Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DTQ9

Protein Details
Accession A0A178DTQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-166CPLCHRPIIPGRRARRKARERPDPLPVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-159PGRRARRKARER
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 9.5, cyto 7, E.R. 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044675  RING1-like  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16473  RING-H2_RNF103  
Amino Acid Sequences MSNPHSETETSASPKSSTIVIAIVVPSVMIVVFLTLVIINRRRGGVLLPRISRADDALEKEERTKMRLDELESIIKTQHFYDWLATQKEKNPGSVTTDPICAICLDDFEDDAQVRGLRCSHAFHSHCLDEWFTRYNEYCPLCHRPIIPGRRARRKARERPDPLPVILMV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.2
4 0.16
5 0.13
6 0.12
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.07
13 0.05
14 0.05
15 0.04
16 0.03
17 0.03
18 0.03
19 0.03
20 0.03
21 0.03
22 0.04
23 0.05
24 0.09
25 0.13
26 0.15
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.2
32 0.24
33 0.29
34 0.34
35 0.34
36 0.36
37 0.36
38 0.37
39 0.33
40 0.25
41 0.21
42 0.16
43 0.18
44 0.2
45 0.21
46 0.2
47 0.22
48 0.25
49 0.22
50 0.21
51 0.21
52 0.18
53 0.21
54 0.23
55 0.24
56 0.25
57 0.26
58 0.28
59 0.26
60 0.25
61 0.21
62 0.19
63 0.17
64 0.12
65 0.11
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.16
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.21
75 0.28
76 0.27
77 0.26
78 0.24
79 0.23
80 0.29
81 0.3
82 0.29
83 0.22
84 0.23
85 0.21
86 0.19
87 0.19
88 0.12
89 0.11
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.14
107 0.17
108 0.25
109 0.27
110 0.29
111 0.34
112 0.33
113 0.32
114 0.31
115 0.3
116 0.21
117 0.23
118 0.23
119 0.18
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.26
124 0.27
125 0.26
126 0.29
127 0.36
128 0.35
129 0.37
130 0.36
131 0.37
132 0.45
133 0.51
134 0.54
135 0.56
136 0.63
137 0.71
138 0.79
139 0.81
140 0.83
141 0.85
142 0.87
143 0.89
144 0.9
145 0.87
146 0.85
147 0.85
148 0.78
149 0.68