0.38
52	0.39
53	0.34
54	0.34
55	0.36
56	0.34
57	0.29
58	0.23
59	0.21
60	0.19
61	0.18
62	0.16
63	0.1
64	0.1
65	0.12
66	0.14
67	0.12
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.13
72	0.14
73	0.12
74	0.11
75	0.12
76	0.11
77	0.11
78	0.11
79	0.09
80	0.08
81	0.07
82	0.07
83	0.05
84	0.06
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.07
92	0.06
93	0.05
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.15
104	0.16
105	0.17
106	0.15
107	0.16
108	0.19
109	0.23
110	0.24
111	0.27
112	0.3
113	0.31
114	0.36
115	0.38
116	0.42
117	0.4
118	0.42
119	0.37
120	0.38
121	0.37
122	0.33
123	0.33
124	0.26
125	0.23
126	0.19
127	0.18
128	0.13
129	0.12
130	0.11
131	0.08
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.11
138	0.13
139	0.14
140	0.16
141	0.17
142	0.18
143	0.19
144	0.22
145	0.27
146	0.3
147	0.35
148	0.37
149	0.42
150	0.51
151	0.59
152	0.65
153	0.68
154	0.72
155	0.77
156	0.84
157	0.88
158	0.89
159	0.91
160	0.92
161	0.91
162	0.92
163	0.91
164	0.85
165	0.81
166	0.82
167	0.76
168	0.71
169	0.63
170	0.54
171	0.44
172	0.4
173	0.33
174	0.22
175	0.16
176	0.1
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.07
182	0.09
183	0.12
184	0.12
185	0.13
186	0.16
187	0.18
188	0.19
189	0.2
190	0.2
191	0.18
192	0.17
193	0.21
194	0.23
195	0.23
196	0.27
197	0.29
198	0.29
199	0.29
200	0.31
201	0.3
202	0.26
203	0.25
204	0.24
205	0.21
206	0.19
207	0.19
208	0.17
209	0.14
210	0.13
211	0.15
212	0.13
213	0.16
214	0.2
215	0.28
216	0.35
217	0.34
218	0.33
219	0.34
220	0.34
221	0.33
222	0.31
223	0.23
224	0.19
225	0.27
226	0.27
227	0.27
228	0.29
229	0.29
230	0.26
231	0.26
232	0.25
233	0.21
234	0.2
235	0.18
236	0.16
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.11
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.04
245	0.05
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.11
251	0.12
252	0.13
253	0.14
254	0.12
255	0.15
256	0.16
257	0.16
258	0.15
259	0.16
260	0.17
261	0.16
262	0.16
263	0.16
264	0.17
265	0.17
266	0.17
267	0.15
268	0.13
269	0.14
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.11
274	0.12
275	0.14
276	0.15
277	0.14
278	0.16
279	0.17
280	0.22
281	0.32
282	0.4
283	0.41
284	0.46
285	0.53
286	0.56
287	0.61
288	0.65
289	0.6
290	0.62
291	0.69
292	0.71
293	0.74
294	0.77
295	0.81
296	0.83
297	0.86
298	0.85
299	0.85
300	0.85
301	0.84
302	0.82
303	0.78
304	0.75
305	0.71
306	0.64
307	0.61
308	0.57
309	0.51
310	0.48
311	0.45
312	0.44
313	0.45
314	0.49
315	0.49
316	0.53
317	0.55
318	0.59
319	0.63
320	0.59
321	0.62
322	0.58
323	0.55
324	0.47
325	0.43
326	0.35
327	0.31
328	0.29
329	0.21
330	0.23
331	0.24
332	0.32
333	0.39
334	0.46
335	0.45
336	0.47
337	0.54
338	0.58
339	0.61
340	0.59
341	0.58
342	0.58
343	0.6
344	0.61
345	0.56
346	0.49
347	0.42
348	0.36
349	0.3
350	0.23
351	0.21
352	0.17
353	0.15
354	0.14
355	0.13
356	0.14
357	0.13
358	0.14
359	0.11
360	0.15
361	0.2
362	0.22
363	0.25
364	0.25
365	0.27
366	0.28
367	0.31
368	0.29
369	0.23
370	0.25
371	0.25
372	0.27
373	0.26
374	0.23
375	0.2
376	0.19
377	0.2
378	0.16
379	0.14
380	0.12
381	0.1
382	0.1
383	0.11
384	0.11
385	0.1
386	0.11
387	0.1
388	0.13
389	0.16
390	0.15
391	0.15
392	0.16
393	0.14
394	0.15
395	0.16
396	0.13
397	0.1
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.1
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.09
418	0.15
419	0.14
420	0.15
421	0.15
422	0.17
423	0.21
424	0.22
425	0.25
426	0.21
427	0.23
428	0.23
429	0.23
430	0.2
431	0.18
432	0.25
433	0.29
434	0.36
435	0.36
436	0.37
437	0.39
438	0.44
439	0.45
440	0.42
441	0.35
442	0.26
443	0.25
444	0.22
445	0.19
446	0.13
447	0.09
448	0.06
449	0.04
450	0.03
451	0.04
452	0.06
453	0.07
454	0.12
455	0.15
456	0.18
457	0.23
458	0.25
459	0.3
460	0.38
461	0.39
462	0.4
463	0.41
464	0.43
465	0.39
466	0.38
467	0.33
468	0.26
469	0.24
470	0.2
471	0.21
472	0.21
473	0.21
474	0.21
475	0.21
476	0.2
477	0.2
478	0.19
479	0.13
480	0.11
481	0.13
482	0.13
483	0.18
484	0.26
485	0.28
486	0.32
487	0.36
488	0.44
489	0.51
490	0.59
491	0.65
492	0.67
493	0.76
494	0.79
495	0.84
496	0.86
497	0.87
498	0.88
499	0.86
500	0.87
501	0.8
502	0.79
503	0.72
504	0.69
505	0.68
506	0.64
507	0.6
508	0.53
509	0.51
510	0.48
511	0.45
512	0.39
513	0.36
514	0.32
515	0.29
516	0.33
517	0.38
518	0.4
519	0.4
520	0.42
521	0.46
522	0.46
523	0.45
524	0.4
525	0.33
526	0.29
527	0.29
528	0.26
529	0.2
530	0.18
531	0.16
532	0.14
533	0.13
534	0.13
535	0.13
536	0.17
537	0.14
538	0.17
539	0.23
540	0.25
541	0.26
542	0.27
543	0.3
544	0.32
545	0.35
546	0.35
547	0.35
548	0.35
549	0.37
550	0.39
551	0.35
552	0.31

A0A178ECU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer