Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EMX8

Protein Details
Accession A0A178EMX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-115RTPGHNRRRSGKIQRETPRDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-108RTPGTGRTPRGGPATRPLPSRRAAPTTPHAIRALRERANAARTPGHNRRRSGKIQ
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035425  CENP-T/H4_C  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF15511  CENP-T_C  
Amino Acid Sequences MSDSARKKQRLSPDSITNEFLNFDGYSQPSTPFRRAASAGPGPTPGSRKTPTVRTPGTGRTPRGGPATRPLPSRRAAPTTPHAIRALRERANAARTPGHNRRRSGKIQRETPRDILRDLSRALARDSRPTEPSPEEQPRRTRHSALDLPDVEDGPDPAAPRLSMALDDMYDDDSFHDAPPRQSSLPDIPDDVDGGTVQSLEYGRRAISEDPRFAYGGRYSERFADFSELGPVDEEFEIDGTFISRRGDRLLDQATDEALNEDETTTQIRALTGRRDGRPSDVDLGVFGDAEDDTEEPTFRFLIPERMRAAERDEPQEETRAEVDDQEIDEGLEDDMPVLAEDDTDDGLANAINALIDNEPSGAGGMLGWESDFEPDDDDADLAAYRGEESAIDRSLRTASPERRAAAKEAHVRKSRELRISQRGLEYPSFPVAPIKKLALSFMKSQGSKGQLGKDALAALTKTTDDFFEQIGIDLAAYANHGGRKMIEESDVIALMKRYVTFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.68
3 0.65
4 0.55
5 0.48
6 0.39
7 0.32
8 0.24
9 0.17
10 0.15
11 0.15
12 0.16
13 0.18
14 0.18
15 0.22
16 0.26
17 0.31
18 0.34
19 0.35
20 0.35
21 0.37
22 0.39
23 0.39
24 0.41
25 0.42
26 0.41
27 0.37
28 0.38
29 0.34
30 0.35
31 0.36
32 0.3
33 0.31
34 0.31
35 0.36
36 0.4
37 0.48
38 0.52
39 0.57
40 0.57
41 0.55
42 0.58
43 0.59
44 0.63
45 0.61
46 0.57
47 0.52
48 0.51
49 0.5
50 0.53
51 0.49
52 0.41
53 0.43
54 0.47
55 0.46
56 0.5
57 0.51
58 0.48
59 0.47
60 0.5
61 0.47
62 0.47
63 0.46
64 0.47
65 0.49
66 0.53
67 0.52
68 0.49
69 0.46
70 0.41
71 0.41
72 0.43
73 0.44
74 0.38
75 0.38
76 0.39
77 0.4
78 0.44
79 0.44
80 0.39
81 0.38
82 0.37
83 0.45
84 0.51
85 0.56
86 0.58
87 0.6
88 0.63
89 0.65
90 0.72
91 0.73
92 0.74
93 0.73
94 0.76
95 0.81
96 0.82
97 0.8
98 0.77
99 0.73
100 0.65
101 0.56
102 0.52
103 0.45
104 0.41
105 0.35
106 0.33
107 0.27
108 0.26
109 0.28
110 0.29
111 0.27
112 0.32
113 0.35
114 0.34
115 0.36
116 0.37
117 0.39
118 0.37
119 0.39
120 0.39
121 0.46
122 0.48
123 0.5
124 0.57
125 0.58
126 0.63
127 0.64
128 0.59
129 0.53
130 0.55
131 0.55
132 0.5
133 0.52
134 0.44
135 0.41
136 0.38
137 0.34
138 0.26
139 0.2
140 0.17
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.19
167 0.21
168 0.2
169 0.2
170 0.24
171 0.25
172 0.26
173 0.25
174 0.23
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.15
179 0.1
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.1
193 0.11
194 0.19
195 0.24
196 0.25
197 0.26
198 0.27
199 0.27
200 0.25
201 0.25
202 0.18
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.19
208 0.2
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.17
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.08
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.1
258 0.13
259 0.18
260 0.23
261 0.24
262 0.28
263 0.28
264 0.3
265 0.31
266 0.3
267 0.27
268 0.22
269 0.21
270 0.18
271 0.17
272 0.13
273 0.11
274 0.08
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.18
290 0.2
291 0.24
292 0.25
293 0.27
294 0.28
295 0.27
296 0.32
297 0.29
298 0.29
299 0.3
300 0.3
301 0.31
302 0.31
303 0.35
304 0.29
305 0.24
306 0.22
307 0.18
308 0.17
309 0.14
310 0.14
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.04
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.07
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.16
383 0.16
384 0.2
385 0.25
386 0.3
387 0.37
388 0.42
389 0.42
390 0.45
391 0.47
392 0.45
393 0.42
394 0.44
395 0.46
396 0.49
397 0.56
398 0.58
399 0.59
400 0.63
401 0.67
402 0.67
403 0.66
404 0.66
405 0.65
406 0.68
407 0.71
408 0.66
409 0.61
410 0.56
411 0.52
412 0.47
413 0.4
414 0.33
415 0.3
416 0.27
417 0.23
418 0.27
419 0.25
420 0.26
421 0.27
422 0.26
423 0.26
424 0.26
425 0.31
426 0.3
427 0.31
428 0.32
429 0.36
430 0.41
431 0.38
432 0.4
433 0.41
434 0.39
435 0.41
436 0.41
437 0.39
438 0.39
439 0.4
440 0.39
441 0.34
442 0.31
443 0.25
444 0.24
445 0.18
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.12
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.09
467 0.11
468 0.11
469 0.12
470 0.13
471 0.17
472 0.19
473 0.2
474 0.19
475 0.18
476 0.2
477 0.21
478 0.22
479 0.18
480 0.16
481 0.15
482 0.14
483 0.16